? ? ? ? ?“?在展示數(shù)據(jù)集合的時(shí)候，隨著集合數(shù)目的增多，使用Venn圖進(jìn)行數(shù)據(jù)集合可視化時(shí)，圖形會(huì)變得很復(fù)雜，很難一眼獲取關(guān)鍵信息。今天，給大家介紹一個(gè)基于R語言的的數(shù)據(jù)集合可視化包——UpSetR。下面就給大家展示如何使用UpSetR包一步步實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)集合的展示!”

? ? ? ?首先，給大家介紹如何安裝、導(dǎo)入U(xiǎn)pSetR包，并基于這個(gè)包進(jìn)行最簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)集合展示：

1、UpSetR包的安裝與導(dǎo)入（R語言環(huán)境的安裝與配置大家自行問度娘哈）

2、設(shè)置工作目錄

3、準(zhǔn)備數(shù)據(jù)（這里使用隨機(jī)編寫的數(shù)據(jù)哈，大家也可以導(dǎo)入自己的數(shù)據(jù)）

4、使用upset()函數(shù)繪圖：

1）繪圖前，我們先看一下upset()函數(shù)包含的參數(shù)有哪些？

? ? ? ?我們可以看到，這個(gè)函數(shù)包含的參數(shù)很多，其實(shí)繪圖我們用到參數(shù)就幾個(gè)，想要進(jìn)一步了解大家可自行去官網(wǎng)查看。

2）繪圖：

5、進(jìn)階篇

? ? ? ?上面給大家展示的是如何使用UpSetR繪制最基本的圖形，下面給大家介紹一下如何進(jìn)一步通過調(diào)整參數(shù)得到我們想要的個(gè)性化圖形（由于作圖需求，上面的簡(jiǎn)單數(shù)據(jù)不適用于給大家進(jìn)行進(jìn)一步的展示，所以我們換用這個(gè)包自帶的示例數(shù)據(jù)）：

下面就給大家展示如何通過控制參數(shù)得到一張漂亮的個(gè)性化圖：

? ? ? ?這樣我們就得到了一張個(gè)性化的用于展示數(shù)據(jù)集合的圖形，之后我們可以將得到的圖形保存成PDF，再導(dǎo)入到PS或者AI進(jìn)行進(jìn)一步的美化和調(diào)整。

?。。?！文末彩蛋！?。。?！

? ? ? ?上面展示的內(nèi)容是基于R語言的實(shí)現(xiàn)的數(shù)據(jù)集合可視化，那么，對(duì)于很多對(duì)代碼并不是很熟悉的“小白”來說，有什么更友好的方式得到這樣一張UpSetR圖呢？還真有，下面就給大家安利幾個(gè)在線繪制網(wǎng)站：

1、Evenn （http://www.ehbio.com/test/venn/）

2、ChiPlot （https://www.chiplot.online/）

3、NGDC Cloud （https://ngdc.cncb.ac.cn/bit/visual）

4、SangerBox （http://vip.sangerbox.com/）

? ? ? ?完整代碼獲取大家可以關(guān)注我的個(gè)人公眾號(hào)——“科研后花園”，后臺(tái)回復(fù)‘UpSetR’即可獲取完整代碼！！！