元素循環(huán)是生物地球化學(xué)循環(huán)的重要環(huán)節(jié)，主要涉及碳、氮、磷、硫等元素的循環(huán)過程。凌恩生物強(qiáng)勢推出基于宏基因組的硫循環(huán)研究方案，構(gòu)建了完整的硫循環(huán)循環(huán)模式圖，對宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行深入挖掘，各部分結(jié)果圖可直接用于文章發(fā)表，充分滿足您對元素循環(huán)的各類個(gè)性化分析要求！

硫元素是生物體必需的營養(yǎng)元素，是合成氨基酸（甲硫氨酸、半胱氨酸）所必需的原料。自然界中存在豐富的硫源，海洋生態(tài)系統(tǒng)中硫酸鹽、硫化物儲(chǔ)存量巨大，不同價(jià)態(tài)硫化合物之間的轉(zhuǎn)化主要由代謝功能多樣的微生物等來完成，形成硫循環(huán)。硫氧化細(xì)菌在好氧或厭氧光照條件下將低價(jià)態(tài)硫元素氧化為硫酸鹽，硫酸鹽可在厭氧條件下被硫酸鹽還原細(xì)菌還原為硫化物。

凌恩生物元素循環(huán)研究策略

功能基因擴(kuò)增

1、引物特異性，覆蓋不夠全面;

2、只能獲得部分元素循環(huán)相關(guān)基因。

宏基因組分析

1、對于元素循環(huán)代謝通路不夠全面，且循環(huán)路徑分類不夠明確；

2、不能滿足目前高水平科研論文研究需求。

凌恩生物新流程

1、基于宏基因組標(biāo)準(zhǔn)分析得到的KEGG注釋結(jié)果；

2、根據(jù)文獻(xiàn)整合得到的碳、氮、硫和磷循環(huán)路徑及詳細(xì)基因豐度計(jì)算方式;

3、計(jì)算每個(gè)樣本中碳、氮、硫和磷循環(huán)各路徑的基因豐度，進(jìn)而進(jìn)行一系列樣本間比較。

凌恩生物全新升級宏基因組硫循環(huán)方案，基于宏基因組標(biāo)準(zhǔn)分析得到的KEGG注釋結(jié)果，以及查閱大量基于宏基因組測序分析環(huán)境微生物群落元素循環(huán)的高分SCI文獻(xiàn)相關(guān)資料，建立了完整的硫循環(huán)循環(huán)模式圖，構(gòu)建了包含51個(gè)關(guān)鍵基因，涵蓋7個(gè)硫循環(huán)子路徑的完整硫循環(huán)分析方案。

通過建立完整的硫循環(huán)過程模式圖，確定不同代謝過程所涉及的功能基因及其豐度計(jì)算方法，繪制環(huán)境樣品微生物群落硫循環(huán)功能基因豐度差異比較圖，進(jìn)一步通過對識(shí)別到的相關(guān)功能基因進(jìn)行物種分類學(xué)注釋，識(shí)別不同環(huán)境樣品中參與硫循環(huán)的主要功能微生物種屬。提供包括組成分析、差異分析、相關(guān)性分析等在內(nèi)的宏基因組硫循環(huán)主流分析內(nèi)容，助您輕松實(shí)現(xiàn)硫循環(huán)功能機(jī)制的深入挖掘。

硫循環(huán)路徑

新升級的宏基因組硫循環(huán)

分析內(nèi)容包含四大分析模塊：

硫循環(huán)功能基因豐度定量及比較分析

硫循環(huán)功能基因路徑圖

樣本間/組間Beta多樣性比較分析

宿主微生物識(shí)別及與功能基因的聯(lián)合分析

新升級的宏基因組硫循環(huán)分析對結(jié)果的展示進(jìn)行了細(xì)致的優(yōu)化，在保證分析結(jié)果清晰展示的前提下，對分析結(jié)果圖的各項(xiàng)細(xì)節(jié)參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化調(diào)整，分析結(jié)果無需任何調(diào)整即可直接達(dá)到文章發(fā)表要求。

凌恩生物硫循環(huán)分析結(jié)果展示圖

經(jīng)典文獻(xiàn)案例

題目：極地海洋二甲基硫和二甲基巰基丙酸內(nèi)鹽循環(huán)的生物地理特征[1]

期刊：Microbiome

影響因子：16.8737

DOI：10.1186/s40168-021-01153-3

二甲基巰基丙酸內(nèi)鹽（DMSP）在海洋環(huán)境中廣泛存在，是海洋細(xì)菌的主要營養(yǎng)來源，同時(shí)也在全球硫循環(huán)中發(fā)揮著重要作用。海洋微生物可以通過不同類型的DMSP裂解酶，將DMSP代謝成揮發(fā)性的二甲基硫（Dimethyl sulfide, DMS）。DMS被認(rèn)為是一種“冷室效應(yīng)氣體”，在大氣中發(fā)揮著重要作用，可能對全球氣候變化產(chǎn)生影響。

本研究對極地海洋和低緯度海洋的海水來源進(jìn)行了宏基因組和宏轉(zhuǎn)錄組的系統(tǒng)分析，以分析微生物來源的DMS/DMSP循環(huán)相關(guān)基因的生物地理特征。結(jié)果表明，與低緯度海洋相比，極地海洋中DMS/DMSP循環(huán)相關(guān)基因的豐度更高，并且具有獨(dú)特的生物地理分布特征。DMSP脫甲基酶（DmdA）、DMSP裂解酶（DddD、DddP和DddK）和三甲胺單加氧酶（Tmm，將DMS氧化成二甲基亞砜）的編碼基因是參與全球DMS/DMSP循環(huán)的最普遍的細(xì)菌基因之一。在極地海洋DMS/DMSP循環(huán)中，α-變形菌綱和γ-變形菌綱扮演著重要角色。

據(jù)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，在極地海洋中DMS/DMSP循環(huán)的生物地理特征與采樣深度之間顯著相關(guān)，但與地理距離之間沒有明顯相關(guān)性。這表明，在極地海洋中影響DMS/DMSP循環(huán)生物地理分布的關(guān)鍵因素并非擴(kuò)散限制，而是表層和深水生境之間的差異。

參考文獻(xiàn)

[1] Biogeographic traits of dimethyl sulfide and?dimethylsulfoniopropionate cycling in polar?oceans. Microbiome, 2021.