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gromacs教程-13-CPU版-虛擬機(jī)安裝

2023-08-21 08:18 作者:邱新龍分子模擬小破屋  | 我要投稿

Ubuntu安裝-無(wú)gpu加速版本

安裝命令

sudo apt-get install gromacs

這種方法安裝不能用來gpu加速,如果你沒有g(shù)pu這個(gè)方法時(shí)可以的,如果你不想用自己的電腦跑,也是可以的,就是用來生成一個(gè)文件就好了


虛擬機(jī)-無(wú)gpu加速版本

1. 官網(wǎng)下載VMware(https://www.vmware.com/cn/products/workstation-pro.html)


2. 安裝(只修改了安裝位置,其余默認(rèn))



3) 點(diǎn)擊【創(chuàng)建新虛擬機(jī)】


4)選擇【稍后安裝操作系統(tǒng)】,點(diǎn)擊下一步 不然需要填鏡像各種信息


5)選擇要安裝的虛擬機(jī)操作系統(tǒng)類型


5)選擇要安裝的虛擬機(jī)操作系統(tǒng)類型

6)新建new-ubuntu目錄統(tǒng)一存放虛擬機(jī),方便管理


7) 創(chuàng)建完虛擬機(jī)后,點(diǎn)擊【自定義硬件】

8)配置映像文件

9) 點(diǎn)擊【完成】

4. 安裝虛擬機(jī)系統(tǒng)

1) 開啟虛擬機(jī), 等待加載完成(挺慢的,可以先去玩其他的,它加載完會(huì)有聲音響起)

2)選擇系統(tǒng)語(yǔ)言(中文在滑動(dòng)窗在最底下),安裝Ubuntu


3) 附加安裝應(yīng)用選擇【正常安裝,其他選項(xiàng)我不選】

4) 選擇安裝類型【磁盤分區(qū)選擇】


5) 虛機(jī)登錄信息【隨意填】


6) 等待安裝【很耗時(shí)】

7) 重啟

8) 打開終端輸入 sudo apt-get install gromacs


虛擬機(jī)如何共享主機(jī)文件

VMware也可以像docker容器那樣“掛載”主機(jī)上的目錄給虛擬機(jī),在虛擬機(jī)上訪問共享目錄就跟訪問自己的目錄一樣方便。

  1. 虛擬機(jī)(M) -> 設(shè)置(S)-> 選項(xiàng)-> 共享文件夾 -> 總是啟用 -> 添加 :



文章來源:https://blog.51cto.com/u_15064638/3473548

2. 在彈出的對(duì)話框中選擇主機(jī)目錄作為共享目錄:


3. 選擇之后可以看到已經(jīng)共享的目錄路徑:

共享目錄使用:

1.? 在虛擬機(jī)中進(jìn)入共享文件:

登錄后復(fù)制?

cd? /mnt/hgfs/數(shù)據(jù)庫(kù)? ? #(“數(shù)據(jù)庫(kù)”是上圖中自己定義的共享文件在虛擬機(jī)中的名稱)


2. 復(fù)制虛擬機(jī)中文件夾到共享文件:

cp -Rf /home/database/* /mnt/hgfs/數(shù)據(jù)庫(kù)/database/

主機(jī)和虛擬機(jī)共享目錄另一個(gè)神奇的應(yīng)用是你可以在虛擬機(jī)的程序中直接訪問主機(jī)目錄,還可以把運(yùn)行結(jié)果直接保存在主機(jī)的共享目錄中!!


虛擬機(jī)共享主機(jī)文件夾沒有文件,mnt/hgfs 路徑下為空

一:首先打開共享文件夾


文章來源:https://blog.csdn.net/ZhuijiYouyou/article/details/126194985



二、運(yùn)行虛擬機(jī),命令行輸入:su root



此步輸入登錄密碼即可。

三、命令行分別輸入(參考下圖):

1? ? cat >> /etc/fstab << EOF? (輸入完按回車鍵)

2? ? .host:/ /mnt/hgfs fuse.vmhgfs-fuse allow_other,defaults? 0? 0? (輸入完按回車鍵)

3? ? EOF(輸入完按回車)

4? ? exit? (按回車鍵退出)



四、重啟虛擬機(jī)后即可看到 mnt/hgfs 路徑下的共享文件夾。


gromacs運(yùn)算時(shí)

用自己的電腦不搞個(gè)GPU加速

真的是浪費(fèi)計(jì)算資源

如果自己的服務(wù)器沒有GPU另當(dāng)別論

以上方法基本屬于淘汰的方法

只適合于自己的電腦生成文件

給其他牛逼的機(jī)器跑


gromacs教程-13-CPU版-虛擬機(jī)安裝的評(píng)論 (共 條)

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