在分析質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)時(shí)，我們經(jīng)常會(huì)遇到這樣的情況：Blastn比對(duì)結(jié)果顯示高相似性的同源序列僅與樣本序列中的部分區(qū)域匹配。這種情況通常表示該質(zhì)粒各部分序列分屬不同的來(lái)源。而且很可能是質(zhì)粒間通過(guò)同源重組等方式發(fā)生質(zhì)粒融合的結(jié)果。特別是對(duì)于攜帶耐藥基因與毒力基因的菌株而言，若是在同一質(zhì)粒中同時(shí)出現(xiàn)多種罕見(jiàn)的耐藥基因（如mcr-1和blaNDM-5），或是耐藥基因與毒力基因共存的情況（如肺炎克雷伯菌），將會(huì)給人類帶來(lái)巨大的危害，因?yàn)樗砹诉@些基因可能借助雜合質(zhì)粒發(fā)生水平共轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。那么若是我們需要對(duì)雜合質(zhì)粒各部分序列片段的來(lái)源進(jìn)行分析，把握基因組的細(xì)節(jié)特征，就可以借助Easyfig軟件進(jìn)行基因簇的圖示化展示。

下圖便是利用Easyfig軟件展示的雜合質(zhì)粒pCQ02-121及其各耐藥基因的來(lái)源情況，該質(zhì)粒mcr-1和blaNDM-5所在的區(qū)域分別來(lái)自pMCR1_IncX4樣和pNDM5_IncX3樣質(zhì)粒。關(guān)于這篇文章的解讀可以參考我們的軟文（https://mp.weixin.qq.com/s/NSNE0n_-6ao1C67dU2yRsw）。

DOI：10.1038/nmicrobiol.2016.176

而下圖的p17-15-vir質(zhì)粒為耐藥-毒力雜合質(zhì)粒，其耐藥基因部分來(lái)源于p17-16-CTX樣質(zhì)粒，毒力基因部分則來(lái)源于p17-16-vir樣質(zhì)粒。同樣該圖也是使用Easyfig軟件進(jìn)行繪制。

DOI: 10.1016/j.ijantimicag.2020.105952

我們已經(jīng)上線的《基于Easyfig軟件實(shí)現(xiàn)基因簇結(jié)構(gòu)比較及雜合質(zhì)粒形成分子證據(jù)研究》是一門軟件教學(xué)課程，力求教會(huì)大家如何通過(guò)easyfig軟件解決比較基因組研究中的常見(jiàn)熱點(diǎn)問(wèn)題，如雜合質(zhì)粒形成的分子證據(jù)研究等。

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