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python機(jī)器學(xué)習(xí)-乳腺癌細(xì)胞挖掘（二）

2020-07-27 08:00 作者:python_biology 0人讀過 | 我要投稿

python機(jī)器學(xué)習(xí)-乳腺癌細(xì)胞挖掘:http://dwz.date/bwey

上節(jié)課介紹了乳腺癌，我國乳腺癌患病率以及不斷上升發(fā)病率。乳腺癌實(shí)際成為政府一個沉重醫(yī)療財(cái)政負(fù)擔(dān)。運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)對乳腺癌預(yù)測非常有臨床科研意義，為廣大醫(yī)生和科研人員提供數(shù)據(jù)參考。這節(jié)課我將介紹如何搭建python編程環(huán)境，為建立乳腺癌預(yù)測模型做好準(zhǔn)備。

sklearn編程環(huán)境搭建

（1）下載anaconda

首先下載anaconda，這款框架比Python官網(wǎng)的編輯器更好用，下載網(wǎng)址為https://www.anaconda.com/download/

anaconda支持windows,linux,蘋果操作系統(tǒng)

支持32位和64位操作系統(tǒng)

（2）導(dǎo)入sklearn第三方包

anaconda下載安裝好后打開，自帶sklearn第三方包

命令行輸入import sklearn，無報(bào)錯就表示運(yùn)行正常

（3）pip install安裝其他第三方包

機(jī)器學(xué)習(xí)中，有時(shí)候需要導(dǎo)入其他包，而sklearn沒有，這時(shí)就需要用pip install安裝其他第三方包

（4）非官方擴(kuò)展包下載地址

有時(shí)候pip install安裝失敗，我們需要去歐文大學(xué)下載Python非官方擴(kuò)展包

Python有大量非官方擴(kuò)展包，應(yīng)用于各行各業(yè)，主要是數(shù)據(jù)科學(xué)，人工智能，爬蟲等等，下載地址為

https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

Anaconda下載和安裝指南

Anaconda指的是一個Python集成開發(fā)軟件，號稱有兩千萬用戶。Anaconda基于云的存儲庫，可查找并安裝超過7,500個數(shù)據(jù)科學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)模塊。

Anaconda官網(wǎng)：https://www.anaconda.com/

?Anaconda使用conda-install命令，您可以開始使用數(shù)千個開源模塊。因?yàn)榘舜罅康目茖W(xué)包，Anaconda 的下載文件比較大500 MB左右。不同版本Anaconda大小不一樣。如果只需要某些包，或者需要節(jié)省帶寬或存儲空間，也可以使用Miniconda這個較小的發(fā)行版（僅包含conda和 Python）。conda是一個開源的包、環(huán)境管理器，可以用于在同一個機(jī)器上安裝不同版本的軟件包及其依賴，并能夠在不同的環(huán)境之間切換。

Anaconda主要特點(diǎn)包括：

1.安裝過程簡單

2.包含了數(shù)百個科學(xué)模塊，高效運(yùn)用于各種項(xiàng)目

3.可下載python2和python3版本，并根據(jù)項(xiàng)目需求切換使用。

?

Anaconda使用開源社區(qū)構(gòu)建的最佳Python軟件包（包括scikit-learn，TensorFlow和PyTorch）構(gòu)建和訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)模型。

從機(jī)器人技術(shù)到數(shù)據(jù)可視化，Anaconda高效運(yùn)用于各種項(xiàng)目，特別是在數(shù)據(jù)科學(xué)領(lǐng)域有杰出應(yīng)用。

Anaconda Navigator是Anaconda的桌面可視化窗口導(dǎo)航。它使啟動應(yīng)用程序以及管理軟件包和環(huán)境變得很容易，而無需使用命令行命令?！癆naconda-Navigator”中已經(jīng)包含“Jupyter Notebook”、“Jupyterlab”、“Qtconsole”和“Spyder”。用戶可以輕松訪問培訓(xùn)材料，文檔和社區(qū)資源（包括Anaconda.org），可加速您的數(shù)據(jù)科學(xué)之旅。

Anaconda Navigator的Environment是模塊管理庫，我們可以輕松看到已經(jīng)安裝過python模塊，搜索和安裝需要的第三方模塊。

介紹了Anaconda的特征和使用后，接下來介紹如何下載和安裝Anaconda。

Windows系統(tǒng)安裝Anaconda

Anaconda分為商業(yè)版本和免費(fèi)版本。商業(yè)版本有更多的模塊，運(yùn)用于項(xiàng)目效率更高。針對一般使用者，我建議下載免費(fèi)版本就完全足夠了。點(diǎn)擊products產(chǎn)品，選擇individual edition，這是個人版本，免費(fèi)使用。

點(diǎn)擊紅框中download，下載Anaconda。

Anaconda有兩個版本可供選擇：Python 3.7 和 Python 2.7，選擇版之后根據(jù)自己操作系統(tǒng)的情況點(diǎn)擊“64-Bit Graphical Installer”或“32-Bit Graphical Installer”進(jìn)行下載。完成下載之后，雙擊下載文件，啟動安裝程序。

下載好后，以管理員身份運(yùn)行Anaconda軟件。

彈出選項(xiàng)框后，選擇“Next”。

閱讀許可證協(xié)議條款，然后勾選“I Agree”并進(jìn)行下一步。

除非是以管理員身份為所有用戶安裝，否則僅勾選“Just Me”并點(diǎn)擊“Next”。

在“Choose Install Location”界面中選擇安裝Anaconda的目標(biāo)路徑，然后點(diǎn)擊“Next”。

注意：目標(biāo)路徑中不能含有空格，同時(shí)不能是“unicode”編碼。除非被要求以管理員權(quán)限安裝，否則不要以管理員身份安裝。

在“Advanced Installation Options”中不要勾選“Add Anaconda to my PATH environment variable.”（“添加Anaconda至我的環(huán)境變量?！保Ｒ?yàn)槿绻催x，則將會影響其他程序的使用。如果使用Anaconda，則通過打開Anaconda Navigator或者在開始菜單中的“Anaconda Prompt”（類似macOS中的“終端”）中進(jìn)行使用。除非你打算使用多個版本的Anaconda或者多個版本的Python，否則便勾選“Register Anaconda as my default Python 3.7”。然后點(diǎn)擊“Install”開始安裝軟件。如果想要查看安裝細(xì)節(jié)，點(diǎn)擊“Show Details”。

然后點(diǎn)擊“Next”等著軟件自動安裝，安裝需要一定時(shí)間，請耐心等待。如果進(jìn)入“Thanks for installing Anaconda!”界面則意味著安裝成功，點(diǎn)擊“Finish”完成安裝。如果你需要“Anaconda云”和“Anaconda支持”，就不勾選“Learn more about Anaconda Cloud”和“Learn more about Anaconda Support”。