【初學(xué)必讀】細(xì)胞凋亡及檢測方法
細(xì)胞凋亡這一概念最早在1972年由J.F.R.Kerr等人在研究組織變化時(shí)提出的(KerrJFR等,1972)。細(xì)胞凋亡又稱為細(xì)胞程序化死亡,是指細(xì)胞受到特定的細(xì)胞內(nèi)信號或細(xì)胞外信號的誘導(dǎo)刺激,激活下游的死亡途徑,在基因的調(diào)控下進(jìn)行的一系列的細(xì)胞死亡過程。細(xì)胞凋亡對生物生長發(fā)育、傷口愈合等過程具有至關(guān)重要的意義。
細(xì)胞死亡方式的另一種方式被稱為細(xì)胞壞死,但是細(xì)胞凋亡和細(xì)胞壞死具有截然不同的特征,細(xì)胞凋亡是一種主動的生理反應(yīng),細(xì)胞壞死則是細(xì)胞對嚴(yán)重?fù)p傷的一種被動反應(yīng)和變性過程。凋亡過程受細(xì)胞內(nèi)一系列相關(guān)的分子所調(diào)控,涉及一系列復(fù)雜的生理生化反應(yīng),并伴隨有典型的形態(tài)學(xué)改變,最終導(dǎo)致細(xì)胞的解體。凋亡細(xì)胞的許多形態(tài)學(xué)改變是特征性的,甚至是唯一與凋亡相關(guān)的,因此可以作為檢測凋亡的基礎(chǔ)。凋亡檢測的關(guān)鍵是將凋亡細(xì)胞與正常細(xì)胞以及壞死細(xì)胞進(jìn)行準(zhǔn)確的區(qū)分。


No.1
凋亡的程序性死亡特點(diǎn)
染色質(zhì)聚集、分塊、位于核膜上,胞質(zhì)凝縮,最后核斷裂,細(xì)胞通過出芽的方式形成許多凋亡小體;
凋亡小體內(nèi)有結(jié)構(gòu)完整的細(xì)胞器,還有凝縮的染色體,可被鄰近細(xì)胞吞噬消化,因始終有膜封閉,沒有內(nèi)溶物釋放,故不會引起炎癥;
凋亡細(xì)胞中仍需要合成一些蛋白質(zhì);
核酸內(nèi)切酶活化,導(dǎo)致染色質(zhì)DNA在核小體連接部位斷裂,形成約180-200bp整數(shù)倍的核酸片段,凝膠電泳圖譜呈梯狀;
凋亡通常是生理性變化。
No.2
細(xì)胞凋亡的過程及標(biāo)志
一
?細(xì)胞凋亡過程
細(xì)胞凋亡過程及形態(tài)的改變根據(jù)細(xì)胞凋亡過程中的形態(tài)學(xué)特征變化,將細(xì)胞凋亡分為3個(gè)過程:
01
?凋亡起始階段:
細(xì)胞表面特化結(jié)構(gòu)消失;內(nèi)質(zhì)網(wǎng)囊腔腫脹變大,線粒體膨大;細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)紊亂;染色質(zhì)凝縮分布在核膜一側(cè)或周圍;胞質(zhì)出現(xiàn)大小不均的空泡。
02
?凋亡小體形成階段:
染色質(zhì)進(jìn)一步凝縮并斷裂為大小不均一的片段,DNA發(fā)生斷裂,細(xì)胞核解體,細(xì)胞質(zhì)膜或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜包裹著斷裂的DNA和破碎的細(xì)胞器通形成許多球形小泡,這些有膜包圍的小泡被稱為凋亡小體。
03
?吞噬清除階段:
凋亡小體形成后,被巨噬細(xì)胞和鄰近的細(xì)胞識別并吞噬消化。
二
?細(xì)胞凋亡的生物化學(xué)變化
細(xì)胞凋亡時(shí)不僅發(fā)生明顯的形態(tài)變化,同時(shí)也伴隨著許多生物化學(xué)變化的發(fā)生。比較明顯的生物化學(xué)變化有以下幾種:
細(xì)胞質(zhì)膜上磷脂酰絲氨酸翻轉(zhuǎn)。
線粒體內(nèi)膜喪失膜電位。
DNA被隨機(jī)切成大小不均一的片段。
凋亡相關(guān)蛋白的激活:包括Bcl-2家族蛋白、細(xì)胞色素c、Caspase家族蛋白等凋亡相關(guān)蛋白的激活。
No.3
細(xì)胞凋亡信號通路及相關(guān)因子
細(xì)胞凋亡通過信號傳導(dǎo)通路發(fā)生,有序而不失節(jié)奏的經(jīng)歷著啟動、進(jìn)行、結(jié)束的過程。每條傳導(dǎo)通路由于受到重要因子的精準(zhǔn)調(diào)控,天生兼具復(fù)雜而獨(dú)特的機(jī)制與氣質(zhì)。
介導(dǎo)凋亡的信號通路主要可分為3大類,分別是線粒體通路、死亡受體通路以及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)通路。各通路間相互作用、互相聯(lián)系,共同調(diào)節(jié)凋亡過程,每條通路中包含不同的實(shí)現(xiàn)途徑。
