研究思路文章參考：

中文標(biāo)題：Fraxinellone 通過(guò)氧化應(yīng)激和轉(zhuǎn)運(yùn)途徑誘導(dǎo)斑馬魚(yú)的肝毒性

研究對(duì)象：斑馬魚(yú)

發(fā)表期刊：molecules

影響因子：4.411

發(fā)表時(shí)間：2022年4月

合作單位：中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所

運(yùn)用生物技術(shù)：氨基酸靶向代謝組學(xué)

2022年4月，中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所靳洪濤、王素娟課題組在molecules發(fā)表的題為“Fraxinellone Induces Hepatotoxicity in Zebrafish through Oxidative Stress and the Transporters Pathway”（IF:4.411）的研究成果，通過(guò)氨基酸靶向代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了斑馬魚(yú)肝損傷的氨基酸水平變化特征，探究了Fraxinellone致斑馬魚(yú)肝毒性的機(jī)制，為防治藥物性肝損傷提供了理論依據(jù)。

本研究為探究藥物性肝損傷的毒性途徑和代謝標(biāo)志物，本文從肝細(xì)胞受到損傷，氨基酸代謝會(huì)發(fā)生紊亂角度出發(fā)，綜合氨基酸代謝組學(xué)結(jié)果，探討斑馬魚(yú)肝毒性機(jī)制，為防治藥物性肝損傷提供理論參考。

進(jìn)階思路：5-10分文章的研究思路

相比于小于5分的文章，著一梯度的文章要有升級(jí)和進(jìn)階的看點(diǎn)：表現(xiàn)為樣本量更大+特殊的疾病+復(fù)雜樣本（比如外泌體的代謝物、腫瘤小鼠模型的代謝物等）。第二大方向是代謝組學(xué)與其它基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)或組學(xué)技術(shù)聯(lián)合分析，再涉及到多組學(xué)分析的環(huán)節(jié)，把課題聯(lián)合分析做完善是關(guān)鍵。

研究思路文章參考：

中文標(biāo)題：人參固本對(duì)甲狀腺素毒癥小鼠的抗衰老作用：改善免疫衰老、低蛋白血癥、脂毒性和腸道菌群

研究對(duì)象：小鼠

發(fā)表期刊：Frontiers in Immunology

影響因子：8.786

發(fā)表時(shí)間：2022年10月25日

合作單位：魯南制藥集團(tuán)，山東大學(xué)齊魯醫(yī)院

運(yùn)用組學(xué)技術(shù)：流式細(xì)胞技術(shù)、蛋白質(zhì)組學(xué)，糞便代謝物學(xué)、植物代謝組學(xué)和微生物組學(xué)，其中蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)由鹿明生物提供檢測(cè)和支持服務(wù)。

2022年10月25日，魯南制藥聯(lián)合山東大學(xué)在 Frontiers in Immunology期刊發(fā)表的題為?“The anti-aging effects of Renshen Guben on ?thyrotoxicosis ?mice:? Improving ?immunosenescence, hypoproteinemia, lipotoxicity, and intestinal flora”的研究成果，魯南制藥集團(tuán)馮芹博士為第一作者，魯南制藥集團(tuán)張貴民研究員和山東大學(xué)齊魯醫(yī)院劉德山教授為共同通訊作者。研究采用流式細(xì)胞技術(shù)、蛋白質(zhì)組學(xué)，糞便代謝物學(xué)、植物代謝組學(xué)和微生物組學(xué)等研究方法，研究人參固本（RSGB）口服液對(duì)甲狀腺毒癥加速衰老小鼠模型的影響。

本研究采用常規(guī)檢測(cè)方法結(jié)合多組學(xué)技術(shù)，研究人參固本（RSGB）口服液對(duì)甲亢加速衰老小鼠模型的影響。對(duì)于血液和血清，文章采用了流式細(xì)胞確定免疫衰老表型，采用生化檢驗(yàn)和蛋白組學(xué)確定脂質(zhì)的代謝變化。采用植物代謝組學(xué)解析特有代謝產(chǎn)物。文章還利用關(guān)聯(lián)分析技術(shù)，挖掘和歸納作用機(jī)制。文章為中藥的現(xiàn)代化研究提供路線，為中藥的臨床應(yīng)用價(jià)值挖掘提供思路，值得借鑒和推廣。

