拓端tecdat|R語言在地圖上繪制月亮圖、餅狀圖數(shù)據(jù)可視化果蠅基因種群
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原文出處：拓端數(shù)據(jù)部落公眾號
月亮圖和餅圖
餅圖把一個圓分成多個部分，這些部分的弧長（以及面積）代表一個整體的比例。月亮圖也是如此，它把一個圓分成多個部分，這些部分的面積代表整個圓的比例，但在月亮圖中，這些部分被畫成圓的月牙形，就像月相。?
使用月亮圖而不是餅圖背后的動機主要是審美的選擇。還要注意的是，由于月亮圖的各部分是從圓的一側(cè)或另一側(cè)掃過的，所以一般只適合于描述一個或兩個群體。
月亮圖與Kosara（2019）1的 "圓形切片 "圖類似。在研究受試者對不同圖表類型中百分比的感知時，"圓形切片 "的表現(xiàn)與餅圖類似。月亮圖與 "圓形切片 "的不同之處在于，后者是在一個基礎(chǔ)圓上滑動第二個同樣大小的圓盤，更像是月食而不是月相。然而，兩者都依賴面積作為視覺線索。
用法
ggplot2數(shù)據(jù)可視化包，為R語言中的月亮圖提供支持。它們的繪制方式與ggplot2中的點最為相似：它們的位置由一個x和一個y坐標(biāo)定義，它們的大小與坐標(biāo)系無關(guān)，所以它們總是保持圓形。
ggplot(data.frame(x = 1:5, y = 1)) +geom_point(y = 2) +scale_size(range = c(5, 10))+
兩個新的美學(xué)在geom_moon中也很重要：比例和填充。
比例美學(xué)
比率控制要繪制的月亮的比例。它必須在0（"新月"，實際上什么都沒畫）和1（"滿月"，即一個圓）之間。
ggplot(data.frame(x = 1:5, y = 0, ratio = 0:4 * 0.25), aes(x = x, y = y),ratio = ratio), size = 20, fill = "black") +geom_text(aes(y = y + 1, label = ratio)) +
填充美學(xué)
右邊需要一個布爾值，控制月亮是 "升 "還是 "降"，也就是說，它是由右邊還是左邊 "填充 "的。
用兩種顏色制作一個 "完整 "的月亮的一種方法是用right = TRUE表示一種顏色，用right = FALSE表示另一種顏色，比例互補。
ggplot( moons) +geom(aes(x, y, ratio = ratio, right = right, fill = right)) +
圖例關(guān)鍵字
三個關(guān)鍵字，用于不同類型的圖例：默認(rèn)值，繪制一個右邊的懸臂月（見上文）。
left從左邊畫出一個新月，與長臂月互補，這對組合圖例很有用。
ggplot(aes(x, y, ratio = ratio, right = right, size = 2^x)) +geom(data = subset(moons, right)) +geom(key = left)
key畫的是一個圓。它類似于 "點 "的形狀，但計算方式略有不同，所以如果你想讓圖例月亮的尺寸和月亮的尺寸相匹配，就更合適。
ggplot(tidymoons) +geom(key = full) +
工作實例
地圖上的月亮圖
多餅圖的一個常見用途是表示地圖上不同坐標(biāo)處的比例。x和y維度已經(jīng)致力于地圖坐標(biāo)，所以像柱狀圖這樣的比例可視化就比較困難。這是一個嘗試月形圖的絕佳機會!
餅圖地圖在人口遺傳學(xué)中很流行，所以讓我們看一下該領(lǐng)域的一個例子。數(shù)據(jù)包含果蠅種群中Adh基因的兩個變體的頻率。這些種群中有許多都很接近，所以我們必須處理過度繪制的問題，我們在下面手動處理。
moonmap <- ggplot(da, aes(long, lat)) +geom_polygon(data = map_data("world"),aes(group = group),) +
如果我們想在圖例中明確標(biāo)注等位基因，那么我們需要將它們映射到一個組中，這就要求我們將數(shù)據(jù)重新排列成一個 "較長"（"整齊"）的格式。?
reshape(v.names = "percent",times = c("dhF", "dhS"),direction = "long")
月球數(shù)據(jù)
有時你只是想繪制月球的文字表述。改編自NASA的月球數(shù)據(jù)，包含了2019年每天從地球到月球的距離，以及月球四個主要階段每次出現(xiàn)的日期（UTC）。我們可以用月球圖（在這種情況下與餅圖相同）繪制這些主要階段。
ggplot(lunardist, aes(date, distance)) +geom_line() +# 將下層繪制成一個完整的圓geom(data = phase, ratio = 1, size = 5, fill = "black") +
Harvey balls哈維球分析法
"哈維球 "本質(zhì)上是用于定性比較的餅圖，通常以表格形式出現(xiàn)。我們可以使用月形圖來達(dá)到同樣的目的。
首先，讓我們獲取一些數(shù)據(jù)。
哈維月亮的圖表。
# 首先，我們將數(shù)據(jù)變化為 "長 "格式，以方便繪圖。rest <- reshape(restaurants,timevar = "Category",direction = "long")ggplot(rest, aes(0, 0)) +geom(aes(ratio = (Score - 1) / 4), fill = "black") +theme(panel.grid = element_blank()
參考文獻(xiàn)
Kosara, R. 2019. Circular Part-to-Whole Charts Using the Area Visual Cue. EuroVis 2019 - Short Papers.?https://doi.org/10.2312/evs.20191163??
Oakeshott, J.G., et al.?1982. Alcohol dehydrogenase and glycerol-3-phosphate dehydrogenase clines in?Drosophila melanogaster?on different continents. Evolution, 36(1): 86-96.??
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