最美情侣中文字幕电影,在线麻豆精品传媒,在线网站高清黄,久久黄色视频

歡迎光臨散文網(wǎng) 會(huì)員登陸 & 注冊(cè)

ggpubr包快速得到相關(guān)性分析圖

2023-10-17 09:13 作者:小云愛生信  | 我要投稿

爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)

原創(chuàng)?小果?生信果

歡迎點(diǎn)贊+收藏+關(guān)注

生信人R語言學(xué)習(xí)必備

立刻擁有一個(gè)Rstudio賬號(hào)

開啟升級(jí)模式吧

(56線程,256G內(nèi)存,個(gè)人存儲(chǔ)1T)

本文將帶你了解如何使用ggpubr包快速得到相關(guān)性分析圖

什么是相關(guān)性分析

相關(guān)性分析用于評(píng)估兩個(gè)或多個(gè)變量之間的關(guān)聯(lián)。例如,如果我們想知道父母親的身高和孩子的身高之間是否存在關(guān)系,可以計(jì)算父母親與孩子的相關(guān)系數(shù)來回答這個(gè)問題。

計(jì)算相關(guān)性最常用的方法是Pearson相關(guān)方法。皮爾遜(Pearson)相關(guān)(r),它測(cè)量?jī)蓚€(gè)變量(x和y)之間的線性相關(guān)性。它也稱為參數(shù)相關(guān)性檢驗(yàn),因?yàn)樗Q于數(shù)據(jù)的分布。僅當(dāng)x和y來自正態(tài)分布時(shí)才可以使用它。y = f(x)的圖稱為線性回歸曲線。

相關(guān)性分析一直是研究者熱衷于用的一種分析,指出兩個(gè)或多個(gè)具備相關(guān)性的變量元素進(jìn)行分析,從而衡量?jī)蓚€(gè)因素的相關(guān)密切程度,相關(guān)性的元素之間需要存在一定的聯(lián)系或者概率才可以進(jìn)行相關(guān)性分析。ggpubr是基于ggplot2的一個(gè)包,在畫圖的時(shí)候比較省事,用一行代碼可以做相關(guān)性分析。


安裝加載安裝包

第一種直接安裝R包


第二中通過github安裝

基礎(chǔ)繪制相關(guān)性分析圖

便捷的添加R和P的作用

其實(shí)ggpubr包不僅可以快速的做出相關(guān)性分析的圖,還可以繪制密度圖、直方圖、箱線圖、散點(diǎn)圖、小提琴圖等,并且在添加p值等操作上更加的簡(jiǎn)便。ggpubr包涵蓋了十來種函數(shù),近30種圖形,可以滿足日常科研所需。例如:

ggdensity() 密度圖

?stat_overlay_normal_density() 密度圖,同時(shí)疊加正態(tài)分布的圖,有助于檢查偏離值

?gghistogram() 直方圖。

?ggecdf() 經(jīng)驗(yàn)累積密度分布圖

?ggqqplot() 分位數(shù)-分位數(shù)圖,簡(jiǎn)稱QQ圖。

?ggboxplot() 箱圖

?ggviolin() 小提琴圖

?ggdotplot() 點(diǎn)圖

?ggstripchart() strip chart, 也可以稱為一維散點(diǎn)圖。

?ggbarplot() 柱狀圖

?ggline() 線圖

?ggerrorplot() Visualizing Error 繪制誤差棒圖

?ggpie() 餅圖

?ggdonutchart() 甜甜圈餅圖

?ggdotchart()theme_cleveland() 克利夫蘭點(diǎn)圖

?ggscatter() 散點(diǎn)圖,stat_cor() 將有P值的相關(guān)系數(shù)添加到散點(diǎn)圖中,stat_stars())

好了,這樣我們的相關(guān)性分析就做好了,小伙伴們?nèi)绻惺裁磫栴}就和小果討論吧~

“生信果”,生信入門、R語言、生信圖解讀與繪制、軟件操作、代碼復(fù)現(xiàn)、生信硬核知識(shí)技能、服務(wù)器、生物信息學(xué)的教程,以及基于R的分析和可視化等原創(chuàng)內(nèi)容,一起見證小白和大佬的成長(zhǎng)。

ggpubr包快速得到相關(guān)性分析圖的評(píng)論 (共 條)

分享到微博請(qǐng)遵守國(guó)家法律
小金县| 枣强县| 正宁县| 民和| 凉山| 祥云县| 新丰县| 汤阴县| 石城县| 舒城县| 长治县| 英吉沙县| 宝鸡市| 浦县| 杭州市| 东光县| 湄潭县| 临朐县| 安国市| 昭觉县| 山东省| 正蓝旗| 通海县| 太和县| 尼木县| 黄梅县| 广西| 赤壁市| 防城港市| 大安市| 赫章县| 抚顺县| 武鸣县| 东乡| 巨野县| 安康市| 阿鲁科尔沁旗| 防城港市| 梁平县| 古浪县| 阿拉善盟|