ggpubr包快速得到相關(guān)性分析圖
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本文將帶你了解如何使用ggpubr包快速得到相關(guān)性分析圖
什么是相關(guān)性分析
相關(guān)性分析用于評(píng)估兩個(gè)或多個(gè)變量之間的關(guān)聯(lián)。例如,如果我們想知道父母親的身高和孩子的身高之間是否存在關(guān)系,可以計(jì)算父母親與孩子的相關(guān)系數(shù)來回答這個(gè)問題。
計(jì)算相關(guān)性最常用的方法是Pearson相關(guān)方法。皮爾遜(Pearson)相關(guān)(r),它測(cè)量?jī)蓚€(gè)變量(x和y)之間的線性相關(guān)性。它也稱為參數(shù)相關(guān)性檢驗(yàn),因?yàn)樗Q于數(shù)據(jù)的分布。僅當(dāng)x和y來自正態(tài)分布時(shí)才可以使用它。y = f(x)的圖稱為線性回歸曲線。
相關(guān)性分析一直是研究者熱衷于用的一種分析,指出兩個(gè)或多個(gè)具備相關(guān)性的變量元素進(jìn)行分析,從而衡量?jī)蓚€(gè)因素的相關(guān)密切程度,相關(guān)性的元素之間需要存在一定的聯(lián)系或者概率才可以進(jìn)行相關(guān)性分析。ggpubr是基于ggplot2的一個(gè)包,在畫圖的時(shí)候比較省事,用一行代碼可以做相關(guān)性分析。
安裝加載安裝包
第一種直接安裝R包
第二中通過github安裝
基礎(chǔ)繪制相關(guān)性分析圖

便捷的添加R和P的作用

其實(shí)ggpubr包不僅可以快速的做出相關(guān)性分析的圖,還可以繪制密度圖、直方圖、箱線圖、散點(diǎn)圖、小提琴圖等,并且在添加p值等操作上更加的簡(jiǎn)便。ggpubr包涵蓋了十來種函數(shù),近30種圖形,可以滿足日常科研所需。例如:
ggdensity() 密度圖
?stat_overlay_normal_density() 密度圖,同時(shí)疊加正態(tài)分布的圖,有助于檢查偏離值
?gghistogram() 直方圖。
?ggecdf() 經(jīng)驗(yàn)累積密度分布圖
?ggqqplot() 分位數(shù)-分位數(shù)圖,簡(jiǎn)稱QQ圖。
?ggboxplot() 箱圖
?ggviolin() 小提琴圖
?ggdotplot() 點(diǎn)圖
?ggstripchart() strip chart, 也可以稱為一維散點(diǎn)圖。
?ggbarplot() 柱狀圖
?ggline() 線圖
?ggerrorplot() Visualizing Error 繪制誤差棒圖
?ggpie() 餅圖
?ggdonutchart() 甜甜圈餅圖
?ggdotchart()theme_cleveland() 克利夫蘭點(diǎn)圖
?ggscatter() 散點(diǎn)圖,stat_cor() 將有P值的相關(guān)系數(shù)添加到散點(diǎn)圖中,stat_stars())
好了,這樣我們的相關(guān)性分析就做好了,小伙伴們?nèi)绻惺裁磫栴}就和小果討論吧~

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