計算機輔助藥物設(shè)計備忘錄(一)
這是關(guān)于(廣義)計算機輔助藥物設(shè)計的備忘錄,包括但不限于計算機輔助藥物設(shè)計、化學(xué)信息學(xué)、生物信息學(xué)、藥學(xué)信息學(xué)、分子動力學(xué)、量子化學(xué)的內(nèi)容。
IUPAC和IUBMB于1992年聯(lián)合發(fā)布了Biochemical Nomenclature and Related Documents,也叫IUPAC白皮書(White Book,ISBN:1-85578-005-4),白皮書分章節(jié)收錄了氨基酸、肽、蛋白質(zhì)、酶、核苷酸、核酸、糖、脂等分子的結(jié)構(gòu)和符號表示。本文摘錄白皮書第2章第1部分20種標(biāo)準(zhǔn)氨基酸名稱、三位字母簡寫和一位字母簡寫。
丙氨酸????Alanine????Ala????A
精氨酸????Arginine????Arg????R
天冬酰胺????Asparagine????Asn????N
天冬氨酸????Aspartic acid????Asp????D
半胱氨酸????Cysteine????Cys????C
谷氨酰胺????Glutamine????Gln????Q
谷氨酸????Glutamic acid????Glu????E
甘氨酸????Glycine????Gly????G
組氨酸????Histidine????His????H
異亮氨酸????Isoleucine????Ile????I
亮氨酸????Leucine????Leu????L
賴氨酸????Lysine????Lys????K
甲硫氨酸????Methionine????Met????M
苯丙氨酸????Phenylalanine????Phe????F
脯氨酸????Proline????Pro????P
絲氨酸????Serine????Ser????S
蘇氨酸????Threonine????Thr????T
色氨酸????Tryptophan????Trp????W
酪氨酸????Tyrosine????Tyr????Y
纈氨酸????Valine????Val????V
天冬氨酸或天冬酰胺都可以用Asx(B)表示,谷氨酸或谷氨酰胺都可以用Glx(Z)表示,另有Xaa(X)表示非標(biāo)準(zhǔn)氨基酸。

IUPAC關(guān)于白皮書的介紹(訪問日期:2023/2/13)
https://iupac.org/what-we-do/books/whitebook/
白皮書原文目錄(訪問日期:2023/2/13)
https://iupac.qmul.ac.uk/bibliog/white.html
白皮書第2章第1部分PDF文件(訪問日期:2023/2/13)
https://www.degruyter.com/document/doi/10.1351/pac198456050595/html