孟德爾隨機(jī)化研究-SCI新寵兒

哎呀呀不關(guān)注白嫖好像不太好
等我看完再一鍵三連
孟德爾隨機(jī)化
- 因果推斷
- 以遺傳變異為工具變量
- 推導(dǎo)暴露和結(jié)局的因果關(guān)系
- 避免傳統(tǒng)流行病學(xué)研究的混雜偏倚
- 遺傳變異:GWAS;SNP及等位基因、MAF值、eaf值;單倍型;連鎖不平衡
SNP
- 單核苷酸多態(tài)性
GWAS
- 全基因組關(guān)聯(lián)研究人類疾病相關(guān)的遺傳變異
- 主要關(guān)心與特定形狀相關(guān)的snp火基因
- 數(shù)據(jù)獲?。篽ttps://gwas.mrcieu.ac.uk/
主要和次要等位基因
- 指頻率位次,即通俗的野生型突變型
MAF值
- 次要等位基因頻率(以普遍理性而論小于0.5)
- 用PLINK(某開源軟件)計(jì)算
REF與ALT
- reference alternative
- 與頻率無關(guān),決定因素是參考基因組中該位點(diǎn)的基因(個(gè)人理解,比如選了突變型a,那突變型a中的該基因就是REF,其他可能出現(xiàn)的野生型和突變型bcd均為ALT)
效應(yīng)等位基因/其他等位基因
- 對(duì)表型有貢獻(xiàn)的
- 一般是minor
- eaf:effect allele frequency
- MAF eaf在計(jì)算r方(因?yàn)樵撐稽c(diǎn)突變作為危險(xiǎn)因素)時(shí)可等價(jià)
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