一、線粒體通路
線粒體通路
01
?Cyt C途徑
線粒體是細(xì)胞凋亡的調(diào)控中心,Cyt C作為關(guān)鍵性分子,是胞核基因編碼的蛋白質(zhì),其釋放介導(dǎo)的凋亡途徑與Bcl-2家族成員的調(diào)節(jié)控制有關(guān)。
受到凋亡刺激后(如:DNA的損傷、生長因子缺乏等),引起B(yǎng)ax/Bak形成低聚物復(fù)合體,插入到線粒體外膜孔隙,導(dǎo)致線粒體滲透壓改變,跨膜電位丟失,促使Cyt C從線粒體釋放到細(xì)胞質(zhì),并與細(xì)胞凋亡激活因子1(Apaf-1)結(jié)合形成凋亡復(fù)合體,活化Caspase-9前體,進(jìn)而激活Caspase-3和Caspase-7,引發(fā)Caspase級聯(lián)反應(yīng),從而誘發(fā)細(xì)胞凋亡。期間,Smac、Omi和ARTS等其他促凋亡蛋白抑制IAPs,共同促進(jìn)凋亡反應(yīng)。
02
?PTP通道
蛋白質(zhì)酪氨酸磷酸酶(protein tyrosine phosphatase,PTP)鑲嵌在線粒體內(nèi)膜和外膜之間,介導(dǎo)形成線粒體通透性轉(zhuǎn)換孔(Mitochondrial Permeability Transition Pore,MPTP),可以無選擇性地允許≤1.5 kD分子通過,當(dāng)線粒體基質(zhì)內(nèi)處于高滲透壓時(shí),通道開放引起凋亡。
二、死亡受體通路
死亡受體通路
死亡受體(DR)包括多種分子,均屬腫瘤壞死因子受體TNFR基因超家族。目前已知的死亡受體有5種,TNFR-1、Fas(CD95)、DR3、TRAIL-R1(DR4)和TRAIL-R2(DR5)。
01
?Fas/FasL和TRAILR/TRAIL途徑
作為腫瘤壞死因子TNF家族促凋亡成員,F(xiàn)asL和TRAIL分別與死亡受體Fas(CD95)、TRAIL-R1(DR4)或TRAIL-R2(DR5)結(jié)合,形成死亡誘導(dǎo)信號復(fù)合體(DISC),DISC包含接頭分子FADD和Caspase-8酶原,Caspase-8酶原自我剪切形成活性Caspase-8,啟動下游的Caspase級聯(lián)反應(yīng)。
其次,活化的Caspase-8能夠切割Bcl-2家族促凋亡蛋白Bid,產(chǎn)生的帶羧基片段tBid可以轉(zhuǎn)移到線粒體,與線粒體膜結(jié)合引起線粒體釋放Cyt C等促凋亡物質(zhì),引發(fā)凋亡反應(yīng)。
02
?TNFR1/TNF途徑
在TNFR-1介導(dǎo)的凋亡通路中,三聚化的TNFR-1募集接頭蛋白TRADD,TRADD通過自身的DD可匯聚FADD、RIP和TRAF-2。這里分2條通路:
當(dāng)結(jié)合的是FADD,便導(dǎo)致Caspase-8前體寡聚化,引發(fā)Caspase級聯(lián)反應(yīng)和凋亡;
當(dāng)結(jié)合的是RIP,便激活TRAF-2,形成TRADD-RIP-TRAF-2復(fù)合物,通過磷酸化進(jìn)一步激活NF-κB誘導(dǎo)激酶(NIK),NIK活化IκB激酶(IKK),IKK磷酸化IκB,導(dǎo)致NF-κB的降解和釋放,NF-κB轉(zhuǎn)位至細(xì)胞核發(fā)揮激活轉(zhuǎn)錄的作用,主要激活一些抗凋亡基因如c-IAP1等的轉(zhuǎn)錄,繼而通過抑制caspase-8的活化等途徑發(fā)揮抗凋亡作用。
因此,TNFR可能參與凋亡和抗凋亡兩種截然相反的信號途徑。TNFR通路活化后,細(xì)胞的發(fā)展方向取決于雙方的信號水平強(qiáng)弱等因素。
三、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)通路
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)通路
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)在細(xì)胞中負(fù)責(zé)蛋白的合成、加工和修飾。在病毒感染、鈣穩(wěn)態(tài)失調(diào)等的情況下,致使非折疊蛋白的累積和聚集,導(dǎo)致嚴(yán)重的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)(ER stress)。越來越多的研究顯示,持續(xù)的ER stress大多來源于非折疊蛋白反應(yīng)(unfolded protein response,UPR)狀態(tài)的改變。
