“論文沒發(fā)出來，想想這些年有沒有在努力搞分析！”哈哈哈，開個(gè)玩笑，小云才不會(huì)像哪些大咖們不食人間煙火呢！小云當(dāng)然知道各位小伙伴們都在日復(fù)一日的努力搞科研呢！在繁重的實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后，刷刷手機(jī)的同時(shí)不妨看一篇搞數(shù)據(jù)分析發(fā)高分SCI的技巧吧！ 大家伙兒無比熟悉的UK Biobank，簡(jiǎn)直就是生信分析人發(fā)文的法寶啊，包含了大規(guī)模的關(guān)于致病或預(yù)防疾病的基因和環(huán)境因子的資源，不管是疾病還是藥品處方以及死亡記錄都能找到，所以非常適合做數(shù)據(jù)的二次分析和前瞻性研究。學(xué)會(huì)數(shù)據(jù)分析，不僅利于發(fā)文還可以指導(dǎo)自己的課題研究喲！ 今天小云帶來的這篇前瞻性研究來自華中科技大學(xué)，近年有很多國人都在搞這種分析哦，一定要學(xué)會(huì)碼?。∵@項(xiàng)研究針對(duì)植物性飲食(PDI)和非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)研究，根據(jù)與NAFLD相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)變量計(jì)算加權(quán)多基因風(fēng)險(xiǎn)分?jǐn)?shù)，利用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型估計(jì)危險(xiǎn)比，一項(xiàng)對(duì)大眾飲食健康非常有指導(dǎo)價(jià)值的研究。小云建議下載原文好好的學(xué)習(xí)，一方面是具體的數(shù)據(jù)處理篩選，另一方面是生信分析和結(jié)果討論，相信一定會(huì)有很大的收獲，同時(shí)有任何生信分析問題都可以@小云喲！

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題目：植物性飲食、遺傳易感性和非酒精性脂肪性肝病的風(fēng)險(xiǎn)

雜志：

BMC Medicine

影響因子：IF=?9.2994

發(fā)表時(shí)間：2023年9月12日

研究背景

非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)已成為全球最常見的慢性肝病。飲食是NAFLD的一個(gè)重要的可改變的危險(xiǎn)因素。植物性飲食模式因其環(huán)境可持續(xù)性而受到關(guān)注，富含植物性食物的飲食與NAFLD的風(fēng)險(xiǎn)較低相關(guān)。然而，并非所有植物性食物都對(duì)NAFLD有益。為區(qū)分不同質(zhì)量的植物性飲食，以往研究建立了三種植物性飲食指數(shù)(PDI)，分別為總體植物性飲食指數(shù)(總體PDI)、健康植物性飲食指數(shù)(hPDI)和不健康植物性飲食指數(shù)(uPDI)。但基于有限的樣本和現(xiàn)有研究結(jié)果的不一致，對(duì)于前瞻性研究的證據(jù)很有限。這項(xiàng)研究的目的是調(diào)查植物性飲食與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)，并探索這種關(guān)聯(lián)是否會(huì)被NAFLD的遺傳風(fēng)險(xiǎn)所改變。

數(shù)據(jù)來源及處理

數(shù)據(jù)來源于UKB，納入了飲食評(píng)估的參與者(n=210673)，在飲食信息收集后排除了那些被診斷為NAFLD、肝硬變或其他肝病的人（n=2920）；排除隨訪結(jié)束時(shí)被診斷為酒精相關(guān)疾病的參與者(n=266)；排除不合理的能量攝入量（n=2994）；排除沒有完整遺傳數(shù)據(jù)或不是歐洲血統(tǒng)的參與者（n=13111）；排除患有心血管疾病或癌癥的參與者（n=32160）。最后159222名參與者被納入NAFLD風(fēng)險(xiǎn)分析，20692名參與者被納入肝臟脂肪含量分析。

