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血漿蛋白質(zhì)組在腫瘤領(lǐng)域中的研究進(jìn)展與思路,你該知道的,都在這里了...

2023-09-06 17:19 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

腫瘤(Tumor)是機(jī)體在各種致癌因素作用下,局部組織的某一個(gè)細(xì)胞在基因水平上失去對(duì)其生長(zhǎng)的正常調(diào)控,導(dǎo)致其克隆性異常增生而形成的新生物。一般將腫瘤分為良性和惡性兩大類。良性腫瘤一般稱為“瘤”,惡性腫瘤來(lái)自上皮組織者稱為“癌”。利用蛋白質(zhì)組學(xué)的力量進(jìn)行的癌癥生物學(xué)研究可以在多個(gè)層面有效地用于研究癌癥和改善癌癥的治療。

迄今為止,蛋白質(zhì)組學(xué)已經(jīng)成為生物學(xué)研究的基本組成部分,并被認(rèn)為是發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物和個(gè)性化治療的關(guān)鍵方法。血漿被認(rèn)為是蛋白質(zhì)組學(xué)分析的合適基質(zhì)。血液有一個(gè)復(fù)雜的蛋白質(zhì)組,反映了許多組織蛋白質(zhì)組亞群。血漿的動(dòng)態(tài)特性反映了患者的不同身體狀態(tài),從而有可能在空間和時(shí)間上監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展,從而更全面地了解腫瘤發(fā)生中的分子事件。

今天,小編為大家總結(jié)了近年來(lái)血漿蛋白組在腫瘤研究領(lǐng)域的研究策略。更多精彩,繼續(xù)在本周四(9月7號(hào))下午在青蓮直播間為大家呈現(xiàn),歡迎各位老師前來(lái)討論。

腫瘤血漿蛋白質(zhì)組研究進(jìn)展

血漿蛋白組學(xué)是尋找早期診斷生物標(biāo)志物的更全面、更穩(wěn)定的亞蛋白質(zhì)組學(xué),具有更高的臨床轉(zhuǎn)化價(jià)值,與臨床化學(xué)參數(shù)具有很強(qiáng)的相關(guān)性。2010年悉尼人類蛋白質(zhì)組組織會(huì)議上提出人類血漿蛋白質(zhì)組計(jì)劃啟動(dòng)后,對(duì)于腫瘤的血漿蛋白質(zhì)組檢測(cè)的研究層出不窮。針對(duì)于肺癌,肝癌,乳腺癌,結(jié)腸癌等疾病的診斷標(biāo)志物,診斷/預(yù)后模型和分子機(jī)制的研究成果陸續(xù)發(fā)表。


圖1:血漿蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤領(lǐng)域文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)(pubmed)


圖2:血漿蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤研究中應(yīng)用的高分文章(部分)

腫瘤血漿蛋白質(zhì)組研究思路

阿根廷生物與醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)研究所于2023年在《Clinical Cancer Research》上發(fā)表的關(guān)于米非司酮的乳腺癌治療效果的研究中,對(duì)20例管腔型乳腺癌患者的蛋白質(zhì)組和轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè),篩選乳腺癌驅(qū)動(dòng)基因和蛋白。對(duì)比米非司酮治療前后患者的蛋白質(zhì)組和基因組,指出米非司酮在該隊(duì)列患者中具有抗增殖作用,并揭示了解釋其治療作用的關(guān)鍵生物過(guò)程。


圖3:多組學(xué)表征米非司酮的乳腺癌治療效果[1]

福建醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院于2023年在《Journal of the American Academy of Dermatology》發(fā)表關(guān)于Stevens-Johnson 綜合征 (SJS) 和中毒性表皮壞死松解癥 (TEN)的預(yù)后標(biāo)志物篩選研究中,對(duì)83例SJS/TEN患者分別接受甲潑尼龍單藥治療和阿達(dá)木單抗聯(lián)合治療。阿達(dá)木單抗聯(lián)合糖皮質(zhì)激素治療能夠有效改善SJS/TEN患者的臨床表型。通過(guò)檢測(cè)患者的血漿蛋白質(zhì)組,篩選出APOA4作為SJS/TEN的預(yù)后標(biāo)志物。


圖4:血漿蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)SJS/TEN預(yù)后標(biāo)志物[2]

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院于2023年在《Biomarker Research》發(fā)表該實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的非小細(xì)胞肺癌的診斷模型的研究。對(duì)于110名接受治療的NSCLC患者、108名良性肺部疾?。˙PD)患者和100名健康對(duì)照(HC),采用TMT-LC-MS/MS技術(shù)檢測(cè)中不同人群中的蛋白質(zhì)組。使用邏輯回歸算法構(gòu)建高性能非小細(xì)胞肺癌篩選模型并通過(guò)測(cè)試集驗(yàn)證了模型的準(zhǔn)確性。


圖5:血漿蛋白質(zhì)組分析構(gòu)建肺癌診斷模型[3]

通過(guò)不同文章的研究思路分析,不難發(fā)現(xiàn)血漿蛋白質(zhì)組在腫瘤領(lǐng)域相關(guān)文章常用的研究策略。基于不同樣本的血漿蛋白質(zhì)組和其他組學(xué)分析進(jìn)行模型構(gòu)建,根據(jù)組學(xué)差異評(píng)價(jià)藥物療效,篩選腫瘤的特征標(biāo)志物,為腫瘤的診斷和檢測(cè)提供數(shù)據(jù)指導(dǎo),為腫瘤發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究提供數(shù)據(jù)支撐。


圖6:腫瘤血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究思路

系列直播課第二期,腫瘤研究領(lǐng)域的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)

為了幫助大家將血漿蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)更好的應(yīng)用于自己的研究中,青蓮百奧直播間將在金秋九月為大家?guī)?lái)《“血”無(wú)止境—血漿蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)與應(yīng)用》系列直播課,為大家深度剖析血漿蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤、心血管、神經(jīng)、感染四大應(yīng)用領(lǐng)域的研究進(jìn)展和研究思路,以及血漿蛋白質(zhì)組學(xué)樣本前處理、質(zhì)譜檢測(cè)、生物信息挖掘等環(huán)節(jié)的最新方法策略。

《血漿蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)與應(yīng)用》系列直播課第二期將本周四(9月7日)下午啟航,為大家進(jìn)行血漿蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤研究中進(jìn)展、趨勢(shì)和研究策略的全面、深入解讀,涵蓋腫瘤診斷,泛癌圖譜,腫瘤預(yù)后標(biāo)志物篩選,治療療效評(píng)價(jià)等不同方向。更多研究套路,等你來(lái)聽(tīng)~



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