大家好，歡迎觀看《時空日報》第8期。本期追蹤到時空/單細胞組學(xué)相關(guān)研究文章共計5篇。以下是應(yīng)用華大時空StereoCopilot生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1、CDKN2A缺失與WWTR1(TAZ)-CAMTA1基因融合協(xié)同促進上皮樣血管內(nèi)皮瘤的腫瘤進展

Loss of?CDKN2A?cooperates with?WWTR1(TAZ)-CAMTA1?gene fusion to promote tumor progression in epithelioid hemangioendothelioma

Clinical Cancer Research; IF: 11.500; DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-22-2497

內(nèi)容概要：結(jié)合組織學(xué)表征和scRNA-seq分析，評估CDKN2A基因缺失對上皮樣血管內(nèi)皮瘤（epithelioid hemangioendothelioma，EHE）腫瘤發(fā)生的影響。結(jié)果顯示，CDKN2A基因缺失增強了EHE的體內(nèi)致瘤性，并促使了該疾病的第一批細胞系的產(chǎn)生。此外，通過建立EHE細胞系，提供了治療EHE或其他WWTR1（TAZ）驅(qū)動癌癥的強有力模型系統(tǒng)。

2、HER2+轉(zhuǎn)移性食管胃癌生存期的決定因素

Determinants of survival in HER2+?metastatic esophagogastric cancer

Clinical Cancer Research; IF: 11.500; DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-22-3769

內(nèi)容概要：該研究報告了派姆單抗、曲妥珠單抗和化療治療轉(zhuǎn)移性食管胃癌的II期研究的最新臨床結(jié)果，以及獨立MSK隊列的結(jié)果，強調(diào)了確定基線患者腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和對HER2+食管胃癌患者進行連續(xù)ctDNA監(jiān)測的臨床意義，以識別治療耐藥的早期證據(jù)，從而指導(dǎo)主動治療的升級或降級。

3、乳腺癌中存在一種罕見的伴有細胞外基質(zhì)重塑和dsRNA-IFN1信號過度激活的原發(fā)性腫瘤細胞亞群

A rare subset of primary tumor cells with concomitant hyperactivation of extracellular matrix remodeling and dsRNA-IFN1 signaling metastasizes in breast cancer

Cancer Research; IF: 11.200; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-22-2717

內(nèi)容概要：聯(lián)合慢病毒條形碼（lentiviral barcoding）和scRNA-seq技術(shù)，追蹤乳腺癌轉(zhuǎn)移過程中的克隆和轉(zhuǎn)錄演變，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)移瘤來源于罕見的促轉(zhuǎn)移克隆，這些克?。ê币娂毎┰谠l(fā)性腫瘤中占比較低，并表現(xiàn)出同時高度激活細胞外基質(zhì)重塑和dsRNA-IFN信號通路的特征。該研究結(jié)果揭示了乳腺癌轉(zhuǎn)移的先前未知機制，并提供了預(yù)后預(yù)測和轉(zhuǎn)移預(yù)防的治療靶點。

4、TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. 一種通過配體-受體相互作用解析分子通信的在線工具

TALKIEN: crossTALK IntEraction Network. A web-based tool for deciphering molecular communication through ligand-receptor interactions

Molecular Omics; IF: 2.900; DOI: 10.1039/d3mo00049d

內(nèi)容概要：TALKIEN: crossTALK IntEraction Network.是一個簡單、直觀的在線R/shiny應(yīng)用程序（https://www.odap-ico.org/talkien），用于可視化蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，以解密通過配體-受體相互作用的分子通信。此外，它還擴展了顯示下游受體的通路網(wǎng)絡(luò)。TALKIEN允許用戶選擇不同的圖形布局，執(zhí)行功能分析，并提供有關(guān)靶向受體的藥物信息。

5、scRNA-seq揭示卵巢癌細胞中的促轉(zhuǎn)移亞群和驅(qū)動轉(zhuǎn)錄因子NFE2L1

Single-cell RNA sequencing reveals a pro-metastatic subpopulation and the driver transcription factor NFE2L1 in ovarian cancer cells

Genes and Genomics; IF: 2.100; DOI: 10.1007/s13258-023-01418-1

內(nèi)容概要：使用scRNA-seq對兩種人類卵巢癌細胞系SKOV-3和SKOV-3-13（SKOV-3的高度轉(zhuǎn)移亞克?。┻M行分析，發(fā)現(xiàn)存在一組促轉(zhuǎn)移細胞亞群，并確定了轉(zhuǎn)錄因子NFE2L1是其驅(qū)動因素。抑制NFE2L1的表達可以顯著降低兩種細胞系的遷移和存活能力。

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