一 起因

在之前的推文中有介紹過如何在pypi上打包發(fā)布python package，然而，真正打包的時候卻發(fā)現(xiàn)過程并不是那么順暢。因此，本次將推出一個補(bǔ)充版，方便相應(yīng)的讀者在遇到這一問題時進(jìn)行修正或者避坑（所以說，關(guān)注本公眾號，技術(shù)的傳播不僅僅只有講解，還有持續(xù)更新）。二 修正過程

Let's start。一開始，筆者是在windows系統(tǒng)中進(jìn)行python的打包（打包時的路徑與src相同）。然而，打包后tar.gz文件將系統(tǒng)的絕對路徑打包到壓縮包中，即在src文件夾下打包的文件實(shí)際上是包含src -> F -> temp ->?package_name -> src->?package_name這一路徑的。而打包后壓縮文件內(nèi)路徑應(yīng)該是從package_name -> package_name

然而，打包后tar.gz文件將系統(tǒng)的絕對路徑打包到壓縮包中，即在src文件夾下打包的文件實(shí)際上是包含src -> F -> temp -> package_name -> package_name這一路徑的。因此，引用包時，需要下面的操作才能實(shí)現(xiàn)函數(shù)的調(diào)用（顯然不合理）。

而筆者希望打包后壓縮文件內(nèi)路徑應(yīng)該是從package_name ->?package_name，這樣在安裝相應(yīng)的模塊之后，只需要通過輸入以下命令即可實(shí)現(xiàn)函數(shù)的調(diào)用（簡單清爽）。

因此，在多次嘗試后，筆者發(fā)現(xiàn)在linux/ubtuntu系統(tǒng)中打包才能避免這種現(xiàn)象的發(fā)生。因此，下文打包方法的示例均是在ubtuntu環(huán)境中完成的。

首先，創(chuàng)建一個新目錄用于python包安裝。這樣做的主要目的是為了防止不同python包間的相互影響，具體可見之前的推文《如何不污染服務(wù)器的python的包環(huán)境》

其次，必然是創(chuàng)建下載包的安裝目錄啦（pypi_install），至于原因嘛，在之前的推文《如何不污染服務(wù)器的python的包環(huán)境》里有解釋。

第三，安裝打包所必須的依賴包

第四，就是將需要發(fā)布的包打包（build）

最后，上傳即可（twine命令）。

不過，這里也有兩個小貼士：

1 在ubtuntu系統(tǒng)下使用python3打包的速度非常慢，且可能出現(xiàn)無法上傳的現(xiàn)象。但是采用python進(jìn)行上傳，則無比的絲滑（然而，我的python和python3都是同一版本，略顯神奇，有懂得大神可以指導(dǎo)一下）

2 ?如果讀者之前曾上傳過同樣的包，那么后續(xù)再上傳的時候則會出現(xiàn)報(bào)錯。此時，有兩種解決方法：一是刪除原有包（不建議），另外一種則是發(fā)布迭代版本，比如從0.0.1迭代到0.02再發(fā)布。

三 慣例小結(jié)

上述教程只是算是對前一篇推文的補(bǔ)充。然而，即使這樣，也可能無法避免疏漏。另外，筆者能力有限，所提供的方法也不一定是最簡便的（對于筆者而言，目前用起來還不錯）。因此，本公眾號也歡迎其他大神可以不吝賜教。

本公眾號開發(fā)的相關(guān)軟件，Multi-omics Hammer軟件和Multi-omics Visual軟件歡迎大家使用。文末是本公眾號在其他平臺的賬戶，也歡迎大家關(guān)注并多提意見。

Multi-omics Hammer軟件下載地址：

https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer

Multi-omics Visual軟件下載地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual/releases/tag/Multi_omics_Visual_v1.03

PS：因?yàn)楸拒浖怯胮ython腳本撰寫，調(diào)用了部分依賴包，用戶首次使用需要安裝python以及對應(yīng)的包，安裝之后便可永久使用。

本公眾號開發(fā)的相關(guān)軟件，Multi-omics Hammer軟件和Multi-omics Visual軟件歡迎大家使用。文末是本公眾號在其他平臺的賬戶，也歡迎大家關(guān)注并多提意見。

簡書：WJ的生信小院

公眾號：生信小院

博客園：生信小院

最后，也歡迎各位大佬能夠在本平臺上：1傳播和講解自己發(fā)表的論文；2：發(fā)表對某一科研領(lǐng)域的看法；3：想要達(dá)成的合作或者相應(yīng)的招聘信息；4：展示自己以尋找博后工作或者博士就讀的機(jī)會;5:博導(dǎo)提供博后工作或者博士攻讀機(jī)會，都可以后臺給筆者留言。希望本平臺在進(jìn)行生信知識分享的同時，能夠成為生信分析者的交流平臺，能夠?qū)崿F(xiàn)相應(yīng)的利益互補(bǔ)和雙贏（不一定能實(shí)現(xiàn)，但是夢想總得是有的吧）。

另外，怎么說呢，投幣也可，不強(qiáng)求，但奢求。?