慢病毒感染效率低怎么辦?
確實(shí),如果慢病毒的感染效率差,會極大影響基因調(diào)控效果,這感染的第一步就困難重重,更別提后續(xù)的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)了。
小恒這就來支招,幫你避雷。
首先確認(rèn)你的細(xì)胞是否適合用慢病毒感染
雖然說慢病毒適用于大部分細(xì)胞系,例如肝細(xì)胞、心肌細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞等,但也有一些細(xì)胞并不適用,這需要事先查閱文獻(xiàn),或咨詢漢恒的技術(shù)人員,也可以申請病毒的試用裝進(jìn)行測試。
第二確認(rèn)收到的病毒活性
也就是要確保慢病毒進(jìn)行了正確的存儲和稀釋。慢病毒是存儲在-80℃的,如果計(jì)劃在收到慢病毒的一周內(nèi)就使用,也可放在4°C保存;解凍病毒一定要在冰上進(jìn)行,避免反復(fù)凍融,有必要可以先進(jìn)行分裝。如果病毒存儲不當(dāng)或反復(fù)凍融會降低病毒滴度/活性,-80℃保存半年以上需要重新測滴度。
第三:維持良好的細(xì)胞狀態(tài)及感染前合適的細(xì)胞接種量
良好的細(xì)胞狀態(tài),是一切實(shí)驗(yàn)開始的前提。如果遇到支原體或是其他污染,影響了細(xì)胞狀態(tài),則會大大影響其感染效率。在進(jìn)行針對性的防治后再開始感染實(shí)驗(yàn)。
感染時(shí)的細(xì)胞密度過高或者過低都會影響感染效率,根據(jù)細(xì)胞增殖的速度調(diào)整細(xì)胞接種量,以保證在感染后3天左右細(xì)胞剛好快長滿培養(yǎng)皿底部為宜。
針對大部分細(xì)胞系:傳代周期在2~3天,感染時(shí)細(xì)胞鋪板的密度保持在30~50%左右
針對某些原代細(xì)胞:由于細(xì)胞增長緩慢,可以在接種時(shí)提高匯合度到70~80%左右
針對非分裂細(xì)胞:如神經(jīng)元細(xì)胞,接種后不再增殖,此時(shí)可以按照100%的匯合度進(jìn)行接種。
第四:正式感染先預(yù)實(shí)驗(yàn),進(jìn)行MOI的摸索
MOI(MultiplicityofInfection,感染復(fù)數(shù))是指每個(gè)細(xì)胞感染的病毒數(shù),通常MOI越高,病毒整合到染色體的數(shù)量以及目的蛋白的表達(dá)量越高。
舉個(gè)例子,取MOI=3、10、30、100,根據(jù)操作說明,將換算好體積的病毒液加入細(xì)胞中。
每孔加病毒量(μl)=MOI*細(xì)胞數(shù)/滴度(TU/ml)×1000
感染3-4天后,觀察熒光表達(dá)情況,通過細(xì)胞感染效果,確認(rèn)目的細(xì)胞的感染條件和感染參數(shù)。
第五:加助轉(zhuǎn)染試劑
以上的問題都避雷了,那最簡單的方法就是可以加入助轉(zhuǎn)染試劑polybrene來提升效率。
Polybrene是帶正電的小分子,與細(xì)胞表面的陰離子結(jié)合, 通常加入polybrene能提高感染效率10~30%。但要注意Polybrene有一定的細(xì)胞毒性,有的細(xì)胞對Polybrene的毒理反應(yīng)明顯,因此細(xì)胞是否適合Polybrene需要摸索。
第六:對于一些難感染細(xì)胞的感染方法
如果你的細(xì)胞本身難以感染,例如懸浮細(xì)胞,可使用平角離心轉(zhuǎn)染法(低速(200′g)離心1h,然后放入培養(yǎng)箱中正常培養(yǎng)即可)。若由于實(shí)驗(yàn)條件有限,沒有平角離心機(jī),可用離心管代替。
其他一些較難感染的細(xì)胞可進(jìn)行二次感染(即感染24h后,更換新鮮病毒進(jìn)行二次感染),可顯著提升感染效率。
以上的問題都考慮到了,小恒相信你的細(xì)胞感染一定可以達(dá)到預(yù)期。