01
?IRE1信號通路
UPR條件下,IRE1-JNK幫助細(xì)胞自救,是重要的信號通路。一方面,IRE1活性運(yùn)動可切割XBP-1 mRNA,使它成為有效的轉(zhuǎn)錄激活因子,誘導(dǎo)蛋白基因轉(zhuǎn)錄,編碼ER分子伴侶,緩解ER壓力。另一方面,IRE1可結(jié)合TRAF2,通過激酶活性增加ER stress,在ASK1存在條件下,激活JNK。持續(xù)的ER stress使得IRE1募集TRAF2,激活A(yù)SK和JNK的蛋白激酶,啟動凋亡級聯(lián)。
02
?PERK信號通路
ER stress增加PERK蛋白激酶活性,PERK磷酸化elF2,抑制蛋白翻譯和合成,緩解ER壓力。同時(shí),elF2的磷酸化能夠選擇性地啟動ATF4翻譯,增加其結(jié)合配體的合成,影響氨基酸代謝,從而抑制蛋白的翻譯和合成。
正常情況下,CHOP在細(xì)胞質(zhì)中維持低水平表達(dá)。當(dāng)ER stress發(fā)生時(shí),Bip/GRp78與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)跨膜蛋白PERK、ATF6等的解離均能激活CHOP。
CHOP誘導(dǎo)凋亡蛋白(如:GADD34、ERO1、DR5)的表達(dá),可直接激活GADD34,促進(jìn)ER下游蛋白的生物合成。實(shí)驗(yàn)顯示,氧化酶ERO1a很可能在二硫鍵形成過程中介導(dǎo)適應(yīng)性反應(yīng)失敗或持續(xù)性壓力。因此,CHOP的過度表達(dá)能夠?qū)е禄钚匝酰≧OS)的產(chǎn)生,引發(fā)ER stress,介導(dǎo)凋亡。同時(shí),CHOP的大量表達(dá),也可引起B(yǎng)cl-2表達(dá)的下降,導(dǎo)致Bax從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)至線粒體,啟動線粒體凋亡通路。
四、Ca2+途徑
Ca2+途徑
在體內(nèi),Ca2+濃度對維持線粒體膜的通透性起著重要作用,線粒體內(nèi)鈣離子濃度的上升會導(dǎo)致ROS的產(chǎn)生,進(jìn)而釋放Cyt C,誘導(dǎo)凋亡。
Ca2+也可維持內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的穩(wěn)定,并且調(diào)控了大量的酶反應(yīng)。其正常狀態(tài)的改變可引發(fā)ER stress,開啟JNK通路,刺激Bax活化。除此之外,Ca2+能夠調(diào)節(jié)Calpain,Calpain切割Bax N端,產(chǎn)生促凋亡片段,可促進(jìn)凋亡反應(yīng)。
No.4
細(xì)胞凋亡檢測方法
在生物學(xué)研究過程中常常需要檢測細(xì)胞凋亡情況。目前至少有十?dāng)?shù)種檢測細(xì)胞凋亡的方法,大致可分為基于細(xì)胞形態(tài)、生物學(xué)功能和生化標(biāo)記三大類。每一方法都有其優(yōu)缺點(diǎn),需要根據(jù)實(shí)際情況選擇最為適合的方法。
一、基于細(xì)胞形態(tài)的方法
基于細(xì)胞形態(tài)的方法
01
?電子顯微鏡檢測方法:
電鏡檢查是鑒定凋亡的金標(biāo)準(zhǔn)。
在透射電鏡下,凋亡細(xì)胞體積變小。凋亡Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei),染色質(zhì)高度盤繞,出現(xiàn)許多空泡結(jié)構(gòu);Ⅱa 期細(xì)胞核的染色質(zhì)高度凝聚、邊緣化;凋亡晚期出現(xiàn)核解體,產(chǎn)生凋亡小體。
缺點(diǎn):
無法定量(電鏡一個(gè)視野僅能觀察一兩個(gè)細(xì)胞)
實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣(固定、切片到拍照)
并非所有實(shí)驗(yàn)室都能接觸到電鏡。
02
?細(xì)胞核形態(tài)染色法
