【零代碼生信分析小工具】欄目又更新啦~?~

這次小云給各位小伙伴們分享一個超級無敵簡單的免疫浸潤分析工具，生信圈里的朋友在看文獻(xiàn)的時候估計(jì)都有發(fā)現(xiàn)——現(xiàn)在的文章里不管做的腫瘤還是非腫瘤，不管是什么方向，都喜歡去做些免疫浸潤分析，一來提高一些創(chuàng)新性，二來也增加些數(shù)據(jù)量。

但很多免疫浸潤分析需要R包來完成，這對于生信小白或者只用簡單分析填充數(shù)據(jù)的朋友就不太友好了，那這也正是小云給小伙伴們推薦這個分析小工具的原因。這個單基因泛癌免疫浸潤工具，只需你輸入目標(biāo)基因，一鍵分析，即刻成圖，非常適合剛?cè)腴T的選手以及想在單基因?qū)嶒?yàn)類文章中用生信填充些數(shù)據(jù)的小伙伴哦！

再安利一下這個零代碼小工具的分析網(wǎng)站——“云生信在線分析平臺”，它包含200多個零代碼分析小工具，只需上傳數(shù)據(jù)，直接一鍵成圖，超級適合生信小白使用哦。網(wǎng)址：http://www.biocloudservice.com/home.html?，分析平臺開源、注冊登錄后可免費(fèi)使用。下面跟著小云一起來看看吧！

小工具分析原理

本軟件利用?USCS 上的 pan-cancer 數(shù)據(jù)分別通過 EPIC 和 Cibersort 算法，計(jì)算某個指定基因在各個腫瘤中分別與免疫細(xì)胞的相關(guān)性，并分別輸出相關(guān)性熱圖。

操作方法

Step 1 ：首先打開云生信在線分析平臺，并登錄使用。點(diǎn)擊“panImmune免疫浸潤分析”進(jìn)入小工具頁面：

Step 2：進(jìn)入小工具頁面后，可以看到目標(biāo)基因輸入框，在這里只需輸入目標(biāo)基因，再點(diǎn)擊“submit”就完成操作了，剩下的就是等結(jié)果啦！（ps：是不是簡單到不能在簡單啦~）如果想查看工具說明可以點(diǎn)擊左上角“使用說明”進(jìn)行查看，初次使用小工具也可以先點(diǎn)擊“運(yùn)行示例數(shù)據(jù)”來看下結(jié)果圖哦

Step 3：單基因泛癌免疫浸潤分析工具共得到2個結(jié)果圖，可以在結(jié)果展示頁面直接點(diǎn)擊某個圖進(jìn)入預(yù)覽頁面，也可以直接下載使用。

結(jié)果說明

Cibersort分析熱圖【Cibersort.svg】：該圖表示輸入基因在各個腫瘤中與22種免疫細(xì)胞的相關(guān)性。

EPIC分析熱圖【EPIC.svg】：該圖表示輸入基因在各個腫瘤中與8種免疫細(xì)胞的相關(guān)性。? ?

?結(jié)語

看完這個零代碼工具有沒有覺得，我上我也行的感覺呀？有就對了，這個小工具就是要把復(fù)雜的R包、代碼簡單化處理來滿足我們一些生信小白的需求！感興趣的小伙伴趕快來嘗試一波吧！后面還有更多小工具推薦，敬請期待哦！