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【活動repo】TechX2020 計算生物學(xué)+生物信息 BioX

2020-09-08 17:03 作者:呆毛菜  | 我要投稿

8.5-8.17 上海環(huán)普云創(chuàng)國際科技園

TechX2020是我上大學(xué)以來最夢幻的一段日子。

太長不看版:計算生物的3位老師都教得非常好,AL學(xué)術(shù)領(lǐng)袖很強,同學(xué)很好,值得一去。

1. 極限報名

我其實從TechX第一屆開始就在關(guān)注它,可是遲遲不敢確定TechX到底是上??萍即髮W(xué)隨手玩玩的騙錢組織還是真的有成效的夏令營。直到今年,TechX終于不再局限在計算機領(lǐng)域,而是新開了BioX,DesignX,HumanityX。

BioX里的生物信息看起來真的很吸引人,從測序的原理流程到蛋白質(zhì)模型軟件的學(xué)習(xí),千變?nèi)f化的生物世界對我堪堪展露。正如我之前的視頻里寫的,我雖然也是CASB專業(yè),但并不確定走哪一個方向。于是我決定先去TechX看看,Bioinfo和Computational Bio真的適合我嗎?

在報名截止前的一周,我扯上一樣糾結(jié)的兩個大學(xué)同學(xué),匆匆交了¥14210的學(xué)費,開始了我水深火熱的預(yù)習(xí)。

Computer Science計算機相關(guān)課程(漏了全棧開發(fā)WebDev)
BioX生物相關(guān)課程
DesignX相關(guān)課程

2. 預(yù)習(xí)材料?

報名之后,我才發(fā)現(xiàn)線下的Bioinfo課程只有7位同學(xué),與5位助教/AL學(xué)術(shù)領(lǐng)袖和3位老師形成了1:1的VIP師生比。這其實非常必須的,因為預(yù)習(xí)材料真的太多了:

四大模塊:Python和BioPython,R語言與統(tǒng)計,基因與蛋白質(zhì)生物知識,機器學(xué)習(xí)模型。每一個模塊大概都有很多要求和選修的閱讀,都有一個新的軟件/語言要學(xué)習(xí)。如果沒有CS基礎(chǔ)的話,預(yù)計每天要按正常學(xué)校的強度學(xué)習(xí)才能完成(一共26個閱讀鏈接)。

每個模塊是一周的預(yù)習(xí)期,周末還有小測。當(dāng)然,如果只是摸魚,你完全可以考2/10分,并不會影響你去參加夏令營。如果只是些許沒學(xué)懂也不用著急,上課的時候老師都會加深講解的。

3. 開營/House

8.5晚上的開營儀式充滿著意識流中二戲劇和太空探索的風(fēng)味。區(qū)分場地的“地球/飛船”,各個House學(xué)院或是希臘勇士/或是2001太空漫游/或是EVA的宣傳視頻,太空通訊器式的HL學(xué)院領(lǐng)袖介紹,在一片漆黑中,幽幽的冷色藍(lán)光從舞臺中央的控制臺升起,開啟了我的TechX之旅。

我的HouseAchilliecia,一個靈感來自阿喀琉斯的學(xué)院,勇敢是我們的共同品質(zhì)(于是用學(xué)院經(jīng)費訂做了一個金屬盾牌)。HL是三屆的老學(xué)員了,特別nice,各種游戲都很能發(fā)動大家一起參與,茶話會很溫馨,也會幫助大家冥想復(fù)盤。每個House還會有3個AL,經(jīng)常會和我們一起玩游戲,如果選同一個課,關(guān)系就更好了。我真的很感動這個“請奶茶最多的學(xué)院”。

Achilliecia今年的牌子,設(shè)計師真的很厲害。圖源:BV1gk4y1y7Cf

4. 主課程Bioinfo

生物信息和計算生物課程是唯一一門有3位教授的課程。三位教授都來自上??萍即髮W(xué)的生物/信息系。張力燁教授,鄭杰教授,趙素文教授都非常風(fēng)趣,講課很生動,上手的practice也很多。在把課程高度濃縮的同時,調(diào)理邏輯很順暢,就算是剛剛學(xué)了AP生物或者AL生物都可以聽懂。

