混合線性離子阱軌道阱質(zhì)譜儀是基于傅立葉變換的混合儀器之一，第一臺(tái)質(zhì)量分析儀是線性離子阱（LIT），第二臺(tái)是高分辨率軌道阱（Orbitrap）。因?yàn)長(zhǎng)IT本身是檢測(cè)器，LIT-orbitrap組合可用于MS和MSn實(shí)驗(yàn)。

為了利用到Orbitrap分析儀的最高分辨率，必須考慮LIT和FT分析儀的數(shù)據(jù)采集時(shí)間。離子的捕獲能力和LIT的高數(shù)據(jù)采集速度允許采集選定前體離子的MS/MS光譜，同時(shí)將部分前體轉(zhuǎn)移到Orbitrap中以進(jìn)行精確的質(zhì)量測(cè)量。可以在第二個(gè)碰撞池中使用不同的碰撞方法在不同的碰撞能量下進(jìn)行其他裂解。來自任何一個(gè)碰撞池的產(chǎn)品都通過C阱注入到Orbitrap中，然后在Orbitrap中收集瞬態(tài)信號(hào)用于隨后的FT分析。

這種混合質(zhì)譜的顯著優(yōu)勢(shì)使其在以下研究領(lǐng)域中廣受歡迎：

蛋白質(zhì)組學(xué)：自上而下分析，蛋白質(zhì)ID，翻譯后修飾（PTM）分析和定量蛋白質(zhì)組學(xué)

代謝組學(xué)：非靶向代謝組學(xué)，未知化合物從頭結(jié)構(gòu)解析

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