差異基因分析完之后不知道下步該怎樣做？小果教你這么辦！
爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)
??
最近有一個(gè)小伙伴私聊小果，說自己是做長非編碼RNA的，問自己做完了處理前后的差異表達(dá)分析，得到了一群差異表達(dá)的基因，不知道下一步該怎么辦了。不要慌，小果帶著思路來啦?。。。。。。?br>
最近長非編碼RNA發(fā)展比較火熱，對(duì)于長非編碼RNA的研究也是花樣百出，lncRNAs是指一類轉(zhuǎn)錄本長度超過 200nt，不具備蛋白編碼能力的 RNA分子，目前已發(fā)現(xiàn)包括LncMyoD1、lncMREF等多個(gè)lncRNA通過分子海綿、蛋白互作、調(diào)控mRNA穩(wěn)定性、調(diào)節(jié)mRNA翻譯等多種機(jī)制參與機(jī)體的生命活動(dòng)，并對(duì)機(jī)體生命活動(dòng)產(chǎn)生重要作用。
我們知道，lncRNA發(fā)揮作用的形式，可以通過與調(diào)控因子互作，將調(diào)控因子拉到靶基因的啟動(dòng)子上，進(jìn)而調(diào)控基因的表達(dá)，從而影響機(jī)體的生命活動(dòng)（圖一），我們可以通過處理前后的差異基因預(yù)測與lncRNA互作的蛋白，從而進(jìn)行下一步的研究，而TRRUST數(shù)據(jù)庫（https://www.grnpedia.org/trrust/Network_search_form.php）就可以實(shí)現(xiàn)咱們這個(gè)目的，快跟著小果來學(xué)習(xí)吧??！
圖一（lvetal 2022）
1 進(jìn)入數(shù)據(jù)庫首頁
https://www.grnpedia.org/trrust/Network_search_form.php
2?我們主要用到Find key regulators for query genes 這個(gè)功能
3?下一步將我們的處理前后的差異基因輸入，并選擇物種，點(diǎn)擊提交就可以了
4 結(jié)果很快就出來了，結(jié)果也進(jìn)行了排名，大家可以根據(jù)輸出的結(jié)果，尋找和自己表型或者要解釋的科學(xué)問題一致的基因進(jìn)行后續(xù)的研究就可以了！
是不是超簡單，趕快學(xué)起來，用起來吧，大家有疑問的地方歡迎大家和小果交流喲?。?！
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