大家好，歡迎觀看《時空日報》第19期。本期追蹤到時空/單細胞組學相關研究文章共計5篇。以下是應用時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot模塊生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1、基于同源比較的棘皮動物單細胞和核轉錄組學的細胞類型多樣性和新假設

New hypotheses of cell type diversity and novelty from orthology-driven comparative single cell and nuclei transcriptomics in echinoderms

eLife; IF: 8.713; DOI: 10.7554/eLife.80090

內容概要：使用snRNA-seq技術構建了蝙蝠海星（Patiria miniat）胚胎的基因表達圖譜，并通過與紫海膽胚胎的scRNA-seq進行比較，揭示了細胞類型的多樣性和新穎性的新假設。此外，該研究還提出了對這些細胞類型演化的新解釋和對新型細胞類型定義的反思。

2、用于果蠅研究的連續(xù)肌肉、神經膠質、上皮、神經元和血細胞系

Continuous muscle, glial, epithelial, neuronal, and hemocyte cell lines for Drosophila research

eLife; IF: 8.713; DOI: 10.7554/eLife.85814

內容概要：使用激活的Ras表達（RasV12）使果蠅細胞獲得增殖和存活優(yōu)勢，從而簡化了細胞系的生成。通過轉錄組分析，發(fā)現這些細胞系表達了關鍵的細胞類型特異性基因，并與單細胞測序和原位分析數據的預期一致。這種技術可以產生具有膠質、上皮、肌肉、神經和血細胞特征的體外細胞模型。

3、支氣管肺泡灌洗液中巨噬細胞和CD8 T細胞的相互作用與潛伏性結核感染有關?

The interaction of macrophages and CD8 T cells in bronchoalveolar lavage fluid is associated with latent tuberculosis infection

Emerging Microbes and Infections; IF: 8.000; DOI: 10.1080/22221751.2023.2239940

內容概要：使用scRNA-seq技術對患有潛伏性結核分枝桿菌結核感染（mycobacterium tuberculosis，LTBI）或結核病（tuberculosis，TB）患者的支氣管肺泡灌洗液（bronchoalveolar lavage fluid，BALF）中的免疫細胞進行分析，發(fā)現結核分枝桿菌感染顯著改變了BALF中的免疫細胞組成，特別是三個巨噬細胞亞群（即單核巨噬細胞-CCL23、MM-FCN1和MM-SPP1），這些細胞與TB感染的疾病狀態(tài)有關。MM-CCL23群體主要通過CCL20/CCR6募集CD8-CCR6 T細胞，這是LTBI中與保護性免疫相關的一個突出特征。?該研究提高了我們對結核分枝桿菌感染期間肺部免疫景觀的理解，這可能有助于未來保護性免疫的疫苗開發(fā)。

4、單細胞分析揭示人類頸動脈與股動脈斑塊白細胞的相對炎性極化

Single-cell profiling reveals comparatively inflammatory polarization of human carotid versus femoral plaque leukocytes

JCI Insight; IF: 8.000; DOI: 10.1172/jci.insight.171359

內容概要：使用scRNA-seq、流式細胞術和免疫組織化學等方法比較人類頸動脈和股動脈斑塊內白細胞的炎癥極化情況，揭示了斑塊位點特異性細胞極化信號的決定因素。研究發(fā)現，與頸動脈斑塊相比，人股骨斑塊表現出不同的巨噬細胞圖譜和CD8+T細胞群的減少。?

5、通過單細胞形態(tài)計量學、類器官培養(yǎng)和轉錄組學鑒定肺干細胞亞群?

Identifying a lung stem cell subpopulation by combining single-cell morphometrics, organoid culture, and transcriptomics

Stem Cells?(Dayton, Ohio); IF: 5.200; DOI: 10.1093/stmcls/sxad044

內容概要：介紹了一種新的單細胞分析方法scMORN，通過結合單細胞形態(tài)計量學、類器官培養(yǎng)實驗和RNA-seq，揭示了肺上皮干細胞的亞群。scMORN可適用于分析組織干細胞的類器官形成能力和分化潛力，以發(fā)現有用的干細胞亞群。

《時空日報》是華大時空基于時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot功能板塊，推出的聚焦于時空組學領域學術前沿的欄目。該欄目以實時、精準追蹤時空組學前沿為目標，共享最新時空知識，助力生命科學和臨床醫(yī)學發(fā)展。