Fiji ImageJ for Mac是Mac大神搜集的一款 Mac上的專業(yè)的科研圖像處理軟件，這個名字其實就是：Fiji is just ImageJ 的首字母。

今天和大家分享最新的 2.3.0 版本。Fiji和ImageJ1的區(qū)別就是：Fiji自動包含了各種有用的插件，而ImageJ1需要手動安裝插件，Fiji易于安裝，并具有自動更新功能，捆綁了許多插件，并提供全面的文檔。在生物及醫(yī)學圖像分析中起著非常重要的作用！

應用介紹

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Fiji是一個圖像處理包——ImageJ2的“包含電池”發(fā)行版，捆綁了許多有助于科學圖像分析的插件。

歡迎來到 ImageJ2！
ImageJ2 旨在擴展 ImageJ 的功能，使其超越 ImageJ 1.x 的限制，以支持下一代多維科學成像。
為了確保向后兼容性，我們將 ImageJ2 設計為完全集成到現有的 ImageJ 用戶界面中。這使您可以繼續(xù)以熟悉的方式使用 ImageJ，同時提供根據需要遷移到更強大的新功能的能力。
ImageJ 的 Fiji 發(fā)行版與 ImageJ2 的 beta 版本一起發(fā)布已經有一段時間了，因此您可能已經熟悉 ImageJ2 的一些功能——其中一些功能，例如 Updater 和 Launcher，最初是作為 Fiji 的一部分開發(fā)的。
ImageJ2 的特點
ImageJ2 提供了豐富的新特性和功能：
ImageJ 更新器使保持您的 ImageJ 保持最新狀態(tài)變得簡單，并通過啟用其他更新站點來添加新插件。
通過 SCIFIO 庫提供新的和增強的文件格式支持（見下文）。
更強大的腳本編輯器，支持多種腳本語言。
新命令：
插件 > 調試 > 轉儲堆棧，用于在掛起時進行調試）。
插件 > 調試 > 系統信息，用于報告已安裝插件和庫的版本。
使用 ImageJ2 的基于 ImgLib2 的 N 維數據結構（仍處于測試階段）。
編寫參數化命令和腳本：
類型化的輸入和輸出不依賴于 AWT 用戶界面。
混合和匹配 ImageJ 1.x 和 ImageJ2 數據結構。
插件自動出現在菜單中，沒有 plugins.config 文件。
在許多情況下可重復使用：KNIME、CellProfiler、OMERO、無頭……
ImageJ2 不僅僅是一個應用程序
ImageJ2 也是建立在 SciJava 軟件堆棧上的可重用軟件庫的集合，使用強大的插件框架來促進快速開發(fā)和無痛的用戶定制。
以下軟件組件庫構成了 ImageJ2 的核心：
ImageJ Common – 使用 ImgLib2 的核心圖像數據模型。
ImageJ OPS – 可重用圖像處理算法的可擴展框架。
ImageJ Updater – 一種在 ImageJ 中更新單個插件和庫的機制。
ImageJ Legacy – 提供與 ImageJ 1.x 的完全向后兼容性。
SciJava Common – 插件、模塊和應用程序本身的核心框架。
使用 SCIFIO 庫改進圖像 I/O
ImageJ2 默認使用 SCIFIO 庫（科學圖像格式輸入和輸出）來處理大多數圖像輸入任務。您可以隨時通過運行編輯 > 選項 > ImageJ2 并修改打開文件時使用 SCIFIO 選項來更改此行為。
使用 SCIFIO 的好處
SCIFIO 專注于對讀取和寫入圖像文件格式的強大且可擴展的支持。將它與 ImageJ 一起使用提供了許多優(yōu)點：
無需調用專門的 SCIFIO 插件；它適用于“文件”>“自動打開”等命令。
通過 `File > Import > Image…` 命令可以使用其他導入選項。
有一個用于 SCIFIO 的 Bio-Formats 插件，包含在 ImageJ 的斐濟發(fā)行版中，它增加了對一百多種生命科學文件格式的自動支持。
其他 SCIFIO 文件格式插件可以放入 ImageJ 中，并且也將自動運行。
與 ImageJ 1.x TIFF 實現不同，SCIFIO 對 TIFF 的支持遵循規(guī)范，允許成功讀取更多種類的 TIFF。
同樣，SCIFIO 支持更多種類的 JPEG 文件，因為它使用自己的 JPEG 解碼器。
SCIFIO 還支持多種 QuickTime 編解碼器，即使在沒有 QuickTime for Java 的情況下，ImageJ 也可以在 64 位模式下讀取 QuickTime MOV 文件。
SCIFIO 支持許多開箱即用的其他打開文件格式：
動畫 GIF
動畫PNG
封裝后記 (EPS)
JPEG-2000
微管理器數據集
多圖像網絡圖形 (MNG)
近乎原始的柵格數據 (NRRD)
檢查員 OBF
OME-TIFF（多維豐富元數據 TIFF）
OME-XML
PCX
PICT（即使在 64 位模式下和/或未安裝 QuickTime for Java）
如果 SCIFIO 無法處理圖像文件，它會退回到 ImageJ 1.x。
您可以使用 `File > Export > Image…` 命令保存為 SCIFIO 支持的文件格式。支持的導出格式包括：
APNG
AVI
每股收益
集成電路
JPEG
JPEG2000
快速時間
國際電影節(jié)
SCIFIO 的當前限制
SCIFIO 仍處于測試階段，因此錯誤的發(fā)生率可能更高?？梢栽?SCIFIO 問題跟蹤器上報告問題。
盡管我們力求完全向后兼容，但某些文件在打開時可能會略有不同。
使用 SCIFIO 打開文件還不能完全錄制宏