熒光標(biāo)記是將熒光基團(tuán)共價(jià)連接到蛋白、核酸等分子上的過程。通過了熒光染料上的特定基團(tuán)，與需要識(shí)別的分子物質(zhì)上的特定基團(tuán)反應(yīng)，從而完成其標(biāo)記過程，利用標(biāo)記物的熒光特性，來提供被檢測(cè)對(duì)象的信號(hào)。熒光標(biāo)記物種類多、標(biāo)記方法靈活，可應(yīng)用于多種生物大分子以及藥物的檢測(cè)。

其中常用的熒光染料之一的花菁染料，也叫CY（Cyanine）染料是一種常見的熒光化合物，也是一種多甲川染料的衍生物。它是由兩個(gè)氮原子為雜環(huán)核組成的，且具有熒光穩(wěn)定、多聚次甲基橋鏈化學(xué)結(jié)構(gòu)、摩爾吸收系數(shù)大和熒光量子產(chǎn)率高等優(yōu)點(diǎn)。用于標(biāo)記生物分子例如DNA和蛋白質(zhì)，比較常見的花菁染料有CY3、CY5、CY7和Sulfo-CY3、sulfo-CY5、sulfo-CY7

另一種常用的是異硫氰酸熒光素（FITC）標(biāo)記，異硫氰酸熒光素（FITC）具有永久性標(biāo)記生物分子的獨(dú)特檢測(cè)性能，可用于檢測(cè)或跟蹤共軛物與其他生物分子的相互作用。FITC的異硫氰酸酯能與蛋白質(zhì)或抗體的伯胺基發(fā)生反應(yīng)，帶有NH2基團(tuán)的小分子藥物均可用FITC進(jìn)行熒光標(biāo)記。異硫氰酸熒光素（FITC）吸收和發(fā)射波長分別是495nm和520nm。

相關(guān)材料案例有：

卵清蛋白-cy7

Plga-cy5/cy5.5/cy3/FITC/RB

DSPE-PEG-CY3

DSPE-PEG-CY5

DSPE-PEG-CY5.5

DSPE-PEG-FITC

DSPE-PEG-RB

DHA-CY5

DPA-CY3

cy7-PEG2000-SH

APC-cy7-peg2000-biotin ?

CY5標(biāo)記槲皮素-鐵

SH-PEG2000-Cy7

CLS-PEG2000-FITC 膽固醇聚乙二醇FITC

FITC-PEG2000-NH2

3-氨丙基三乙氧基硅烷-FITC

HA700K分子量-FITC

FITC-Glucose 熒光素標(biāo)記葡萄糖

FITC-Lactoferrin；熒光素標(biāo)記乳鐵蛋白

FITC-二硫鍵-FITC

葡聚糖4000-fitc

PLL-FITC 熒光素標(biāo)記聚賴氨酸

FITC標(biāo)記反油酸