單細(xì)胞多組學(xué) ATAC + 轉(zhuǎn)錄組是一種以數(shù)千個(gè)細(xì)胞為研究對(duì)象，同時(shí)分析同一細(xì)胞中的基因表達(dá)和開放染色質(zhì)的技術(shù)，它可以帶來細(xì)胞的基因表達(dá)譜及其表觀基因組景觀的一體化視圖。隨著單細(xì)胞測序技術(shù)的飛速發(fā)展，單細(xì)胞多組學(xué)已經(jīng)成為單細(xì)胞技術(shù)發(fā)展的重要方向，很多研究者不再滿足于只研究基因表達(dá)，其更注重探索基因表達(dá)背后的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制，于是染色質(zhì)可及性研究成為眾多研究者的選擇。據(jù)統(tǒng)計(jì)，近 5 年來研究染色質(zhì)可及性文章以平均每年 20.1% 的比例迅速增長，在 2021 年更是達(dá)到最高增長比例 31.1%。

隨著研究需求不斷增多，單細(xì)胞測序技術(shù)也隨之飛速革新，2022 年樊榮團(tuán)隊(duì)在?Nature上發(fā)表了 Spatial-ATAC-seq，開啟空間表觀組學(xué)新篇章；南京科技大學(xué)在?Nature Method?上發(fā)布了單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù) ISSAAC-seq，實(shí)現(xiàn)在同一細(xì)胞內(nèi)兼顧高低通量且同時(shí)進(jìn)行 ATAC+ 轉(zhuǎn)錄組的測序技術(shù)，擴(kuò)大單細(xì)胞多組學(xué)研究途徑。這兩項(xiàng)染色質(zhì)可及性研究技術(shù)被評(píng)為單細(xì)胞測序技術(shù)的十大里程碑事件，推動(dòng)了單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展。

目前單細(xì)胞多組學(xué)?ATAC+ 轉(zhuǎn)錄組解決方案廣泛應(yīng)用于各類研究成果中，已在 2021-2022 兩年間支持 53 篇文章發(fā)表，其中包含?Nature?4 篇、Cell?3 篇、Science?2 篇[1]。這些文章從更深入地鑒定細(xì)胞類型和狀態(tài)，通過表觀基因組和基因表達(dá)譜的綜合分析來鑒定復(fù)雜的細(xì)胞群體，并捕獲細(xì)胞異質(zhì)性，從而發(fā)現(xiàn)隱藏的信息，利用基因表達(dá)標(biāo)志物解釋表觀遺傳圖譜；到發(fā)現(xiàn)新的基因調(diào)控相互作用，將調(diào)控元件的發(fā)現(xiàn)與基因表達(dá)相結(jié)合，探索驅(qū)動(dòng)細(xì)胞分化、發(fā)育和疾病的基因調(diào)控相互作用，探索疾病的復(fù)雜性，了解疾病中的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)如何被破壞，研究表觀遺傳重塑和治療耐藥的機(jī)制。單細(xì)胞多組學(xué)充分利用您的寶貴樣本，從同一細(xì)胞中獲得轉(zhuǎn)錄組和開放染色質(zhì)信息，讓您從有限樣本中得到盡可能多的發(fā)現(xiàn)。

注：[1] 數(shù)據(jù)來源2023年2月16日10x Genomics 官網(wǎng)

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