【一些概念】關(guān)于啟動(dòng)子
?轉(zhuǎn)錄單元(transcription unit)
轉(zhuǎn)錄單元(transcription unit) 是一段從啟動(dòng)子(promoter)開始至終止子(terminator)結(jié)束的DNA序列。RNA聚合酶從轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)開始沿著模板前進(jìn),直到終止子為止,轉(zhuǎn)錄出一條RNA鏈。在細(xì)胞中,一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元可以是一個(gè)基因,也可以是幾個(gè)基因。
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)
轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)是指與新生RNA鏈第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)DNA鏈上的堿基,研究證實(shí)通常為一個(gè)嘌呤。常把起點(diǎn)前面,即5’末端的序列稱為上游(upstream),而把其后即3’末端的序列稱為下游(downstream)。在描述堿基的位置時(shí),一般用數(shù)字表示,起點(diǎn)為+1,下游方向依次為+2、+3……,上游方向依次為-1、-2、-3……。
啟動(dòng)子定義
在遺傳學(xué)中,啟動(dòng)子是指一段能使特定RNA轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的DNA序列,RNA轉(zhuǎn)錄本包括編碼蛋白的mRNA,或者是tRNA,rRNA。啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)影響了它與RNA聚合酶結(jié)合的親和力,從而影響了轉(zhuǎn)錄水平。
啟動(dòng)子位置
啟動(dòng)子位于控制基因表達(dá)的調(diào)控序列中、基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的上游(朝向DNA正義鏈的5′方向),長約100~1000個(gè)堿基對(duì)。啟動(dòng)子序列中的DNA順式作用元件序列,為RNA聚合酶和轉(zhuǎn)錄因子提供了一個(gè)穩(wěn)定的結(jié)合位點(diǎn)。轉(zhuǎn)錄因子是一種招募RNA聚合酶并控制和調(diào)控RNA轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)(一些概念:轉(zhuǎn)錄因子)。
啟動(dòng)子位置示意圖
啟動(dòng)子結(jié)構(gòu)
啟動(dòng)子主要由三個(gè)部分組成:核心啟動(dòng)子、近端啟動(dòng)子和遠(yuǎn)端啟動(dòng)子,以下以真核啟動(dòng)子為例介紹。
核心啟動(dòng)子——引發(fā)轉(zhuǎn)錄的必要部分及轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)。位于靠近起始密碼子的位置大約-35 bp,包含RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)、TATA box和轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS),一般轉(zhuǎn)錄因子蛋白和組蛋白可以在該區(qū)域結(jié)合。核心啟動(dòng)子區(qū)域也含有其他元件,但是未發(fā)現(xiàn)類似“通用元件”的序列存在。
近端啟動(dòng)子——基因的近端上游序列,包括一些基本的調(diào)控元件。位于起始位點(diǎn)上游大約250 bp,是特異轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)集中區(qū)域。
遠(yuǎn)端啟動(dòng)子——是基因的遠(yuǎn)端上游序列,包括一些額外的調(diào)控元件,一般影響力較近端啟動(dòng)子弱。它是在上游更遠(yuǎn)的位置(但非增強(qiáng)子或其他調(diào)控區(qū)域),存在特定轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。
真核轉(zhuǎn)錄
真核啟動(dòng)子一般比原核啟動(dòng)子復(fù)雜多樣得多,跨域的DNA序列范圍廣。能夠與其他調(diào)控區(qū)域(增強(qiáng)子、沉默子、邊界元件/絕緣體)協(xié)同工作,指導(dǎo)RNA轉(zhuǎn)錄本的轉(zhuǎn)錄水平。
真核轉(zhuǎn)錄示意圖
啟動(dòng)子研究方法
轉(zhuǎn)錄單元(transcription unit) 是一段從啟動(dòng)子(promoter)開始至終止子(terminator)結(jié)束的DNA序列,RNA聚合酶從轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)開始沿著模板前進(jìn),直到終止子為止,轉(zhuǎn)錄出一條RNA鏈。在細(xì)胞中,一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元可以是一個(gè)基因,也可以是幾個(gè)基因。
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