主要的課程也是分成三部分:DNA/RNA/蛋白測序原理,機器學(xué)習(xí)和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在生物的應(yīng)用,蛋白質(zhì)測序矩陣和結(jié)構(gòu)預(yù)測

聽起來有點太難了,不過實際上還是有照顧到大家的進度。主要是學(xué)會思考的流程和一些軟件的應(yīng)用,并且介紹了許多實用的數(shù)據(jù)庫或者提供線上分析工具的網(wǎng)站,比如UniProt,EBI的BLAST。不過今年的作業(yè)的確比較困難,常常要占用課后時間,難以在下午的office hour解決。

一串TechX里使用的軟件

5. 選修課與Seminar/嘉賓講座

TechX的選修課一般以4天為單位,一共有兩次機會。有學(xué)術(shù)性的數(shù)學(xué)哲學(xué),邏輯入門,有實用性的小程序開發(fā),LaTeX使用,也有娛樂健身性的舞蹈合唱,都由激情滿滿的AL教學(xué)。這些選修課也常常能為最后的Capstone Hackathon提供靈感,也讓你充分地與其他課的同學(xué)混合,尋找潛在隊友。

TechX的Seminar由AL分享自己的特長或者學(xué)識。我最喜歡的兩節(jié)是“藥物的發(fā)現(xiàn)和未來”與“RPGmakerMV游戲制作入門”。各個AL或許對這個領(lǐng)域情深意切能夠向你成功安利,或許在此浸淫多年實習(xí)豐富,總能帶來多維度的觀察。

TechX還有每天的嘉賓講座,比如Raven Kwok的“創(chuàng)意編程與投影投射”與王琦的“新基建概念下后10年投資創(chuàng)業(yè)的機會”。他們帶來的超出我們在象牙塔中純粹的學(xué)習(xí),而是更多與社會發(fā)展相關(guān)的,產(chǎn)業(yè)相關(guān)的見識。

6. Capstone Hackathon

完成了9天的高強度學(xué)習(xí),TechX以一個全員的Capstone Hackathon黑客松結(jié)束。今年的Hackathon分成了4個賽道,軟件,硬件,游戲,設(shè)計。這四個賽道都要在24小時之內(nèi),產(chǎn)出一個產(chǎn)品,而第5個學(xué)術(shù)賽道則是動手實驗與文獻閱讀,產(chǎn)出一篇文章與一次poster匯報。

雖說是限時24小時,但想法的形成,整體的統(tǒng)籌都是早早開始了。對于我的隊員們,還要多加一項,從0開始學(xué)習(xí)小程序設(shè)計與后端的數(shù)據(jù)庫建設(shè)。在上課的9天里,我們有3次和AL的cafe約談,可以提問技術(shù)或者產(chǎn)品形象包裝,有2次milestone匯報,可以整理思路確定時間表。

可以說我們隊有50%都是依靠指導(dǎo)員AL和各個技術(shù)AL給我們理清思路,明確需求,指導(dǎo)技術(shù)文檔才能完成的。在短短的24小時里,作為項目管理的我,一共填了10次AL的幫助需求表,白板上的流程圖改了又改三四版。

改來改去的各個代碼版本和UI

但這一切,在我們凌晨四點溜到天臺看見那輝煌的日出時,都是值得的。

疲憊的Hackathon之后,休息一晚,第二天就是presentation匯報演講。第一輪是各個AL串場到各個小組單獨介紹,第二輪是決賽隊伍對全體AL的大型presentation。這一段主要靠大家的口才和產(chǎn)品的互動完成性。保持一個比較完整的開發(fā)日志,或者說迭代的思路會對最后的匯報很有幫助。根據(jù)你的匯報和產(chǎn)品,最終的結(jié)營儀式會頒發(fā)一二三等獎和創(chuàng)新獎等。

天臺人物剪影

7. 尾聲

結(jié)營儀式是一個非常感動的時刻,每個House都有自己的vlog。一起回憶起這段仿佛與世隔絕的桃花源生活,大家的熱情和對科技向善的希望令我難以忘懷。希望下一年,再聚。

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