科研代碼分享|生物信息分析之SCI熱門圖表-復(fù)雜熱圖
科研有捷徑,輸入代碼,一鍵獲取科研成果!就是這么省事,來具體看下有多方便!
搜索http://985.so/a9kb查看全部代碼(目前共計(jì)50+持續(xù)新增中),也可以點(diǎn)擊右側(cè)【目錄】,可以看到更多有趣的代碼
真香提示:文末可以知道如何獲取代碼~??
熱圖(heatmap)是分子生物學(xué)、生物信息學(xué)文章里(尤其是microarray, RNA-seq相關(guān)論文)經(jīng)常出現(xiàn)的圖片,熱圖可以:
(1)直觀呈現(xiàn)多樣本多個(gè)基因的全局表達(dá)量變化;
(2)呈現(xiàn)多樣本或多基因表達(dá)量的聚類關(guān)系...
?
利用純生物信息學(xué)分析發(fā)表高分SCI,復(fù)雜熱圖是必不可少的分析結(jié)果可視化展示風(fēng)格。如下圖。這是來自Front Cell Dev Biol的一篇IF > 5分生信文章。
?


但是具體要如何實(shí)現(xiàn)??? 今天,小編以代碼提供的數(shù)據(jù)為例進(jìn)行說明。
代碼具體包括:
Step1 輸入數(shù)據(jù)(基因表達(dá)矩陣和臨床分組信息)
Step2 R代碼繪制復(fù)雜熱圖
下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的復(fù)雜熱圖

神奇吧,就是如此簡(jiǎn)單,我們用的都是入門級(jí)函數(shù),稍微懂點(diǎn)R語(yǔ)言就能實(shí)現(xiàn)。
如需代碼及示例數(shù)據(jù)等文件,請(qǐng)掃碼聊天框回復(fù)“B13”領(lǐng)??!?

標(biāo)簽: