奧斯曼軍隊(duì)在馬耳他島的失敗最常被詬病的就是陸海不和導(dǎo)致的指揮作戰(zhàn)與協(xié)同問(wèn)題，事實(shí)上也確實(shí)如此，皮雅利的軍種主義導(dǎo)致了許多問(wèn)題。

? ?從本源入手，馬耳他顯然不同勒班陀，這是一場(chǎng)兩棲登陸艦的奪島作戰(zhàn)，因此陸軍是最主要的作戰(zhàn)力量，海軍則承擔(dān)著重要的力量投送的作用。可謂相輔相成，缺一不可。

? ? ?此戰(zhàn)奧斯曼海軍最重要也是最核心的要義就是幫助陸軍奪島，從運(yùn)輸陸軍到火力掩護(hù)等等莫不如此。對(duì)于海軍而言，首要任務(wù)就是掩護(hù)陸軍安全登陸，當(dāng)然他們的對(duì)手——醫(yī)院騎士團(tuán)的海軍能力不可能在海上對(duì)龐大的奧斯曼海軍發(fā)動(dòng)進(jìn)攻。其次醫(yī)院騎士團(tuán)的陸軍也不可能在灘頭擊敗同樣龐大的,數(shù)倍于他們的奧斯曼軍隊(duì)。騎士團(tuán)最終選擇的，也是他們唯一能選擇的，就是堅(jiān)守在早已多次準(zhǔn)備加固的棱堡之中，盡可能的給予敵軍殺傷，并且等待來(lái)自西西里的援軍。 其次作為海軍上一任務(wù)的一體兩面，阻止馬耳他的求援以及來(lái)自西西里援軍的登陸，就成了同樣重要的任務(wù)，當(dāng)然我們可以從整場(chǎng)戰(zhàn)役中看出，這點(diǎn)奧斯曼海軍做的并不好，尤其是未能阻止援軍在北方海灣的登陸，這對(duì)已經(jīng)是強(qiáng)弩之末的奧斯曼軍隊(duì)來(lái)說(shuō)是士氣和戰(zhàn)斗意志上的一次巨大打擊，直接導(dǎo)致了最終的撤退。其余項(xiàng)重要的就是海軍對(duì)陸軍攻擊的輔助炮火掩護(hù)，這一點(diǎn)皮雅利的海軍做的同樣乏善可陳。大圍攻一書(shū)中記錄了圖爾古特剛來(lái)是，皮雅利試圖讓他的海軍作秀，然而卻并未取得良效。

? ? 回到奪島作戰(zhàn)本身，在戰(zhàn)斗意志上，醫(yī)院騎士團(tuán)及馬耳他島的居民們展現(xiàn)出了巨大的抵抗意志。在這方面他們達(dá)到了超常發(fā)揮的水準(zhǔn)。而奧斯曼軍隊(duì)，同樣展現(xiàn)出了巨大的戰(zhàn)斗意志。但在這一戰(zhàn)上顯然遜色于他們的對(duì)手。此戰(zhàn)奧斯曼不斷有人投敵變節(jié)，這是正常的，奧斯曼軍隊(duì)的成分極為復(fù)雜，更多人甚至依然保持著基督教信仰。而在那時(shí)的地中海戰(zhàn)爭(zhēng)，背教者與左右橫跳者屢見(jiàn)不鮮。而醫(yī)院騎士團(tuán)和馬耳他居民，在巨大的戰(zhàn)斗意志與殊死決戰(zhàn)的決心下鮮有人投敵。

? ? ? ?而在奧斯曼軍隊(duì)的指揮問(wèn)題上，這是歷來(lái)最受人詬病的，就是皮雅利與穆斯塔法之間的指揮問(wèn)題。事實(shí)上，皮雅利對(duì)整個(gè)戰(zhàn)役進(jìn)程的錯(cuò)誤就在于：他出于軍種主義的問(wèn)題，千方百計(jì)的以保護(hù)海軍艦隊(duì)的安危為整個(gè)思考的方向，而不是在作戰(zhàn)協(xié)同層面輔助陸軍奪島。他在政治上的地位使得穆斯塔法不能無(wú)視他的意見(jiàn)，于是，進(jìn)攻圣艾摩堡壘的決策就此落成，而目的是出于保護(hù)海軍艦隊(duì)，使其擁有一個(gè)安全的錨地，這又是建立在一個(gè)錯(cuò)誤的認(rèn)知上的：即5月的馬耳他依然會(huì)有對(duì)海軍不利的惡劣天氣。這一差之毫厘最終導(dǎo)致了對(duì)圣艾摩堡壘的代價(jià)巨大的謬以千里的攻勢(shì)圖爾古特的到來(lái)是一個(gè)利好，作為一位八十多歲且德高望重的老海盜，他數(shù)次到過(guò)馬耳他，他的存在可以有效彌合二者的分歧。但仍然存在兩個(gè)問(wèn)題：他本人在進(jìn)攻圣艾摩堡壘的作戰(zhàn)行動(dòng)開(kāi)始之后菜到馬耳他，其二最終他戰(zhàn)死在了進(jìn)攻圣艾摩堡壘的作戰(zhàn)行動(dòng)中。