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數(shù)據(jù)挖掘生物信息學(xué):學(xué)習(xí)高通量測序技術(shù)的最新進展!

2023-08-04 16:41 作者:喜歡學(xué)習(xí)的WCJ  | 我要投稿

人工智能生物學(xué)分析算法是處理生物網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)的有效方法,它構(gòu)建機器或程序來模擬人類智能,從而在生物網(wǎng)絡(luò)中實現(xiàn)分類、聚類和預(yù)測任務(wù)。在過去的幾十年里,我們看到了人工智能生物學(xué)分析算法的快速發(fā)展。機器學(xué)習(xí)在生物信息學(xué)中的應(yīng)用非常廣泛,它可以具體應(yīng)用到以下這些情況:


1.基因序列分析:機器學(xué)習(xí)可以幫助研究人員理解基因序列中的模式。例如,支持向量機(SVM)和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)可以用于基因分類和基因表達數(shù)據(jù)分析。另外,深度學(xué)習(xí)方法,如卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)也被用于識別基因序列中的特定模式。


2.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測:機器學(xué)習(xí)可以用于預(yù)測蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。最近,DeepMind的AlphaFold算法利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測中取得了突破性的進展。


3.表觀遺傳學(xué):機器學(xué)習(xí)也被用于理解和預(yù)測表觀遺傳標(biāo)記。例如,隨機森林和梯度增強機都被用于預(yù)測 DNA 甲基化。


4.藥物發(fā)現(xiàn):在藥物發(fā)現(xiàn)中,機器學(xué)習(xí)可以幫助預(yù)測藥物的效果,降低藥物研發(fā)的成本和時間。例如,深度學(xué)習(xí)可以用于預(yù)測化合物的毒性,藥效和藥物靶點。



如果您在從事生物醫(yī)學(xué)方面的研究 并且有發(fā)頂刊的想法


下面這篇內(nèi)容會給你思路和方法


九大專題內(nèi)容


專題一:CRISPR-Cas9基因編輯專題線上培訓(xùn)


專題二:蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析實踐應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題三:深度學(xué)習(xí)在基因組學(xué)實踐應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題四:機器學(xué)習(xí)微生物組學(xué)應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題五:機器學(xué)習(xí)代謝組學(xué)專題線上培訓(xùn)


專題六:機器學(xué)習(xí)轉(zhuǎn)錄組與表觀組學(xué)應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題七:深度學(xué)習(xí)單細胞實踐應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題八:CADD藥物設(shè)計應(yīng)用專題線上培訓(xùn)


專題九:AIDD人工智能藥物發(fā)現(xiàn)專題線上培訓(xùn)




學(xué)習(xí)目標(biāo)


【CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)】專題課程從全局出發(fā),由淺入深,課程通過基礎(chǔ)入門+應(yīng)用案例實操演練的方式,從最初的原理講解到最后的應(yīng)用實戰(zhàn),學(xué)完本課程你將掌握基因編輯技術(shù)的相關(guān)原理及其應(yīng)用,此外可以學(xué)到基因編輯系統(tǒng)的優(yōu)化策略,可以學(xué)到如何操作常用的生物學(xué)軟件。能夠快速運用到自己的科研項目和課題上。


【蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析】蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析課程讓學(xué)員了解蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)解析的原理、方法與技術(shù),學(xué)習(xí)分子克隆、蛋白表達純化、蛋白結(jié)晶方法、軟件安裝,蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)處理,得到高分辨率的蛋白晶體結(jié)構(gòu)。使學(xué)員通過本次課程的學(xué)習(xí),很輕松地解析出蛋白晶體結(jié)構(gòu),并進行晶體結(jié)構(gòu)的精修。


