每日科研進(jìn)展 l 2022.05.18 l

基于RNAi的殺蟲(chóng)劑對(duì)非靶標(biāo)生物的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
基于RNAi的殺蟲(chóng)劑是一種很有前途的新型害蟲(chóng)防治產(chǎn)品,與其他類(lèi)型殺蟲(chóng)劑相比,它會(huì)減少對(duì)環(huán)境的影響。RNAi基于序列的靶標(biāo)識(shí)別機(jī)制有助于實(shí)現(xiàn)高度的物種專(zhuān)一性,防止對(duì)非目標(biāo)生物體的影響。
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然而,目前還不能從序列相似性角度判斷是否會(huì)產(chǎn)生對(duì)非靶標(biāo)物種的影響。一些研究表明,只有≥21個(gè)核苷酸,且序列100%互補(bǔ),才是昆蟲(chóng)產(chǎn)生有效RNAi效應(yīng)所必需的。一些研究表明,即使是一個(gè)帶有非靶點(diǎn)序列中含有單個(gè)19個(gè)核苷酸序列完全相同,也能夠有效地敲除其相應(yīng)的mRNA。另一些研究表明,可能需要大量潛在的21個(gè)核苷酸完全匹配,才會(huì)導(dǎo)致脫靶基因的表達(dá)水平降低的現(xiàn)象。然而,由于在這些研究中只測(cè)試了少量的昆蟲(chóng),并不能得出確切的結(jié)論。
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簡(jiǎn)言之,對(duì)于昆蟲(chóng)中有效RNAi所需的最低序列相似性,尚且沒(méi)有定論。因此,將序列數(shù)據(jù)與非靶標(biāo)物種中的非靶向效應(yīng)聯(lián)系起來(lái),不僅可以增加我們對(duì)觸發(fā)昆蟲(chóng)RNAi效應(yīng)的序列相似性的理解,還可以幫助我們更好地預(yù)測(cè)對(duì)這些非靶標(biāo)生物可能產(chǎn)生的不利影響。
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該論文研究了能夠使得新熱帶褐臭蟲(chóng)Euschistus heros產(chǎn)生致死效應(yīng)的dsRNA對(duì)與其密切相關(guān)的寄生蜂Telenomus podisi?的影響。
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將E. heros特異的dsEh_vATP和dsEh_act-2飼喂給T. podisi,觀察對(duì)T. podisi?死亡率、寄生率、繁殖力、子代孵化率、子代發(fā)育時(shí)間和子代雌雄比的影響。結(jié)果表明,E. heros特異的dsRNA對(duì)T. podisi?的影響較小,而T. podisi?特異的dsTp_vATP和dsTp_act-2則能夠影響到T. podisi?的相關(guān)生長(zhǎng)發(fā)育特征(圖1)。
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為了進(jìn)一步評(píng)估E.heros活性dsRNA對(duì)T. podisi成蟲(chóng)的影響,對(duì)八個(gè)預(yù)測(cè)的dsEh_vATP非靶基因和六個(gè)dsEh_act-2非靶基因的表達(dá)情況進(jìn)行了評(píng)估,這些基因具有較高的命中率或連續(xù)匹配的特點(diǎn)。結(jié)果表明,對(duì)這些非靶標(biāo)基因并沒(méi)產(chǎn)生明顯的抑制作用(圖2)。

?用dsRNA浸泡E. heros的卵,之后檢測(cè)寄生其中的T. podisi?幼蟲(chóng)發(fā)育情況,均沒(méi)有產(chǎn)生顯著的影響(圖3)。
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該研究結(jié)果表明,暴露于兩種非特異性dsRNA不會(huì)對(duì)寄生蜂T.podisi?的存活或寄生能力產(chǎn)生不利影響,也不會(huì)導(dǎo)致任何可檢測(cè)到的基因表達(dá)發(fā)生變化,即使是存在多個(gè)19 nt連續(xù)匹配的序列(圖4)。

本研究可為評(píng)估基于RNAi的殺蟲(chóng)劑在非靶標(biāo)物種中的毒性,以及用dsRNA進(jìn)行害蟲(chóng)防治的環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估提供一定的參考。同時(shí),進(jìn)一步了解導(dǎo)致昆蟲(chóng)脫靶效應(yīng)的因素,以及代表性物種基因組信息,可以提高利用生物信息學(xué)預(yù)測(cè)對(duì)非靶標(biāo)生物影響的可靠性。
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生物信息學(xué)在基于RNAi的產(chǎn)品開(kāi)發(fā)階段非常有用,可以將對(duì)非靶標(biāo)物種的潛在風(fēng)險(xiǎn)降至最低。此外,生物信息學(xué)可以作為ERA選擇物種進(jìn)行毒性分析的參考,因?yàn)榭梢愿鶕?jù)序列分析幫助識(shí)別潛在風(fēng)險(xiǎn)最大的物種。
原文鏈接:
http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.154746