磷酸化修飾具有簡(jiǎn)單、靈活、可逆的特性，以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性，是真核細(xì)胞中常見(jiàn)的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過(guò)程，幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮、新陳代謝及腫瘤發(fā)生等生命活動(dòng)的所有過(guò)程。而隨著高通量蛋白組學(xué)技術(shù)的發(fā)展，研究者的研究過(guò)程中產(chǎn)生了海量的磷酸化組學(xué)數(shù)據(jù)，但是怎么樣分析利用這種龐大的數(shù)據(jù)是一個(gè)大問(wèn)題，今天小編給大家介紹的這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)完成了收集、整合的工作，可以為大家研究磷酸化信號(hào)通路提供幫助。

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qPhos: http://qphos.cancerbio.info/

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使用上，網(wǎng)站的用戶(hù)體驗(yàn)還是不錯(cuò)的，網(wǎng)站首頁(yè)提供快速搜索框。

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在網(wǎng)站的Browse欄，用戶(hù)可以瀏覽不同實(shí)驗(yàn)條件下、不同細(xì)胞株、不同基因的磷酸化信息。點(diǎn)擊其中一個(gè)就會(huì)自動(dòng)搜索跳轉(zhuǎn)，展示結(jié)果，同時(shí)也可以在結(jié)果展示欄里添加條件過(guò)濾結(jié)果。

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結(jié)果欄里包含蛋白在Uniprot的編號(hào)、基因名、磷酸化的氨基酸在蛋白中的位置、序列信息、樣本名、樣本類(lèi)型、實(shí)驗(yàn)條件、檢測(cè)方法、磷酸化差異結(jié)果及顯著性。每一個(gè)條件都可以進(jìn)行過(guò)濾篩選。

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點(diǎn)擊+號(hào)可以查看更多詳細(xì)信息：

Aboutexperiment欄是關(guān)于該位點(diǎn)結(jié)果的實(shí)驗(yàn)信息。

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Potential kinases and their inhibitors?欄是展示可能修飾該蛋白的蛋白激酶和這些激酶的抑制劑，抑制劑的信息是從Drugbank獲取的。

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Sequence and structure欄展示蛋白的序列和結(jié)果信息，通過(guò)移動(dòng)箭頭所指的灰色柱子的位置可以查看蛋白不同位置的信息，包括無(wú)序區(qū)域、二級(jí)結(jié)構(gòu)和表面可及性。

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About protein欄則包含了關(guān)于蛋白的其他各種信息

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除了Browse欄，Search欄則提供了高級(jí)搜索模式，使用界面簡(jiǎn)潔

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作為數(shù)據(jù)庫(kù)的另一個(gè)亮點(diǎn)qKinAct，qPhos收集了所有已知與激酶活性相關(guān)的磷酸化位點(diǎn)，用戶(hù)可通過(guò)提交定量磷酸化蛋白組的數(shù)據(jù)，而得到激酶譜被激活的情況供用戶(hù)參考。使用時(shí)，用“*”表示被修飾的磷酸化位點(diǎn)。

這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)于研究磷酸化與疾病相關(guān)的研究者來(lái)說(shuō)真是福音啊。

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