“安全性問(wèn)題”一直是新藥研發(fā)中重點(diǎn)關(guān)注的問(wèn)題，也是影響創(chuàng)新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要因素。隨著我國(guó)創(chuàng)新藥物研究政策與法規(guī)的改革，藥品研發(fā)模式與方向發(fā)生了變化，安全性評(píng)價(jià)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)逐步拓展至新型抗體藥物、干細(xì)胞產(chǎn)品、CAR-T細(xì)胞產(chǎn)品、抗體藥物偶聯(lián)物（ADC）藥物、溶瘤病毒藥物和基因治療藥物等方面。藥物試驗(yàn)的研究文獻(xiàn)層出不窮，快速獲取到行業(yè)內(nèi)最新的試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)和研究數(shù)據(jù)，整合大數(shù)據(jù)資源，成為了研發(fā)人員寶貴的技能。如何快速地識(shí)別候選生物標(biāo)記物？如何選擇最合適的生物模型，優(yōu)化研究設(shè)計(jì)和分析？如何研究協(xié)同、拮抗和相加效應(yīng)來(lái)了解聯(lián)合治療的效益？源資科技的生物信息學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫(kù)解決方案將為您打開藥物研發(fā)的快速通道。

通路分析利器IPA

IPA包含從同行評(píng)審出版物和其他資源中整理匯集的知識(shí)庫(kù)，用戶通過(guò)IPA能夠：

?研究靶向基因/蛋白質(zhì)對(duì)不同毒理學(xué)和生物學(xué)功能的影響

?獲得感興趣基因的毒性信息

?找出內(nèi)部數(shù)據(jù)集或公共數(shù)據(jù)集的毒性相關(guān)通路、調(diào)控子和功能并加以分析

?比較不同的藥物治療、不同實(shí)驗(yàn)條件等，或比較多組學(xué)數(shù)據(jù)，產(chǎn)生新發(fā)現(xiàn)

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IPA中的Comparison Analysis功能可以在不同條件（如劑量反應(yīng)、時(shí)間過(guò)程或其他條件）下對(duì)多個(gè)分析進(jìn)行可視化，確定各種條件之間的趨勢(shì)或相似性和差異。這些分析可以是來(lái)自不同組學(xué)的研究，在左側(cè)點(diǎn)擊感興趣的通路即可打開如右側(cè)所示的通路圖查看詳情（如下圖所示）。

基因水平熱圖清晰地顯示了基因在特定通路、上游調(diào)控子或下游疾病或功能中的上調(diào)和下調(diào)情況，從而能夠快速識(shí)別這些情況下的重要基因或調(diào)控子。使用經(jīng)典通路分析熱圖、下游效應(yīng)、上游調(diào)控子和因果網(wǎng)絡(luò)分析，研究者就可以回答這樣一些問(wèn)題：“在我的數(shù)據(jù)中，是否有轉(zhuǎn)錄因子的活性隨著時(shí)間（或劑量）的增加而增加？”“在我的不同數(shù)據(jù)集中是否存在某些生物功能類群，它們具有相似的增加或減少模式？”

點(diǎn)擊熱圖的某一方塊，即可可視化相關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò)。以Downstream Effects ? Analysis為例（即預(yù)測(cè)生物功能和Tox功能的增加或減少），網(wǎng)絡(luò)會(huì)顯示特定分析中與疾病或功能有因果關(guān)系或相關(guān)關(guān)系的基因，并指出它們可能如何增加或減少疾病或功能（如下圖）。

如下所示直接搜索關(guān)鍵詞，即可查看收錄的公共數(shù)據(jù)集，并將其添加到comparison中進(jìn)行分析。同時(shí)也收錄了治療藥物、劑量等的meta信息。搜索功能支持AND，OR，NOT等邏輯語(yǔ)言，方便準(zhǔn)確查找。

IPA中的Analysis Match功能可以將您的數(shù)據(jù)集放在十萬(wàn)多個(gè)公共數(shù)據(jù)集（季度更新）中進(jìn)行對(duì)比分析，它可以自動(dòng)識(shí)別和您的數(shù)據(jù)集具有顯著相似性和差異性的公共數(shù)據(jù)集，使您能夠比較結(jié)果、驗(yàn)證假說(shuō)并更好地理解疾病、基因和上游調(diào)控子網(wǎng)絡(luò)之間的因果關(guān)系。

海量組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)OmicSoft Lands

OmicSoft Lands收集了來(lái)自GTEx（正常組織）、GEO、癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)等的公共數(shù)據(jù)，用戶通過(guò)OmicSoft Lands能夠：

?研究藥物靶點(diǎn)或生物標(biāo)記物在不同正常組織、疾病狀態(tài)、治療情況下的表達(dá)差異

?分析兩個(gè)或更多基因的相關(guān)表達(dá)

?確定治療、疾病、正常組織、細(xì)胞類型等的特異基因或生物標(biāo)記物列表

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當(dāng)我們想要研究感興趣的基因、靶點(diǎn)、生物標(biāo)記物在不同的正常組織中如何表達(dá)時(shí)，就可以打開OmicSoft Lands，在GTEx中找出正常組織的目標(biāo)基因表達(dá)（如下圖）。

也可以通過(guò)在IPA中搜索后點(diǎn)擊跳轉(zhuǎn)到OmicSoft Lands（如下圖）。

左側(cè)欄可以篩選不同的組織類型，左上角黑框所示部分可以切換不同的數(shù)據(jù)庫(kù)。

可以同時(shí)搜索多個(gè)基因，選擇不同的數(shù)據(jù)類型，如下：

將IPA和OmicSoft配合使用，您就可以站在巨人的肩膀上，從浩瀚的公共數(shù)據(jù)庫(kù)中快速獲取到研究興趣相關(guān)的數(shù)據(jù)，快速探索藥物治療的效應(yīng)、毒理學(xué)特征，分析藥物靶點(diǎn)的上游調(diào)控子和下游功能。