【深度學(xué)習(xí)基因組學(xué)】課程通過基礎(chǔ)入門+應(yīng)用案例實操演練的方式,從初學(xué)及應(yīng)用研究的角度出發(fā),帶大家實戰(zhàn)演練多種深度學(xué)習(xí)模型在基因組學(xué)分析中的各種應(yīng)用,深入剖析多篇高分文章代碼演示及文章復(fù)現(xiàn),通過對這些深度學(xué)習(xí)在基因組學(xué)中的應(yīng)用案例進行深度講解和實操,讓學(xué)員能夠掌握深度學(xué)習(xí)分析高維基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)等多組學(xué)數(shù)據(jù)流程,系統(tǒng)學(xué)習(xí)深度學(xué)習(xí)及基因組學(xué)理論知識及熟悉軟件代碼實操,熟練掌握這些前沿的分析工具的使用以及研究創(chuàng)新深度學(xué)習(xí)算法解決生物學(xué)及臨床疾病問題與需求。


【機器學(xué)習(xí)代謝組學(xué)】熟悉代謝組學(xué)和機器學(xué)習(xí)相關(guān)硬件和軟件;熟悉代謝組學(xué)從樣本處理到數(shù)據(jù)分析的全流程;能復(fù)現(xiàn)至少1篇CNS或子刊級別的代謝組學(xué)文章圖片。


【機器學(xué)習(xí)轉(zhuǎn)錄組學(xué)與表觀組學(xué)】本課程學(xué)員將學(xué)習(xí)如何處理和分析轉(zhuǎn)錄組和表觀組數(shù)據(jù),并深入了解這兩個領(lǐng)域的關(guān)鍵概念和最新發(fā)展。課程內(nèi)容包括Linux操作系統(tǒng)的基礎(chǔ)知識和常用命令行技巧,R編程語言的應(yīng)用,轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的預(yù)處理和差異表達分析,表觀組數(shù)據(jù)的分析方法,以及綜合應(yīng)用和實際項目實踐。此外,課程還注重培養(yǎng)學(xué)員獨立進行轉(zhuǎn)錄組和表觀組學(xué)研究的能力,為他們在這一領(lǐng)域的進一步發(fā)展和應(yīng)用打下堅實的基礎(chǔ)。


【深度學(xué)習(xí)單細胞分析】通過高分文獻和代碼實操,解析課單細胞深度的課題套路,助力完成學(xué)員自己的高分文章!


【機器學(xué)習(xí)微生物】通過本次培訓(xùn)多個案例的系統(tǒng)講解讓參會學(xué)員學(xué)會機器學(xué)習(xí)在微生物組數(shù)據(jù)分析流程,能夠快速運用到自己的科研項目和課題上。


【CADD藥物設(shè)計與AIDD藥物設(shè)計】CADD計算機輔助藥物設(shè)計設(shè)計流程,讓學(xué)員能夠掌握包括PDB數(shù)據(jù)庫、靶點蛋白、蛋白質(zhì)-配體、蛋白-配體小分子、蛋白-配體結(jié)構(gòu)、notepad的介紹和使用、分子對接、蛋白-配體對接、虛擬篩選、蛋白-蛋白對接、蛋白-多糖分子對接、蛋白-水合對接、Linux安裝、gromacs分子動力學(xué)全程實操、溶劑化分子動力學(xué)模擬


【AIDD人工智能藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計】課程讓學(xué)員了解藥物發(fā)現(xiàn)的前沿背景,學(xué)習(xí)人工智能領(lǐng)域的各類常見算法,熟悉工具包的安裝與使用,掌握一定的算法編程能力,能夠運用計算機方法研究藥物相關(guān)問題。通過大量的案例講解和實踐操作,具備一定的AIDD模型構(gòu)建和數(shù)據(jù)分析能力。


最后,對以上專題內(nèi)容感興趣的老師,可訪問(https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg3Mzg5OTI5Mw==&mid=2247485948&idx=1&sn=0ce970b6a974e31b3f3109c9b5cb3289&chksm=ced9bd8ef9ae34981b3bff6569a862b7ebcad9eb9ef9854ad30d9a02b5a5fbbc2f57a920d7d8#rd)了解或者添加V.X交流學(xué)習(xí):LIv51666?


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