頂刊思路：＞10分文章的研究思路

這個(gè)階段的文章內(nèi)容涉及面廣、技術(shù)多，還有新穎性。單靠代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)，除非是發(fā)明了一種新的實(shí)驗(yàn)方法、開(kāi)發(fā)了一套新的分析流程，否則很難發(fā)表在這個(gè)檔次內(nèi)。

所以涉及的方向一般都是多組學(xué)或者多種技術(shù)聯(lián)合。經(jīng)常用到的組合有代謝組+16S；代謝組+宏基因組；代謝組+轉(zhuǎn)錄組；代謝組+蛋白組；代謝組+微生物組學(xué)+蛋白組等等。

研究思路文章參考：

中文標(biāo)題：腸道菌群衍生物支鏈氨基酸在帕金森病發(fā)病機(jī)制中的作用：動(dòng)物研究

研究對(duì)象：小鼠

發(fā)表期刊：Brain Behavior and Immunity

影響因子：19.227

發(fā)表時(shí)間：2022年09月

合作單位：哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院

運(yùn)用組學(xué)技術(shù)：氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、16S rRNA基因測(cè)序

2022年9月，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院姚麗芬教授課題組（一作：閆珍珍）在Brain Behavior and Immunity期刊發(fā)表了題為?“Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果，通過(guò)氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測(cè)序研究方法，發(fā)現(xiàn)了腸道微生物群代謝的動(dòng)態(tài)變化特征，探究了BCAAs調(diào)節(jié)PD的機(jī)理，描繪了BCAAs影響腸道微生物群和炎癥因子圖譜，為帕金森疾病的深入研究提供了理論依據(jù)。

研究通過(guò)氣相色譜-質(zhì)譜法、免疫學(xué)、GC-MS靶向代謝組學(xué)、微生物16S rRNA基因測(cè)序方法，發(fā)現(xiàn)腸道微生物群和支鏈氨基酸（BCAAs）代謝的動(dòng)態(tài)變化，可緩解改善PD的發(fā)病癥狀，即高BCAAs飲食通過(guò)調(diào)節(jié)炎癥水平而改善PD，為PD的深入研究提供了新策略和新方向。

綜合以上三個(gè)案例，通過(guò)豐富群體樣本、探索遺傳進(jìn)化中性狀差異機(jī)制、關(guān)鍵基因位點(diǎn)驗(yàn)證等步驟，完善研究思路，可以實(shí)現(xiàn)從常規(guī)、進(jìn)階到頂刊思路的提升。其中，發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證核心基因是關(guān)鍵，在這個(gè)關(guān)鍵步驟中，可以結(jié)合多組學(xué)手段（表型-代謝物-基因）鎖定候選基因，運(yùn)用多種驗(yàn)證方式解釋重要基因功能。

通過(guò)轉(zhuǎn)錄組與代謝組聯(lián)合分析，既能得到大量差異表達(dá)基因和調(diào)控代謝通路，又可以通過(guò)代謝物將基因與表型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，從多個(gè)層面解析關(guān)鍵的代謝通路或基因，全面地研究生物分子功能和調(diào)控機(jī)制。

詳細(xì)技術(shù)請(qǐng)?jiān)L問(wèn)鹿明生物官網(wǎng)

?

百度搜索鹿明生物（lumingbio）

?

了解更多多組學(xué)技術(shù)

（代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)、非靶向代謝組學(xué)、GC-MS、LC-MS）

猜你還想看

1、Cancer Res | 轉(zhuǎn)錄組+空間代謝組學(xué)探究斑馬魚(yú)脂肪酸清除和甘油磷脂代謝為黑色素瘤治療提供新思路

2、好文悅讀 | 熱心“腸”動(dòng)態(tài)，空間代謝組學(xué)技術(shù)助力炎癥性腸炎療法開(kāi)發(fā)新策略

3、項(xiàng)目文章 | 新鮮出爐！宏基因組+蛋白質(zhì)組學(xué)探索紅麻脫膠過(guò)程中相關(guān)的微生物群落變化

4、Ann Neurol | 神經(jīng)科學(xué)一區(qū)TOP期刊，代謝組學(xué)為鑒別急性缺血性卒中與擬卒中提供相關(guān)診斷價(jià)值

本文系鹿明生物原創(chuàng)

轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明本文轉(zhuǎn)自鹿明生物