相比細(xì)胞凋亡的其他形態(tài)變化,利用熒光染料配合熒光顯微鏡對細(xì)胞核形態(tài)的觀察也是較為直接的指標(biāo)。常用的 DNA 特異性染料有:Hoechst、DAPI以及碘化丙啶(PI)。Hoechst 是與 DNA 特異結(jié)合的活性染料;DAPI 為半通透性,用于常規(guī)固定細(xì)胞的染色;PI不能透過完整的細(xì)胞膜,但在凋亡中晚期的細(xì)胞和死細(xì)胞,PI能夠透過細(xì)胞膜而將細(xì)胞核染紅。因此將Annexin-V與PI匹配使用,就可以將凋亡早晚期的細(xì)胞以及死細(xì)胞區(qū)分開來(Annexin-V/PI法)。
二、基于生物學(xué)功能的方法
基于生物學(xué)功能的方法
01
?Annexin-V/PI雙染色法
磷脂酰絲氨酸(Phosphatidylserine, PS)位于正常細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè),但在細(xì)胞凋亡的早期,PS可從細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè)翻轉(zhuǎn)到細(xì)胞膜的表面,暴露在細(xì)胞外環(huán)境中。Annexin V是一種Ca2+依賴磷脂結(jié)合蛋白,對PS具有高度親和力。將熒光標(biāo)記(FITC、PE或 biotin)的Annexin V作為探針,利用熒光顯微鏡或流式細(xì)胞儀可檢測細(xì)胞凋亡的發(fā)生。AnnexinV聯(lián)合PI法更加省時(shí),結(jié)果更為可靠,是目前最為理想的檢測細(xì)胞凋亡的方法
缺點(diǎn):
制備貼壁細(xì)胞樣品時(shí),很容易因消化和吹打造成細(xì)胞額外損傷,從而夸大了實(shí)驗(yàn)結(jié)果,增加了數(shù)據(jù)變異度。
凋亡細(xì)胞的本底熒光或非特異染色的特性會增強(qiáng),導(dǎo)致熒光飄移,導(dǎo)致定量不準(zhǔn)。
02
?線粒體膜電位檢測
線粒體跨膜電位的下降也是凋亡細(xì)胞一個(gè)重要特點(diǎn),是細(xì)胞凋亡過程中最早發(fā)生的事件(早于核形態(tài)的變化和PS的外翻)。一旦線粒體跨膜電位崩潰,細(xì)胞就會進(jìn)入不可逆的凋亡過程。一些親脂性陽離子熒光染料如 Rhodamine 123、DiOC6、JC-1、TMRM等,在線粒體跨膜電位存在的情況下可結(jié)合到線粒體基質(zhì),通過熒光顯微鏡觀察其熒光的增強(qiáng)或減弱可反應(yīng)線粒體內(nèi)膜電負(fù)性的增高或降低。
三、基于生化標(biāo)記方法Caspase-3活性檢測
基于生化標(biāo)記方法Caspase-3活性檢測
Caspase(cysteinyl-aspartic acid proteases)蛋白家族的活化是細(xì)胞凋亡的典型特征,在介導(dǎo)細(xì)胞凋亡過程中具有非常重要的作用。其中Caspase-3作為關(guān)鍵的執(zhí)行分子在細(xì)胞凋亡信號傳導(dǎo)的許多途徑中發(fā)揮功能。Caspase-3正常細(xì)胞中以酶原形式存在,在凋亡早期被的活化,但在凋亡晚期及死亡細(xì)胞中,Caspase-3活性顯著下降。因此在試驗(yàn)過程中可以通過檢測檢測Caspase剪切體的含量或Caspase的活性來反應(yīng)細(xì)胞凋亡過程。
01
1、DNA損傷檢測
在細(xì)胞凋亡的后期,Caspase會激活Caspase-ActivatedDNase(CAD),切割核小體之間的DNA,形成以180-200bp為單位的DNA片段,經(jīng)瓊脂糖電泳后形成DNAladder。
缺點(diǎn):
耗時(shí),無法定量,以及結(jié)果不穩(wěn)定
02
?DNA片段原位標(biāo)記
細(xì)胞死亡(凋亡或壞死)時(shí),DNA發(fā)生斷裂。此時(shí)大量的粘性 3'-OH 末端,可在脫氧核糖核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶(TdT)的作用下,將脫氧核糖核苷酸和熒光素、過氧化物酶、堿性磷酸酶或生物素形成的衍生物標(biāo)記到 DNA 的 3'- 末端,從而可進(jìn)行凋亡細(xì)胞的檢測。
缺點(diǎn):
一般只用于組織切片樣本的研究
不能區(qū)分凋亡與壞死