「超級(jí)云講堂第61期」

指導(dǎo)單位：中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)高性能計(jì)算專(zhuān)業(yè)委員會(huì)

主辦單位：北京超級(jí)云計(jì)算中心

直播平臺(tái)：bilibili、視頻號(hào)、抖音

本期嘉賓：陳同博士，中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院副研究員，微信公眾號(hào)"生信寶典"發(fā)起人，iMeta期刊聯(lián)合創(chuàng)辦人、執(zhí)行主編。

?內(nèi)容預(yù)告

基于新版ImageGP 的生信數(shù)據(jù)在線(xiàn)分析和可視化

生物信息數(shù)據(jù)分析和可視化是目前科研工作者的一個(gè)大的需求。ImageGP 可以在線(xiàn)生成常見(jiàn)的線(xiàn)圖、柱狀圖、散點(diǎn)圖、箱線(xiàn)圖、集合圖、熱圖和直方圖等。用戶(hù)只要粘貼數(shù)據(jù)矩陣，就可以快速出圖。同時(shí) ImageGP 還支持火山圖、富集分析泡泡圖、主成分分析類(lèi)圖等 和 4 種微生物領(lǐng)域的功能預(yù)測(cè)和生物標(biāo)志物鑒定分析，包括 FAPROTAX, BugBase, PICRUSt 和 LEFSe。在滿(mǎn)足方便易用的同時(shí)，ImageGP 也提供了靈活性，可以設(shè)置常見(jiàn)參數(shù)、調(diào)整樣式，輸出發(fā)表質(zhì)量的圖。新版的 ImageGP 支持客戶(hù)上傳個(gè)人數(shù)據(jù)、差異分析、WGCNA 分析、進(jìn)化樹(shù)繪制等。更多功能還在不斷添加中。

內(nèi)容章節(jié)

01?ImageGP 基本介紹

02?ImageGP 繪圖和分析功能演示

03?ImageGP 后續(xù)的開(kāi)發(fā)

陳同 博士，中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院副研究員

研究方向涉及高通量數(shù)據(jù)分析、生物信息工具開(kāi)發(fā)、合成生物學(xué)、表觀組學(xué)等，在Cell Stem Cell (封面文章)，Nucleic Acids Research，Nature communications, Protein & Cell, iMeta等高水平雜志以第一或通訊作者發(fā)表文章十余篇；開(kāi)發(fā)在線(xiàn)繪圖平臺(tái) ImageGP，使用近 50 萬(wàn)人次；運(yùn)營(yíng)有十余萬(wàn)人關(guān)注的微信公眾號(hào)《生信寶典》，分享有1200 多篇生物信息分析原創(chuàng)文章、教程和視頻，閱讀播放千萬(wàn)次。聯(lián)合創(chuàng)辦iMeta期刊，現(xiàn)為執(zhí)行主編，致力于打造微生物和生物信息領(lǐng)域的國(guó)產(chǎn)高水平雜志。

「超級(jí)云講堂」由中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)高性能計(jì)算專(zhuān)業(yè)委員會(huì)指導(dǎo)，北京超級(jí)云計(jì)算中心主辦，是集科研、學(xué)術(shù)、教育為一體的在線(xiàn)科普、公益直播講堂。邀請(qǐng)各領(lǐng)域技術(shù)大咖、知名學(xué)者解讀最新、最熱科研、科普話(huà)題，分享基于云上科研環(huán)境的應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)與成功實(shí)踐。致力于打造一個(gè)易參與、樂(lè)分享、勤思考、善實(shí)踐的科研、科普、學(xué)術(shù)交流平臺(tái)，搭建科研、教研工作者與公眾的紐帶和橋梁，不但注重科學(xué)思想的傳播，更注重不同領(lǐng)域思想的交叉和碰撞，志在營(yíng)造多元的、思辨的科學(xué)文化交流氛圍。

目前云講堂已連續(xù)開(kāi)播60期，B站粉絲數(shù)量1.1W+，累計(jì)觀看次數(shù)達(dá)500,000+，并擁有31個(gè)直播交流群，群活躍粉絲數(shù)量6,000+。

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