基因編輯肝癌細胞系HepG2—藥物研究、肝毒性和癌癥研究神器

肝臟作為人體五臟之一,與機體正常的代謝、解毒、凝血等過程息息相關(guān),并且參與機體免疫,是維持機體生命不可缺少的重要器官。在進行肝臟疾病的研究中,合適的細胞模型是重要的工具之一,但由于常規(guī)肝細胞獲取困難、培養(yǎng)難度高、培養(yǎng)成本高昂,在一定程度上制約了肝臟疾病研究的發(fā)展。因此,在肝臟研究中選擇培養(yǎng)簡單、遺傳背景穩(wěn)定的肝細胞系則成為了一種替代選擇,其中HepG2是最為常用肝癌細胞系之一。
HepG2細胞系的應(yīng)用
HepG2由knowles等建系于1979年,是一種肝母細胞瘤,來源于一名15歲的高加索白人男性肝癌標本。HepG2細胞呈上皮樣形態(tài),典型染色體數(shù)目為55個。
肝炎病毒研究:HepG2不含hepatitis B virus (HBV)和hepatitis C virus (HCV),因此HepG2是常用的研究HBV和HCV細胞系模型。
體外HCC模型:HepG2是一種來源于肝細胞癌(HCC)患者肝組織的細胞系,是常見的體外HCC模型。HepG2中p53抑癌基因無突變,因此可用于研究p53與肝細胞癌(HCC)的密切關(guān)系,以及HCC的發(fā)病、診治、預防。
藥物研究:肝臟是人體內(nèi)藥物代謝的最主要器官,也是重要的解毒器官。HepG2細胞系無論在形態(tài)上還是功能上都更接近于人的肝組織,該細胞系常用于藥物代謝和肝毒性研究。
肝細胞系與CRISPR/Cas9技術(shù)相結(jié)合,助力研究肝炎、遺傳病、癌癥等醫(yī)學難題
利用CRISPR/Cas9構(gòu)建基因敲除HepG2的HBV感染細胞模型細胞,為徹底治愈乙肝提供新思路
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)是一種DNA病毒,在細胞外的HBV基因組DNA是一種松弛環(huán)狀的雙鏈DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子,當病毒感染細胞,HBV基因組進入到宿主細胞核后,rcDNA會在轉(zhuǎn)化成共價閉合環(huán)狀DNA(covalently closed circularDNA,cccDNA),并且可以穩(wěn)定存在。目前,不能徹底治愈乙肝的一個重要原因就在于無法清除肝細胞核內(nèi)穩(wěn)定存在的cccDNA。HBV rcDNA向cccDNA的轉(zhuǎn)變是乙肝病毒建立持續(xù)性感染的必需步驟,因此, ? ? ?對HBV cccDNA形成的分子機制的研究對于乙肝治療有深遠意義。
為了探討HBV cccDNA形成的機制,研究者在HepG2中表達HBV的受體——鈉離子-牛磺膽酸共轉(zhuǎn)運蛋白(NTCP),建立了高效的HBV感染HepG2-NTCP細胞模型,在病毒感染24小時后即可檢測到cccDNA的形成。隨后,使用病毒DNA聚合酶抑制劑以及靶向宿主DNA聚合酶的siRNA進行實驗,結(jié)果顯示HBV 病毒聚合酶在rcDNA轉(zhuǎn)為cccDNA過程中不是關(guān)鍵的因素,而敲降POLK、POLL和POLH能有效降低病毒核衣殼蛋白(HBeAg)和3.5kb vRNA的表達水平,其中敲降POLK顯示了最顯著的效果。


進一步的,利用CRISPR/Cas9在HepG2-NTCP細胞中敲除POLK,可大大減少cccDNA的形成,確認了HBV cccDNA形成過程需要POLK的參與。在POLK敲除的HepG2-NTCP細胞中進行POLK回補,即可恢復HBV cccDNA的合成和病毒蛋白的表達。