研究思路

這項(xiàng)縱向隊(duì)列研究包括UKB中159222名NAFLD患者，計(jì)算了總體PDI、hPDI和uPDI。根據(jù)與NAFLD相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)變量計(jì)算加權(quán)多基因風(fēng)險(xiǎn)分?jǐn)?shù)；利用Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型估計(jì)危險(xiǎn)比（HR）和95%可信區(qū)間（CI）；然后利用磁共振成像衍生質(zhì)子密度脂肪分?jǐn)?shù)(MRI-PDFF)測(cè)量了20692名參與者的肝臟脂肪含量；最后使用廣義線性模型評(píng)估PDI與MRI-PDFF之間的關(guān)系。

主要結(jié)果

159222名參與者的基線特征如表1所示，平均年齡為58.0±8.0，其中55.7%為女性。24小時(shí)飲食評(píng)估的平均(SD)次數(shù)為2.2(1.2)?？傮wPDI范圍為25至74，hPDI范圍為27至82，uPDI范圍為27至78?？傮wPDI和hPDI較高，但uPDI較低的參與者往往是女性、受過良好教育、非當(dāng)前吸煙者，并且較低的體重指數(shù)?？傮wPDI較高的參與者的總能量攝入較高，而hPDI和uPDI較高的參與者的總能量攝入較低?？傮w參與者和具有MRI-PDFF數(shù)據(jù)的參與者的基線特征和PDI基本一致(n=20692)(

表1

)。

表1?通過三個(gè)植物性飲食指標(biāo)對(duì)159222名參與者進(jìn)行基線特征分析

在中位9.5年的隨訪期間，記錄了1541例NAFLD病例。當(dāng)使用RCS測(cè)試總體PDI、hPDI和uPDI與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)的非線性時(shí)，作者沒有觀察到明顯的線性偏離(圖1，所有PDI的p非線性>0.05)。與最低五分位數(shù)相比，最高五分位數(shù)NAFLD的多變量調(diào)整，總體PDI、hPDI和uPDI的HRs分別為0.78(95%CI，0.66-0.93，p-trend=0.02)、0.74(95%CI，0.62-0.87，p-trend<0.0001)和1.24(95%CI，1.05-1.46，p-trend=0.02)。當(dāng)不調(diào)整BMI時(shí)，這些關(guān)聯(lián)更強(qiáng)(

表2

)。此外，PDI每增加10點(diǎn)，NAFLD的風(fēng)險(xiǎn)分別降低11%、20%和14%(總PDI、hPDI和uPDI的HRs分別為0.89[95%CI，0.81-0.97]、0.80[95%CI，0.73-0.88]和1.14[95%CI，1.05-1.24])(

表2

)。當(dāng)肝臟脂肪含量通過MRI-PDFF顯示并在最終模型中進(jìn)一步根據(jù)MRI年齡進(jìn)行調(diào)整時(shí)，較高的總體PDI和hPDI與較低的肝內(nèi)脂肪含量相關(guān)（每10點(diǎn)增量β[95%CI]分別為-0.34[-0.44，-0.25]和-0.45[-0.54，-0.36]），而較高的uPDI與較高的肝臟脂肪含量相關(guān)（β[95%CI]，0.41[0.32,0.49]，圖2)。

表2?根據(jù)總體植物性飲食指數(shù)、健康植物性飲食指數(shù)和不健康植物性飲食指數(shù)的五分位數(shù)，NAFLD的風(fēng)險(xiǎn)比(95%置信區(qū)間)

當(dāng)評(píng)估PDI和PRS與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)的聯(lián)合關(guān)系時(shí)，與最高風(fēng)險(xiǎn)組合相比，總體PDI和hPDI的大多數(shù)其他組的NAFLD風(fēng)險(xiǎn)顯著較低，并且在遺傳風(fēng)險(xiǎn)低和PDI/hPDI最高的參與者中NAFLD風(fēng)險(xiǎn)最低分?jǐn)?shù)。相反，與具有最低PRS和最低uPDI的人相比，較高的PRS和uPDI會(huì)增加NAFLD風(fēng)險(xiǎn)。在MRI-PDFF的聯(lián)合關(guān)聯(lián)中，β系數(shù)隨著PDI和PRS的增加而逐漸增加。在按遺傳風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行分層分析中，較高的總體PDI和較低的uPDI與較低的NAFLD風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)并未因NAFLD的遺傳易感性而改變，但hPDI與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)會(huì)因遺傳風(fēng)險(xiǎn)而顯著改變（對(duì)于總體PDI和uPDI，P交互作用>0.05，對(duì)于hPDI，P相互作用=0.03）。

圖1?總的植物性飲食指數(shù)、健康植物性飲食指數(shù)和不健康植物性飲食指數(shù)與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)之間的限制三次樣條關(guān)系

當(dāng)使用特定性別的PDI五分位數(shù)時(shí)，PDI與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)和肝臟脂肪含量的關(guān)聯(lián)仍然存在，并且沒有觀察到性別和PDI之間存在顯著的相互作用。此外，作者觀察到其他主要危險(xiǎn)因素（年齡、肥胖、能量攝入、飲酒或體力活動(dòng)）對(duì)NAFLD風(fēng)險(xiǎn)或MRI-PDFF沒有顯著影響，除了uPDI和NAFLD風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)因肥胖而改變（p交互作用=0.0009<0.003（0.05/（3次暴露*5組））。

圖2?總體植物性飲食指數(shù)、健康植物性飲食指數(shù)和不健康植物性飲食指數(shù)與MRI-PDFF的關(guān)系

當(dāng)作者進(jìn)一步調(diào)整慢性疾病和肝功能時(shí)、進(jìn)一步調(diào)整代謝指標(biāo)和腰圍時(shí)、排除飲食評(píng)估少于兩次的參與者時(shí)、排除隨訪時(shí)間少于2年的參與者時(shí)，PDI和NAFLD之間的關(guān)聯(lián)基本保持不變。此外，作者觀察到BMI對(duì)PDI-NAFLD風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)的顯著中介作用，對(duì)于PDI、hPDI和uPDI分別為51.8%、47.0%和46.5%。此外，當(dāng)作者一次從PDI中排除17種食物組中的每一種并針對(duì)排除的食物組攝入量進(jìn)行調(diào)整時(shí)，PDI每10點(diǎn)增量的調(diào)整后HR并未發(fā)生實(shí)質(zhì)性改變。然而，較高的堅(jiān)果、茶和咖啡攝入量與較低的NAFLD風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，但較高的含糖飲料、魚類和海鮮攝入量與較高的NAFLD風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。這些結(jié)果表明，PDI與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)可能很大程度上是由于咖啡和茶攝入量較高以及含糖飲料、魚和海鮮攝入量較低所致。

文章小結(jié)

在這項(xiàng)縱向研究中，作者發(fā)現(xiàn)攝入更多的植物性飲食，尤其是健康的植物性飲食，與較低的NAFLD風(fēng)險(xiǎn)和肝臟脂肪含量相關(guān)，而較高的uPDI則與NAFLD風(fēng)險(xiǎn)增加和較高的肝臟脂肪含量相關(guān)。與最低五分位數(shù)相比，總體PDI、hPDI和uPDI最高五分位數(shù)的參與者患NAFLD的風(fēng)險(xiǎn)分別降低22%、26%和24%，并分別降低0.51%、0.71%和0.72%肝臟脂肪含量。作者利用UKB大量數(shù)據(jù)進(jìn)行的一項(xiàng)大規(guī)模的前瞻性研究，挖掘公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行二次分析，這樣的研究具有基礎(chǔ)性參考價(jià)值，當(dāng)今生信分析可謂是太卷了，小云建議有時(shí)候也可以做點(diǎn)二次分析的研究，即豐富基礎(chǔ)性研究數(shù)據(jù)，還能0實(shí)驗(yàn)上高分，性價(jià)比還是杠杠的！至于很多生信分析手段，都可以聯(lián)系小云獲取哦！