1949年，新中國成立，結(jié)束了長期的戰(zhàn)爭，各項工作百廢待興。為了發(fā)展國家經(jīng)濟(jì)，大規(guī)模開展基本建設(shè)，開始推進(jìn)黃河水利工程，為黃河流域考古工作開辟廣闊的發(fā)展道路。夏鼐和安志敏等考古學(xué)家?guī)ьI(lǐng)年輕人在黃河沿岸開展工作，全國性考古大會戰(zhàn)即將拉開帷幕。

1949年至1953年，黃河水利委員會經(jīng)過勘查和論證，計劃在陜縣修建三門峽水利工程。1953年深秋，安志敏率領(lǐng)隊伍乘坐火車，前往河南省陜縣進(jìn)行考古調(diào)查。即將到達(dá)火車站時，他從車窗向外望去，看見南壁的斷崖上暴露許多袋狀灰坑。以此為線索，在實地調(diào)查，發(fā)現(xiàn)廟底溝遺址。

1955年10月，在中國科學(xué)院考古研究所主持之下，新成立的黃河水庫考古工作隊再次來到三門峽庫區(qū)。他們對廟底溝遺址進(jìn)行勘查，遺址面積較大，文化遺存豐富，決定進(jìn)行發(fā)掘，開始“大會戰(zhàn)”。

1956年9月30日，在安志敏負(fù)責(zé)下，廟底溝遺址的發(fā)掘拉開序幕。發(fā)掘工作分為兩個階段：1956年9月30日至12月6日，1957年3月26日至7月25日。總共發(fā)掘280個探方，揭露面積4480平方米，清理仰韶文化灰坑168個、房址2座、墓葬1座，廟底溝二期文化房址1座、灰坑26個、窯址1座、墓葬156座，以及一批東周至漢唐文化時期遺跡。

通過這次田野考古發(fā)掘工作，命名了兩種考古學(xué)文化類型：仰韶文化廟底溝類型和廟底溝二期文化。廟底溝類型是仰韶文化中期的一個類型，因為首先在廟底溝遺址發(fā)現(xiàn)而得名，分布的范圍遍及中原，延續(xù)時間達(dá)千年之久；廟底溝二期文化介于仰韶文化廟底溝類型和龍山文化之間，具有從仰韶文化向龍山文化過渡的性質(zhì)，為中國遠(yuǎn)古文化的發(fā)展淵源提供了線索。

1959年9月，中國社會科學(xué)院考古研究所主編的《廟底溝和三里橋》正式出版，成為新中國第一部新石器時代考古報告，中國新石器時代考古的一個里程碑，中國古代文化連續(xù)發(fā)展的標(biāo)桿之作。

2002年初，國道310線城區(qū)段急需拓寬，從廟底溝遺址北部邊緣穿過。2002年5月，經(jīng)過國家文物局批準(zhǔn)，河南省文物考古研究院、三門峽市文物考古研究所、鄭州大學(xué)文博學(xué)院等單位聯(lián)合對廟底溝遺址進(jìn)行第二次大規(guī)模發(fā)掘。

這次發(fā)掘共開探方222個，發(fā)掘面積達(dá)到18000平方米，發(fā)現(xiàn)仰韶文化廟底溝類型、西王村類型和廟底溝二期文化保存較完好的房址10多座、灰坑800多座、陶窯20座、墓葬1座、壕溝3條等。同時，還發(fā)掘清理200多座唐宋元明時期的墓葬。

廟底溝遺址第二次發(fā)掘規(guī)模大、發(fā)現(xiàn)多、收獲豐，在全國考古發(fā)掘中極為罕見，在學(xué)術(shù)研究上也有重要意義。通過這次考古發(fā)現(xiàn)：在仰韶文化廟底溝類型時期，廟底溝遺址已經(jīng)初步形成聚落結(jié)構(gòu)，形成一個擁有天然和人工“雙城壕”的氏族部落。

廟底溝遺址第二次考古發(fā)掘得到國內(nèi)專家和學(xué)者的廣泛關(guān)注，許多省內(nèi)外同行來到遺址交流學(xué)習(xí)，一些外國學(xué)者也紛至沓來參觀考察。同時，跟全國各地科研院校合作，利用最新的自然科學(xué)技術(shù)，解決廟底溝遺址田野考古發(fā)掘問題，涉及環(huán)境考古、植物考古、動物考古、碳十四年代測定、化學(xué)成分及物質(zhì)結(jié)構(gòu)分析等方面。

2021年10月17日，仰韶文化發(fā)現(xiàn)暨中國現(xiàn)代考古學(xué)誕生100周年紀(jì)念大會在三門峽市舉行，充分肯定百年來我國考古工作取得的成就，并且對廣大考古工作者提出了殷切希望。同時，凝結(jié)著廟底溝遺址第二次考古工作者汗水和智慧結(jié)晶的《三門峽廟底溝》正式出版，不僅是廟底溝遺址發(fā)掘材料的整理，也是對中國考古百年的紀(jì)念與獻(xiàn)禮。

新中國成立以來，仰韶文化研究推陳出新，幾代考古工作者傾注了巨大的熱情，廟底溝遺址的考古發(fā)掘是最為豐碩的成果之一。未來，考古人還要繼續(xù)努力，不斷在拓荒和建設(shè)中，孜孜不倦地構(gòu)建中國新石器時代體系和中華文明起源發(fā)展的歷史脈絡(luò)。