可定制的高通量PROTAC體外泛素化測定試劑盒
泛素與泛素偶聯(lián)機(jī)泛素是一種小多肽,可以通過其C末端與賴氨酸的胺基結(jié)合靶蛋白上的殘基。這種結(jié)合被稱為單泛素化。附加泛素部分可以利用存在的七個(gè)賴氨酸殘基中的任何一個(gè)與該初始泛素綴合在泛素中。這些泛素鏈的形成被稱為多泛素化。最井這種多泛素化的特征是通過泛素(K48)48位的賴氨酸形成鏈-鏈接的鏈)。單泛素化已被證明可以改變靶蛋白。多泛素化最普遍的結(jié)果是蛋白酶體介導(dǎo)的靶蛋白的降解。
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泛素與靶蛋白的結(jié)合需要三種不同連接酶的協(xié)同功能,E1(泛素激活酶)、E2(泛素偶聯(lián)酶)和E3(泛素連接酶)產(chǎn)生在泛素的C末端和e-賴氨酸的氨基靶蛋白上的殘基。泛素E3連接酶作為支架蛋白,為泛素結(jié)合酶(E2)和靶底物。通常,E3連接酶介導(dǎo)轉(zhuǎn)移泛素從E2硫酯中間體到與底物蛋白的酰胺連接(Hershko和Ciechanover,1998)。除了底物的泛素化,E3連接酶還可以“自動(dòng)”泛素化”本身。
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PROTACs(針對嵌合分子的蛋白質(zhì)水解)人為劫持UPS的成分降解靶蛋白。PROTAC藥物是含有兩個(gè)通過連接體連接的功能配體;一個(gè)配體與靶蛋白結(jié)合,另一個(gè)配體結(jié)合至E3連接酶。理論上,將這兩個(gè)實(shí)體接近會(huì)導(dǎo)致多泛素化和靶蛋白的蛋白酶體降解。然而,考慮到這種情況的復(fù)雜性PROTAC發(fā)現(xiàn)策略面臨著一些挑戰(zhàn)和陷阱。電流在評估PROTAC時(shí),分析解決了許多這些挑戰(zhàn),并作為一種有效報(bào)告的工具通過監(jiān)測PROTAC介導(dǎo)的泛素化來實(shí)現(xiàn)真正的PROTAC效率。
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體外泛素化試劑盒以建立一種高通量方法通過監(jiān)測蛋白質(zhì)獲得泛素化的內(nèi)在能力來準(zhǔn)確預(yù)測PROTAC的效率。我們提供了三種E3泛素連接酶Cereblon、VHL和HDM2的試劑盒,以監(jiān)測PROTAC介導(dǎo)的選擇目標(biāo)的泛素化。在測定的核心,微量滴定板條,預(yù)先涂有專有的TUBE試劑(測定板)用于捕獲PROTAC依賴性反應(yīng)。對于測定,首先將PROTAC加入測定板中,然后加入E3連接酶和靶蛋白,使三元復(fù)合物形成。作為一個(gè)序列步驟,將含有wt泛素和ATP的E1-E2酶混合物加入到孔中以啟動(dòng)PROTAC介導(dǎo)的泛素化。在反應(yīng)過程中,E1-E2-E3產(chǎn)生的多泛素鏈機(jī)器被識別并捕獲在井中。在反應(yīng)和隨后的洗滌之后步驟,分離的多泛素化產(chǎn)物與針對感興趣的蛋白質(zhì)的抗體(不是包括)和與HRP綴合的第二抗體(包括),允許通過化學(xué)發(fā)光。因此,在這種情況下,由捕獲的多泛素化產(chǎn)物產(chǎn)生的信號“夾心”ELISA樣測定是PROTAC活性的定量測定。此外檢測策略不需要額外的非天然標(biāo)記或泛素標(biāo)記可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)性偽影。
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建議用途:
1.檢測PROTAC和分子膠(MGs)的活性。
2.比較多種PROTAC變體,并從UbMax中建立預(yù)測DC50。
3.選擇所有三種連接酶來比較PROTACs/MGs活性以證明選擇性。
4.檢測PROTAC底物特異性和異構(gòu)體選擇性。
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艾美捷PROTAC體外泛素化測定試劑盒#PA-0770-P100組件:
1.體外泛素化測定板
注意:不要將分析板快速解凍至室溫。我們建議最初放置
在轉(zhuǎn)移至室溫之前,將測定板在4°C下放置30分鐘。
2.10X含量測定緩沖液
尺寸:1.2毫升
注:添加b-巰基乙醇新鮮至1X測定緩沖液中1mM的最終濃度。
3.E3混合(2X)
尺寸:1 x 250μl(20X)
注:在提供的E3混合物中加入濃度在40-80nM之間的目標(biāo)蛋白
以促進(jìn)與PROTAC和E3連接酶形成三元復(fù)合物。
4.E1-E2-泛素混合物(2X)
尺寸:1 x 250μl(20X)
5.第二抗體(抗小鼠或抗兔HRP綴合物)
尺寸:60μL(100X)
6.檢測試劑1和2
尺寸:1 mL檢測試劑1和1 mL檢測劑2
7.堵劑精礦(5X)
尺寸:5毫升
8.陽性對照試劑
二甲基亞砜中的PROTAC(50X):10μL(MZP54,dBET6,A1874)
靶蛋白陽性對照BRD3(20X):20μL
抗BRD3抗體(100X):5μL
抗小鼠HRP綴合物(100X):5μL
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PROTAC?體外泛素測定試劑盒:可定制的泛素連接酶試劑盒
1.洗滌緩沖液
a.1倍磷酸鹽緩沖鹽水,0.1%吐溫(PBST)
2.具有發(fā)光功能的讀板器
3.b-巰基乙醇
4.100mM ATP
5.正在研究的PROTAC、靶蛋白和靶特異性抗體(ELISA兼容)
6.聚丙烯板(可選)
7.多通道移液器和自動(dòng)洗板器(可選)
8.15 mL離心管