該研究有力地表明在HBV感染HepG2-NTCP細胞模型中POLK是HBV cccDNA形成的關(guān)鍵細胞分子,為cccDNA形成的分子機制提供了新的思路,并有助于開發(fā)治療慢性乙型肝炎的新療法。
CRISPR-U?可以十倍高效地將CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)入Hep-G2細胞中 ,篩選后挑取單克隆培養(yǎng)。選擇不同的克隆分別進行靶位點擴增及測序驗證,篩選出基因敲除的陽性克隆。
CRISPR/Cas9構(gòu)建缺失突變細胞HepG2模型,揭秘威爾遜?。╤epatolenticular degeneration)的成因
肝豆狀核變性(hepatolenticular degeneration)是一種隱性遺傳病,是由于ATP7B變異引起基因致病性功能喪失。其特征是銅穩(wěn)態(tài)紊亂導致肝臟疾病和神經(jīng)系統(tǒng)異常。NM_000053.3:c.1934T?>?G (Met645Arg) 被報道為復合雜合子,在西班牙血統(tǒng)的患者中高度流行。然而,功能研究表明,該氨基酸的變化并不改變蛋白質(zhì)功能,導致學者質(zhì)疑此突變的致病性。隨后,研究使用一個minigene系統(tǒng)和CRISPR/Cas9基因編輯HepG2細胞來證明c.1934T?>?G導致約70%的6號外顯子跳躍。通過核轉(zhuǎn)染法將CRISPR/Cas9以及ssODN共轉(zhuǎn)入HepG2細胞中,篩選后挑選單克隆培養(yǎng)。對單克隆分別進行靶位點擴增及測序,篩選出以下4個克隆進行研究。

與野生型細胞的轉(zhuǎn)錄相比,2F3細胞只有15%的轉(zhuǎn)錄本含有外顯子5,6,7。與野生型細胞相比,1E8和1F6細胞分別只有31%和33%。

此外,從野生型和經(jīng)過編輯的HepG2細胞中提取蛋白裂解物,用western blot檢測ATP7B蛋白的表達。與野生型細胞相比,復合雜合子(2F3)和純合子(1E8,1F6)細胞表達ATP7B水平降低。與2F3細胞相比,1E8和1F6純合子細胞系中ATP7B表達更多。對照組2A1 ATP7B敲除細胞系沒有檢測到ATP7B的水平。?
研究表明,c.1934T?>?G導致約6號外顯子跳躍,從而引起移碼和終止密碼子提前出現(xiàn),從而導致ATP7B功能喪失。此研究闡明了該點突變在肝豆狀核變性疾病中的機制作用,有助于開發(fā)恢復正確剪接的基因藥物。
HepG2細胞敲入熒光標記基因,為抗炎和腫瘤治療提供了新的技術(shù)支持
mPGES-1是一種末端限速酶(terminal rate-limiting enzyme),負責產(chǎn)生由炎癥誘導的PGE2。mPGES-1的抑制劑被認為是治療炎癥和癌癥的安全有效的靶點。然而,目前還缺乏一種特異、高效、簡便的mPGES-1抑制劑高通量篩選方法。研究者開發(fā)了一種通過CRISPR/Cas9敲入熒光蛋白的一種成像策略來監(jiān)測mPGES-1的表達。
通過使用通過核轉(zhuǎn)染法高效地將gRNA、Cas9和Donor共轉(zhuǎn)入HepG2等肝細胞系中,進行藥篩,藥篩完成后挑選單克隆培養(yǎng)。陽性克隆通過免疫熒光共定位、測序、RNAi和IL-1β治療均證實了mPGES-1報告細胞的成功構(gòu)建。

熒光蛋白KI細胞通過4種常用mPGES-1抑制劑處理后,流式細胞儀檢測到熒光信號強度有顯著的衰減,表明該 熒光蛋白KI細胞可作為篩選和優(yōu)化mPGES-1抑制劑的一種高效、簡便的方法。同時,這種KI細胞為靶向小分子化合物的抗炎和腫瘤治療提供了新的技術(shù)支持。
CRISPR-U?可在肝細胞系中進行高效的基因編輯
CRISPR-U是源井生物自主研發(fā)的應(yīng)用于基因編輯細胞系的獨家技術(shù),通過優(yōu)化基因編輯載體和基因編輯流程,CRISPR-U技術(shù)的基因切割效率和重組效率是普通的CRISPR/Cas9技術(shù)的10倍以上,可輕松定制您感興趣基因編輯肝細胞系細胞系可實現(xiàn)各種轉(zhuǎn)基因的需求。
Reference:
Qi, Yonghe, et al. "DNA polymerase κ is a key cellular factor for the formation of covalently closed circular DNA of hepatitis B virus."?PLoS pathogens?12.10 (2016).
Merico, Daniele, et al. "ATP7B variant c. 1934T> G p. Met645Arg causes Wilson disease by promoting exon 6 skipping."?NPJ Genomic Medicine?5.1 (2020): 1-7.
Chen, Zhanfei, et al. "CRISPR/Cas9-based liver-derived reporter cells for screening of mPGES-1 inhibitors."?Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry?34.1 (2019): 799-807.
注明 | 文章是源井生物原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明。
關(guān) 注 供 種 昊 “源井生物”,了解更多基因編輯相關(guān)資訊。