伴隨著關東軍的失敗，反對董卓亂政的主角來到了王允這里。王允是董卓最為信賴的人，董卓遷都長安后，把洛陽交給王允來打理。王允得到董卓信賴的原因在于比較聽話。

背地里，王允也在集聚反對董卓的勢力，一個是司隸校尉黃琬，因為勸董卓不遷都被董卓免官，有一定的怨氣。另一個是鄭泰，鄭泰曾經(jīng)委婉勸董卓不用進兵，董卓表示贊同，卻沒讓鄭泰掌握兵權。

《后漢書·王允傳》：時董卓尚留洛陽，朝政大小，悉委之于允。允矯情屈意，每相承附，卓亦推心，不生乖疑，故得扶持王室于危亂之中，臣主內外，莫不倚恃焉。 允見卓禍毒方深，篡逆已兆，密與司隸校尉黃琬、尚書鄭公業(yè)等謀共誅之。乃上護羌校尉楊瓚行左將軍事，執(zhí)金吾士孫瑞為南陽太守，并將兵出武關道，以討袁術為名，實欲分路征卓，而后拔天子還洛陽。卓疑而留之，允乃引內瑞為仆射，瓚為尚書。

《后漢書·黃琬傳》：卓議遷都長安，琬與司徒楊彪同諫不從。琬退而駁議之曰：“昔周公營洛邑以寧姬，光武卜東郡以隆漢，天之所啟，神之所安。大業(yè)既定，豈宜妄有遷動，以虧四海之望？”……琬竟坐免。卓猶敬其名德舊族，不敢害。

《后漢書·鄭泰傳》：公業(yè)恐其眾多益橫，兇強難制，獨曰：“夫政在德，不在眾也?！弊坎粣偅?，“如卿此言，兵為無用邪？”公業(yè)懼，乃詭詞更對曰……卓乃悅……或說卓曰：“鄭公業(yè)智略過人，而結謀外寇，今資之士馬，就其黨與，竊為明公懼之?！?strong>卓乃收還其兵，留拜議郎。

為了計劃順利進行，王允舉薦了楊瓚和士孫瑞，打算拿到兵權，但董卓看穿了王允的計劃，沒有批準。王允只能等待時機。這個士孫瑞曾經(jīng)勸王允接受溫侯的封賞，得到王允的贊同。在執(zhí)行過程中，士孫瑞也勸王允把握時機。王允采納他的計劃，有意識結交與董卓結為父子的呂布。按照《三國志》記載，王允最早和呂布就有一定的交情，這也是王允選擇呂布的原因。

《后漢書·王允傳》：乃上護羌校尉楊瓚行左將軍事，執(zhí)金吾士孫瑞為南陽太守，并將兵出武關道，以討袁術為名，實欲分路征卓，而后拔天子還洛陽。卓疑而留之，允乃引內瑞為仆射，瓚為尚書。

同上：士孫瑞說允曰：“夫執(zhí)謙守約，存乎其時。公與董太師并位俱封，而獨崇高節(jié)，豈和光之道邪？”允納其言，乃受二千戶。

同上：瑞曰：“自歲末以來，太陽不照，霖雨積時，月犯執(zhí)法，彗孛仍見，晝陰夜陽，霧氣交侵，此期應促盡，內發(fā)者勝。幾不可后，公其圖之?！?strong>允然其言，乃潛結卓將呂布，使為內應。

《三國志·呂布傳》：先是，司徒王允以布州里壯健，厚接納之。后布詣允，陳卓幾見殺狀。時允與仆射士孫瑞密謀誅卓，是以告布使為內應。