? ? ? ??最近幾天需要集中安裝軟件，尤其是不需要conda安裝的，存在依賴的軟件，盡量的自己去配置環(huán)境變量，針對(duì)個(gè)別在安裝時(shí)報(bào)錯(cuò)的軟件，簡(jiǎn)單記錄一下，等過(guò)段時(shí)間有了數(shù)據(jù)后，會(huì)再具體的寫一些這些軟件的具體使用方法，結(jié)果解讀。先簡(jiǎn)單說(shuō)一下HMMER安裝過(guò)程吧。

? ? ? ??從功能基因研究的角度來(lái)講，相關(guān)的搜索，比如從序列數(shù)據(jù)庫(kù)中，找同源的序列，或者對(duì)一個(gè)新的基因功能進(jìn)行鑒定，使用hmmer比使用blast有著更高的靈敏度以及更高的搜索速度，但其應(yīng)用遠(yuǎn)沒(méi)有blast普及。

下載官網(wǎng)

? ? http://hmmer.org/

下載后tar -zxvf 解壓， cd?

./configure --prefix=/public/home/myname/software/hmmer-3.3.2

? 發(fā)現(xiàn)提醒No python3 found,看樣子這個(gè)軟件依賴python3，而服務(wù)器上安裝的是python2.7.5,下載python3。

下載鏈接：https://www.python.org/ftp/python/3.7.0/

?????? 然后tar -xzvf Python-3.7.0.tgz解壓

?? ./configure --prefix=/public/home/myname/software/Python-3.7.0

??make

??make install?

運(yùn)行完后，出現(xiàn)下面結(jié)果，提示安裝成功，然后修改環(huán)境變量：

?修改環(huán)境變量

?????vi ~/.bashrc

? ? ?exportPATH="$PATH:/public/home/myname/software/Python-3.7.0/bin"

??????source~/.bashrc

?????? 再重新對(duì)HMMER進(jìn)行編譯，解決

?????? 然后make && make install, 進(jìn)入bin/目錄下，試一下，出現(xiàn)下面信息，提示安裝成功。

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