蛋白質(zhì)印記實驗(Western blot )技術(shù)分享
? ? ?大家好,今天要給大家分享的是分子生物學(xué)實驗中常用的一項技術(shù):蛋白質(zhì)印記實驗(Western blot )。Western Blot(WB)可以說是做分子實驗的同學(xué)最長用、也是最肝的一個實驗了。WB可以通過分析蛋白著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細胞或組織中的表達情況相關(guān)信息,廣泛應(yīng)用于基因在蛋白水平的表達研究、抗體活性檢測和疾病早期診斷等多個方面。相信同學(xué)們在熟練掌握了WB這門技術(shù)后,實驗進度和發(fā)paper的速度都能得到顯著提升(手動狗頭)。下面我將會從WB簡介、WB常用試劑配制、WB實驗步驟及其原理三個方面來進行介紹。
1.Western blot簡介
??????? Western Blot即蛋白質(zhì)印跡法,由瑞士米歇爾弗雷德里希生物研究所(Friedrich Miescher Institute)的Harry Towbin在1979年提出的,在尼爾·伯奈特(Neal Burnette)于1981年所著的《分析生物化學(xué)》(Analytical Biochemistry)中首次被稱為Western Blot。Western Blot是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實驗方法?;驹戆ǖ鞍踪|(zhì)電泳、抗原抗體特異性反應(yīng)及辣根過氧化物酶(HRP)催化顯色等。Western Blot可以通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細胞或組織中表達情況的信息。
????????Western Blot主要步驟包括蛋白提取-電泳-轉(zhuǎn)膜-封閉-一抗孵育-二抗孵育-顯影曝光等步驟,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于基因在蛋白水平的表達研究、抗體活性檢測和疾病早期診斷等多個方面。

2.WB試劑配制
2.1 TBST(10X 緩沖液 1L):Tris base,24 g;NaCl,88 g
2.2 Running buffer(10X 0.5L):Tris base,15.1g;甘氨酸93.75g;SDS,5g
2.3 Trans buffer(1X 1L):Glycine 2.90 g,Tris 5.80 g,SDS 1g,甲醇 200,ddH2O定容至1 L.(注:小批量的WB實驗也可直接用Running buffer配制)
相關(guān)試劑配方鏈接:
https://wenku.baidu.com/view/f410b54be518964bcf847cfc.html?_wkts_=1676012791897
2.4封閉液及抗體稀釋液:5% BSA或者牛奶(注:磷酸化蛋白不能用牛奶封閉,奶粉中含有大量酪氨酸,可使磷酸化蛋白的條帶變淺)
3.Western blot實驗步驟及相關(guān)原理:
3.1蛋白樣品制備:分為細胞和組織(提取原理相似:主要為通過各種手段將組織/細胞破碎,使蛋白質(zhì)釋放,然后通過高速離心,去除組織/細胞碎片,下面以細胞為例進行講解)
3.1.1裂解液準備:RIPA裂解液+PMSF(蛋白酶抑制劑)= 100:1
3.1.2裂解細胞,細胞刮刮取細胞(注:加裂解液裂解蛋白前,需將PBS洗干凈,否則會稀釋蛋白濃度)
3.1.3離心,取上清液(蛋白質(zhì)在上清中)
3.1.4蛋白質(zhì)定量:蛋白質(zhì)定量有雙縮脲法、Lowry法、Bardford法和BCA法。這里主要介紹BCA法。原理:蛋白質(zhì)可在堿性環(huán)境下將2價銅離子還原為1價銅離子,而1價銅離子可以與BCA試劑發(fā)生顏色反應(yīng),2分子的BCA螯合后可形成紫色的復(fù)合物,這種復(fù)合物具有非常好的吸光性(用OD值反應(yīng))。在562nm的紫外光下,溶液中復(fù)合物的OD值與蛋白濃度在一定范圍內(nèi)呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系。我們可以通過這種線性關(guān)系大致地計算出自己的樣品中總蛋白濃度。步驟依據(jù)各個廠商的試劑盒說明書進行。
3.1.5蛋白變性:加入5X或者1X的蛋白上樣緩沖液,96℃以上水浴10min,使蛋白充分變性,解除二級或三級結(jié)構(gòu),只保留一級鏈式結(jié)構(gòu)。上樣緩沖液一般成分及作用:SDS,可使得蛋白裹上足量的負電荷,所帶的負電荷大大超過了蛋白原有的電荷,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異;DTT還原劑,可打開巰基維持單鏈的線性結(jié)構(gòu);甘油,可起沉降作用使得混合的樣本沉降到加樣孔底部,不會逸散至加樣孔以外;溴酚藍為小分子藍色物質(zhì),有指示作用。
3.2 SDS-PAGE凝膠電泳:
3.2.1 SDS-PAGE凝膠制備:可以依據(jù)所需要顯影蛋白分子量的大小選定不同濃度的濃縮膠。
原理:聚丙烯酰胺凝膠為網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),具有分子篩效應(yīng)。在SDS-PAGE凝膠電泳中,蛋白質(zhì)能夠保持完整狀態(tài),電泳的速度與蛋白質(zhì)的分子量大小、結(jié)構(gòu)及其電荷量有關(guān),據(jù)此可以將蛋白質(zhì)分離開。

