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如何正確書寫多肽

2022-04-29 15:59 作者:為華sw  | 我要投稿

多肽的書寫有兩種形式,單字母形式和三字母形式,不管是哪一種形式,表達的多肽結(jié)構(gòu)都是唯一的,這樣可以避免出現(xiàn)分歧。國際上統(tǒng)一規(guī)定:多肽的N端(氮端)在最左邊,多肽的C端(碳端)在最右邊。

一、多肽的單字母書寫形式

什么叫單字母

顧名思義就是一個字母代表一個氨基酸,通常用大寫字母表示,如A代表丙氨酸、C代表半胱氨酸。如果是小寫,代表對應氨基酸是D型,小寫字母a代表D型丙氨酸,小寫字母c代表D型半胱氨酸。

多肽單字母書寫舉例

1、多肽1序列:AGYFKVCM,共8個氨基酸,所有字母均是大寫,說明所有的氨基酸均是天然存在的L型氨基酸。

2、多肽2序列:AGYFkvcm,共8個氨基酸,右邊(C端)的四個氨基酸是小寫,對應的四種氨基酸是和L型對稱的D型氨基酸。

3、多肽1序列AGYFKVCM也可以寫成H-AGYFKVCM-OH,左邊的H-代表N端的氨基,可以寫出來,也可以省略。右邊的-OH代表C端的羧基,同樣可以寫出來,也可以省略。為了美觀整齊,H-和-OH同時寫或同時不寫。

4、多肽3序列:AGYFKVCM-NH2,與多肽1的區(qū)別是,右邊多了-NH2,代表著C端酰胺化。

二、多肽的三字母書寫形式

什么叫三字母

三個字母代表一個氨基酸,并且三字母的前面提到的單字母是一一對應關(guān)系。三個字母中,第一個字母大寫,第二和第三個字母小寫,如Ala也是代表丙氨酸、Cys代表半胱氨酸。

多肽三字母書寫舉例

1、多肽1序列對應的三字母書寫為:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,左側(cè)“H”可以改寫為“H2N”,右側(cè)“OH”可以寫為“COOH”。

2、多肽3序列對應的三字母書寫為:H-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-NH2,C端酰胺化,左側(cè)“H”可以寫為“H2N”,右側(cè)“NH2”可以寫為“CONH2”。

三、特殊氨基酸書寫,下面介紹幾個常見的書寫。

1、N端封端的書寫,通常是乙酰封端,寫法為Ac-Ala-Gly-Tyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH。

2、磷酸化氨基酸的書寫,H-Ala-Gly-pTyr-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,AG-pY-FKVCM、H-Ala-Gly-Tyr(PO3H2)-Phe-Lys-Val-Cys-Met-OH,數(shù)字3和2可以下標。

3、D型氨基酸的書寫,單字母通常用小寫表述,如多肽1中F變成對應的D型。


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