科普講堂 | 一分鐘帶你了解轉(zhuǎn)錄組及測(cè)序相關(guān)知識(shí)
轉(zhuǎn)錄組
1、廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合。
包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA以及非編碼RNA。
2、狹義上指所有mRNA的集合。
蛋白質(zhì)是行使細(xì)胞功能的主要承擔(dān)者,蛋白質(zhì)組是細(xì)胞功能和狀態(tài)的最直接描述,轉(zhuǎn)錄組成為研究基因表達(dá)的主要手段,也是連接基因組遺傳信息與生物功能的必然紐帶,轉(zhuǎn)錄水平的是研究最多的,也是生物體最重要的調(diào)控方式。
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
通過(guò)第二代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行cDNA測(cè)序,全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本。一般轉(zhuǎn)錄組測(cè)序指對(duì)mRNA反轉(zhuǎn)錄cDNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。
編碼RNA
mRAN,又稱為信使RNA,是由DNA的一條鏈作為模板轉(zhuǎn)錄而來(lái)的、攜帶遺傳信息的能指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的一類單鏈核糖核酸。mRNA存在于原核生物和真核生物的細(xì)胞質(zhì)及真核細(xì)胞的某些細(xì)胞器(如線粒體和葉綠體)中。
特點(diǎn):
1、原核生物mRNA常以多順?lè)醋樱ㄒ?jiàn))的形式存在真核生物mRNA一般以單順?lè)醋拥男问酱嬖冢?/p>
2、原核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄與翻譯一般是偶聯(lián)的,即轉(zhuǎn)錄尚未完畢,蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)譯合成就已開(kāi)始。真核生物轉(zhuǎn)錄的mRNA前體則需經(jīng)后加工為成熟的mRNA與蛋白質(zhì)結(jié)合,生成信息體后才開(kāi)始工作;
3、原核生物mRNA半壽期很短,一般為幾分鐘,最長(zhǎng)只有數(shù)小時(shí)(RNA噬菌體中的RNA除外)。真核生物mRNA的半壽期較長(zhǎng),如胚胎中的mRNA可達(dá)數(shù)日;
4、原核與真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)也不同。
非編碼RNA
MicroRNA(miRNA)
是一類內(nèi)生的、長(zhǎng)度約20-24核苷酸的小RNA,在細(xì)胞內(nèi)具有多種重要的調(diào)節(jié)作用,參與許多生命過(guò)程,如細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡、脂肪代謝和細(xì)胞分化等。
特點(diǎn):
1、高度保守性:miRNA保守性具有重要的生物學(xué)意義,提示在不同生物發(fā)育過(guò)程中,miRNAs具有相同的調(diào)控機(jī)制;
2、時(shí)序表達(dá)特異性性:在不同組織、不同發(fā)育階段,miRNA的表達(dá)水平有顯著差異,miRNA表達(dá)是動(dòng)態(tài)調(diào)控的;
3、組織表達(dá)特異性:一些miRNA表達(dá)具有細(xì)胞和組織特異性。

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長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)
是一類長(zhǎng)度大于200核苷酸的非編碼RNA,其在轉(zhuǎn)錄沉默、轉(zhuǎn)錄激活、染色體修飾、核內(nèi)運(yùn)輸?shù)染哂兄匾墓δ堋?/p>
特點(diǎn):
1、 lncRNA的長(zhǎng)度在200-100000nt之間,具有mRNA相似的結(jié)構(gòu),經(jīng)剪接,具有ployA尾巴以及啟動(dòng)子結(jié)構(gòu),分化過(guò)程中有動(dòng)態(tài)的表達(dá)以及不同的剪接方式,形成不同的lncRNA;
2、 lncRNA一般無(wú)蛋白編碼能力,但是有很多l(xiāng)ncRNA能編碼一些短肽;
3、lncRNA的保守性較低;
4、lncRNA的表達(dá)具有組織特異性以及時(shí)空特性。不同的組織表達(dá)lncRNA的量是不同的,即使是同一組織中,處于不同狀態(tài)時(shí)表達(dá)量也不同;
5、lncRNA的定位有區(qū)別。不同的lncRNA在細(xì)胞內(nèi)(外)的豐度不同。

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魏祎 | 文案
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百奧益康技術(shù)團(tuán)隊(duì)已累積經(jīng)驗(yàn)的消化組織類型(人)
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百奧益康技術(shù)團(tuán)隊(duì)已累積經(jīng)驗(yàn)的消化組織類型(小鼠)