SCI新寵“孟德爾隨機(jī)化”,簡單幾張圖表發(fā)表IF 8.8+SCI !
如果說最近臨床科研領(lǐng)域中最火的是什么,除了chatGPT,應(yīng)該就是孟德爾隨機(jī)化了。利用公開數(shù)據(jù)庫就能輕裝上陣寫文章,甚至是高質(zhì)量的論文。比臨床更簡單、發(fā)文速度快、需做實(shí)驗(yàn)!
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Frontiers in immunology雜志(IF:8.786)的一篇孟德爾隨機(jī)化研究。縱觀全文,利用孟德爾隨機(jī)化(MR),簡簡單單幾張圖表,就揭示了葉酸和維生素B12與自身免疫性疾病的關(guān)系,還發(fā)表了IF 8.8+的SCI,不得不感嘆,孟德爾隨機(jī)化果然是SCI的新寵兒!

檢索Pubmed數(shù)據(jù)庫可以發(fā)現(xiàn),過去10年全球發(fā)表的有關(guān)孟德爾隨機(jī)化方法的文章數(shù)量近4500篇,而2022年更是達(dá)到頂峰的1695篇。連年攀升的發(fā)文量,彰顯出孟德爾隨機(jī)化方法的熱度越來越高!

對MR學(xué)習(xí)有興趣的可以繼續(xù)看,文末也分享了全套學(xué)習(xí)資料給大家!
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孟德爾隨機(jī)化,Mendilian Randomization,簡寫為MR,是一種在流行病學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用廣泛的一種實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方法,基于全基因組測序數(shù)據(jù)、能有效減少偏倚、類似于RCT研究、用于揭露因果關(guān)系的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。
1、MR分析特點(diǎn)與優(yōu)勢
?借助工具變量進(jìn)行隨機(jī)化,模擬隨機(jī)對照研究,從而達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)優(yōu)勢。
?優(yōu)勢包括:證據(jù)級別高,可以避免偏倚,可以避免反向因果關(guān)系,同時(shí)又比隨機(jī)對照研究更省錢、省力。
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2、MR必須滿足三大假設(shè)
?相關(guān)性假設(shè):SNP與暴露強(qiáng)相關(guān)
?排他性假設(shè):SNP與結(jié)局無關(guān)
?獨(dú)立性假設(shè):SNP與混淆因素?zé)o關(guān)
3、MR分析流程
?獲取暴露與結(jié)局的GWAS數(shù)據(jù);
?在暴露GWAS數(shù)據(jù)中挑選工具變量;
?在結(jié)局中找到對應(yīng)的工具變量信息;
?孟德爾隨機(jī)化分析,敏感性分析
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4、MR公共數(shù)據(jù)庫推薦
利用公開數(shù)據(jù)庫就能輕裝上陣寫文章,這里推薦幾個(gè)數(shù)據(jù)庫
①GWAS catalog
網(wǎng)址:https://gwas.mrcieu.ac.uk/
優(yōu)點(diǎn):可多種方式進(jìn)行搜索(publications、variants、traits、genes、region等),表型信息規(guī)范缺點(diǎn):有時(shí)候需要開國外代理模式才能使用,網(wǎng)頁比較慢

②nealelab
網(wǎng)址:http://www.nealelab.is/uk-biobank
優(yōu)點(diǎn):數(shù)據(jù)全面,整理很有條理
缺點(diǎn):英國數(shù)據(jù)庫,完整版需要花錢注冊(UKB數(shù)據(jù)使用費(fèi)用分為三檔:3000英鎊/6000英鎊/9000英鎊),有免費(fèi)不需要注冊的2018年版本數(shù)據(jù),但數(shù)據(jù)時(shí)間可能會相對滯后。

③IEU OpenGWAS project
網(wǎng)址:https://gwas.mrcieu.ac.uk/
④PheWeb全表型組關(guān)聯(lián)研究
網(wǎng)址:https://pheweb.jp/downloads
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5、MR學(xué)習(xí)全套資料分享
繼meta分析、純生信之后,孟德爾隨機(jī)化作為一個(gè)不做實(shí)驗(yàn)發(fā)SCI的新代名詞,目前確實(shí)是火爆趨勢。
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