艾美捷GelRed:安全,穩(wěn)定,靈敏度,你要的,都有!
GelRed是一種穩(wěn)定、安全、靈敏的核酸熒光染料,通過靜電及電荷相互作用結(jié)合到核酸上,可直接替代劇毒的溴化乙錠(EB),且靈敏度遠(yuǎn)高于EB,常用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠中dsDNA(雙鏈DNA)、ssDNA(單鏈DNA)或RNA的染色。GelRed結(jié)合單鏈DNA和RNA熒光信號(hào)約是結(jié)合雙鏈DNA的一半左右。
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經(jīng)過一系列的測(cè)試,GelRed對(duì)于手套和細(xì)胞膜都是不能穿透的。在濃度遠(yuǎn)高于凝膠染色工作濃度的情況下,染料也是無細(xì)胞毒性和非誘變性的。
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GelRed?是如何工作的?
與溴化乙錠一樣,GelRed?是一種嵌入?DNA?的核酸染料。GelRed?僅通過嵌入結(jié)合。
當(dāng)顯示紫外光時(shí),嵌入的?GelRed?會(huì)發(fā)出熒光,產(chǎn)生明亮的橙色光。 兩種產(chǎn)品的光譜幾乎相同; 然而,GelRed?被認(rèn)為是比?EtBr?更安全的替代品,而且更敏感。?GelRed?的另一個(gè)好處是它能夠與?dsDNA、ssDNA?和?RNA?一起工作,而對(duì)于?dsDNA,它的靈敏度是?ssDNA?和?RNA?的兩倍。

比較GelRed和溴化乙錠(EB)在1%瓊脂糖預(yù)制凝膠(TBE緩沖溶液)中的染色效果。使用1kb Plus DNA Ladder樣品兩倍梯度稀釋上樣,各泳道上樣量從左到右依次為200ng,100ng,50ng和25ng。使用300nm激發(fā)的凝膠成像系統(tǒng)和EB濾光片成像并使用Polaroid 667黑白打印?
如果?GelRed?是一種嵌入劑,為什么它沒有與溴化乙錠相同的風(fēng)險(xiǎn)?
如果它仍然要直接與?DNA?結(jié)合,想知道它如何才能真正安全似乎是合乎邏輯的。 雖然?GelRed?和?EtBr?都嵌入?DNA,但?GelRed?的創(chuàng)建使其不會(huì)穿透細(xì)胞膜。 因?yàn)樗荒艽┩讣?xì)胞膜,所以?GelRedTM?對(duì)活細(xì)胞沒有毒性。
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GelRed:用于聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)的核酸凝膠染色劑
原始的GelRed?染料的安全性部分得益于其較大的分子尺寸,這使得該染料對(duì)于細(xì)胞膜具有不可滲透性。然而,這種大分子尺寸也會(huì)降低GelRed??染料進(jìn)入密集的聚丙烯酰胺凝膠的能力。為了解決這個(gè)問題,Biotium采用了一種新方法,使得新版本的PAGE GelRed?染料具有細(xì)胞膜不可滲透性,而不會(huì)使其分子尺寸過大
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PAGE GelRed?核酸凝膠染料:
? 一種安全而敏感的聚丙烯酰胺凝膠染料
? 在AMES試驗(yàn)中無毒性和無致突變性
? 水基配方,不滲透乳膠和丁腈手套
? 對(duì)水生生物無毒,可由EPA Title 22危險(xiǎn)廢物測(cè)試進(jìn)行排放處置。
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為什么?GelRed?會(huì)改變?DNA?的遷移?
GelRedTM?影響?DNA?遷移的原因有很多。 請(qǐng)記住,所有核酸染料都會(huì)對(duì)?DNA?的移動(dòng)方式產(chǎn)生一定的影響。?GelRedTM?是一種比?EtBr?重得多的染料,GelRed?對(duì)?DNA?的親和力意味著凝膠中加載的?DNA?越多,GelRedTM?與?DNA?結(jié)合并扭曲該片段的運(yùn)動(dòng)的次數(shù)就越多。
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一些防止或最小化?GelRed對(duì)遷移影響的建議是: 將其用作后染色劑(我們對(duì)此再強(qiáng)調(diào)不過分)。 確保您的?GelRed?儲(chǔ)備溶液已適當(dāng)稀釋。 您可能還需要減少您使用的?DNA?量,以盡量減少遷移干擾的影響。
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GelRed?和?GelGreen?有什么區(qū)別?
1.每種產(chǎn)品的熒光。 如您所料,GelRed?會(huì)發(fā)出類似于溴化乙錠的紅色熒光。GelGreen?會(huì)發(fā)出與?SYBR Green?非常相似的綠色熒光。 任何一種產(chǎn)品都可以與紫外線透射儀一起使用。
2.染色敏感性。?GelRed?是一種比?GelGreen?更敏感的染色劑(靈敏度大約是?GelGreenTM?的五倍),尤其是對(duì)于單鏈核酸。
3.在應(yīng)用方面,GelRed與聚丙烯酰胺凝膠兼容,但不推薦用于?GelGreen。
4.使用?GelGreen?的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是它與藍(lán)光透射儀的兼容性,如果您想避免紫外線照射,這將很有幫助