武漢精神衛(wèi)生中心劉杰偉&鄧明港團(tuán)隊(duì):孟德?tīng)栯S機(jī)化強(qiáng)勢(shì)拿下13分+
孟德?tīng)栯S機(jī)化(MR)火了快1年了,小伙伴們都上車(chē)了嗎? 小云翻了翻最新發(fā)表的MR文章,一個(gè)月時(shí)間就發(fā)了300多篇,其中不乏一些高分(10分+),可見(jiàn)科研人員對(duì)這個(gè)方向的青睞程度呀!
小云一直非常推薦臨床科研人員入手“孟德?tīng)栯S機(jī)化研究”,實(shí)在是不想讓關(guān)注我們的小伙伴錯(cuò)過(guò)這個(gè)發(fā)文良機(jī),
MR只需公共數(shù)據(jù)庫(kù)分析、0實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證、性?xún)r(jià)比高;并且選題方向與臨床問(wèn)題、流行病學(xué)更相近、更適合臨床醫(yī)生去研究;更重要的是MR分析目前還比較容易發(fā)高分。
MR分析方法已經(jīng)有了一套成熟的模板,創(chuàng)新點(diǎn)出了分析上的設(shè)計(jì)亮點(diǎn),更重要的是選題,比如今天要分享這篇文章的
精神病學(xué)主題,就是個(gè)MR分析中除腫瘤外關(guān)注度非常高的方向,可以分析一些因素或疾病與精神疾病的因果關(guān)系
,下面就一起來(lái)看看吧~?~
題目:虛弱和抑郁之間的聯(lián)系:一項(xiàng)雙向孟德?tīng)栯S機(jī)化研究
雜志:
Sci Adv.
影響因子:IF=13.6
發(fā)表時(shí)間:2023年9月
研究背景
虛弱是一種在應(yīng)激后容易出現(xiàn)平衡失調(diào)的狀態(tài),抑郁癥是最常見(jiàn)的心理健康疾病,大量的流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn)了虛弱和抑郁之間的聯(lián)系,然而,虛弱和抑郁之間的確切因果關(guān)系仍然不清楚。
研究方法
1. 數(shù)據(jù)來(lái)源
本研究從UK Biobank和TwinGen薈萃分析獲得了虛弱全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù),從精神病學(xué)基因組聯(lián)盟(PGC)和FinnGen(分別記錄為PD和FD)獲得了抑郁癥GWAS數(shù)據(jù)。
2. 研究思路及設(shè)計(jì)
作者使用雙向雙樣本MR研究分析虛弱和抑郁的雙向因果聯(lián)系。首先通過(guò)單變量MR分析探討虛弱與抑郁癥的雙向因果關(guān)系,然后通過(guò)對(duì)體重指數(shù)(BMI)和體力活動(dòng)(PA)進(jìn)行調(diào)整的多變量MR分析(MVMR),進(jìn)一步探索虛弱和抑郁之間的雙向因果關(guān)系。MR分析主要通過(guò)IVW方法進(jìn)行,利用MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)和MR-PRESSO進(jìn)行了敏感性分析以確保結(jié)果的一致性和穩(wěn)健性。 1)暴露和結(jié)果 MR分析在兩個(gè)方向上進(jìn)行,虛弱(I)作為暴露:評(píng)估具有較高虛弱指數(shù)的人是否更易患抑郁癥,和(ii)作為結(jié)果:評(píng)估抑郁個(gè)體是否更虛弱。 2)工具變量選擇 根據(jù)預(yù)先確定的標(biāo)準(zhǔn),選擇了總共13、33和15個(gè)與虛弱、PD和FD相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性(SNPs )。
圖1?研究設(shè)計(jì)圖
主要結(jié)果
1. 單變量MR分析
首先利用單變量MR分析探索虛弱對(duì)抑郁的影響,IVW方法表明,遺傳預(yù)測(cè)的較高虛弱指數(shù)與PD風(fēng)險(xiǎn)升高有關(guān),在FinnGen數(shù)據(jù)集中的FD結(jié)果也顯示了類(lèi)似的關(guān)聯(lián),加權(quán)中位數(shù)和MR-PRESSO,均顯示了虛弱對(duì)PD和FD的風(fēng)險(xiǎn)影響,并證明了IVW方法結(jié)果的穩(wěn)定性(圖2)。作者進(jìn)一步分析了虛弱對(duì)抑郁的單獨(dú)影響和綜合影響,結(jié)果顯示,在 13 個(gè) SNPs 中,3 個(gè) SNPs(rs1363103、rs2396766 和 rs8089807)和 6 個(gè) SNPs(rs10891490、rs12739243、rs1363103、rs4952693、rs583514 和 rs8089807)分別與 PD 和 FD 風(fēng)險(xiǎn)的增加有關(guān),而其他 SNPs 則無(wú)關(guān)(圖3)。
作者又以PD 和 FD 的遺傳易感性為暴露,進(jìn)行反向 MR 分析探索抑郁對(duì)虛弱的影響。隨機(jī)效應(yīng)?IVW 方法證明了 PD 對(duì)較高虛弱指數(shù)的因果效應(yīng),并且FinnGen 數(shù)據(jù)的FD結(jié)果與上述發(fā)現(xiàn)一致,加權(quán)中位數(shù)法和 MR-PRESSO 法都支持這種因果關(guān)系(表1)。作者進(jìn)一步分析了PD、FD對(duì)虛弱的單獨(dú)影響和綜合影響,結(jié)果顯示,在?33 個(gè)與 PD 相關(guān)的 SNPs 中的?15 個(gè)和與 FD 相關(guān)的 15 個(gè) SNPs 中的 5 個(gè)與虛弱指數(shù)呈正相關(guān),而其他 SNPs 則不呈正相關(guān)(圖4,5)。
圖5?FD對(duì)虛弱的單獨(dú)影響和綜合影響
2. 多變量MR分析
作者進(jìn)一步利用體重指數(shù)(BMI)和體力活動(dòng)(PA)調(diào)整的多變量 MR(MVMR)探討虛弱與抑郁之間的雙向因果關(guān)系。BMI是造成虛弱與抑郁之間關(guān)聯(lián)的主要混雜因素,在調(diào)整了BMI后,IVW 方法表明,較高的虛弱指數(shù)仍與 PD和 FD的風(fēng)險(xiǎn)升高有關(guān),反向結(jié)果也顯示抑郁癥患者的虛弱指數(shù)更高。敏感性分析也支持這種雙向因果關(guān)系,在調(diào)整?PA 后,這種雙向因果關(guān)系仍然穩(wěn)定(表2)。
表2 多變量MR分析
小結(jié)
這篇文章首先選擇了精神類(lèi)疾病這個(gè)熱門(mén)方向,分析方法雖然比較常規(guī)簡(jiǎn)單的,但數(shù)據(jù)使用和內(nèi)容設(shè)計(jì)比較豐富,利用多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行分析驗(yàn)證,并且是做的雙向MR分析,這些都是妥妥的加分項(xiàng),一把就拿下了13分+的science子刊,效果非常棒!還在觀(guān)望的朋友,留給你猶豫的時(shí)間可不多了喲,隨著MR文章的大爆發(fā),高分文章的發(fā)文難度就會(huì)變大,早上車(chē)早發(fā)文!?