凝膠主要成分及其作用:
30%聚丙烯酰胺+Tris-HCL:凝膠主要結(jié)構(gòu)。
過硫酸銨(APS)+N,N,N',N'-四甲基乙二胺(TEMED)(注:神經(jīng)毒性):促凝劑
十二烷基硫酸鈉(SDS):陰離子表面活性劑和強還原劑,可以斷裂蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級結(jié)構(gòu)。并且可以使蛋白帶負電,統(tǒng)一蛋白電性。
不同濃度濃縮膠的配方鏈接:http://www.eiaab.cn/article/show/id/21724.html
3.2.2?電泳:恒壓電泳,通常設(shè)置參數(shù)為——濃縮膠:80V/30min;分離膠120V/1.5h(注:利用低壓先將蛋白壓縮到同一平面,高壓將蛋白依據(jù)不同分子量分離開來)。
3.3電轉(zhuǎn)印
??轉(zhuǎn)膜分為半干轉(zhuǎn)和濕轉(zhuǎn)兩種類型,其原理均為將凝膠中的蛋白通過電流轉(zhuǎn)移到固相支持物上(注:恒流)。常用的固相支持物包括NC膜和PVDF膜,這兩種膜表面都有肉眼不可見的小孔,都可以用來電轉(zhuǎn)印。NC膜全稱硝酸纖維素膜,帶負電荷的蛋白質(zhì)可以與膜發(fā)生疏水作用而結(jié)合到一起,價格便宜,韌性差易碎,但易于封閉非特異性結(jié)合;PVDF膜全稱聚偏二氟乙烯膜(注:使用前需用無水甲醇活化,活化膜表面的正電基團,使之跟易與負電蛋白結(jié)合),易于吸附蛋白質(zhì),價格貴,韌性強,適合小分子量蛋白電轉(zhuǎn)印。


3.4封閉
??封閉常采用5%的脫脂奶粉或胎牛血清,室溫下,搖床孵育膜1-2h。(注:磷酸化蛋白必須使用胎牛血清封閉,因為奶粉中含有大量酪氨酸,可使磷酸化蛋白的條帶變淺,甚至消失,同時也可能出現(xiàn)較高背景)。
??封閉原理:電轉(zhuǎn)后蛋白質(zhì)已遷移至膜的表面,此時膜上還存在大量的、未吸附蛋白質(zhì)的小孔。此時我們采用牛奶或胎牛血清封閉,其中包含大量的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)會吸附在那些小孔上,堵住這些孔。如果沒有封閉,那么在下一步我們添加的一抗將同時吸附在目標(biāo)蛋白和膜表面其它位置,且很難洗掉,最終ECL發(fā)光檢測時可出現(xiàn)非特異性條帶、雜帶、高背景等等,浪費抗體不說,還會影響最終的判斷。當(dāng)然,這些奶粉中的蛋白也會一定程度地吸附到目標(biāo)蛋白表面,但是抗原-抗體特異性反應(yīng)相比,這種非特異性的結(jié)合會很輕松的在后面漂洗步驟中消除。
3.5 抗原-抗體免疫反應(yīng)
??這一步是包括一抗與目的蛋白的免疫反應(yīng)及二抗與一抗的免疫反應(yīng),其原理類似于雙抗體夾心ELISA分析。

首先利用一抗撲獲特異性的抗原蛋白(目的蛋白),然后利用二抗撲獲種屬特異性的一抗。并二抗上通常用辣根過氧化物酶標(biāo)記(HRP),可以催化發(fā)光液上的魯米諾(lumino)底物顯色,從而可以檢測到目的蛋白。
??首先是一抗與目的蛋白表面的抗原表位結(jié)合。比較重要的是一抗孵育溫度和時間,最常用的條件是4℃搖床過夜孵育,溫度適宜,分子運動溫和。有人也用37℃孵育1-2h,可能會成功,但是溫度越高,分子間的運動越激烈,那么出現(xiàn)非特異性雜帶的可能性就越高;同時孵育時間較短,也可能會導(dǎo)致一抗與目標(biāo)蛋白結(jié)合不充分。
??一抗結(jié)合之后,就是采用的二抗與一抗結(jié)合,而二抗蛋白結(jié)通常用HRP辣根過氧化物酶標(biāo)記,可與發(fā)光底物相結(jié)合,該底物極強的信號輸出能夠使皮克量的蛋白得到檢測。
??就筆者個人經(jīng)驗而言,一抗孵育這一步即是WB中最重要的一步,又是最不重要的一步。特異性高的一抗,WB用腳跑都能跑出來;特異性差的抗體,WB發(fā)明人都不一定做得出來。建議不要省錢買國產(chǎn)抗體,你懂得。買抗體之前,看看近年發(fā)的高分文章,查查他們用的什么哪個公司抗體。如果找不到參考,一定要買經(jīng)過該抗體公司敲除驗證過的抗體。
3.6 辣根過氧化物酶(HRP)蛋白檢測
? 蛋白顯影目前較多采用的是ECL化學(xué)發(fā)光法,ECL工作液包括A液和B液:魯米諾和過氧化物,二者避光保存,現(xiàn)配現(xiàn)用(1:1配制),目標(biāo)條帶將在黑暗環(huán)境下發(fā)出熒光,熒光會進一步膠片上曝光,熒光越強則膠片上曝光的條帶越黑,最后洗出膠片即可。
??顯影原理:ECL試劑檢測的核心原理為氧化反應(yīng)發(fā)光:魯米諾(lumino)作為發(fā)光底物的主要成分,在堿性條件下,通過辣根過氧化酶(HRP)催化,被H2O2氧化生成3-氨基鄰苯二酸的激發(fā)態(tài)中間體,當(dāng)其回到基態(tài)時發(fā)出光子,最大發(fā)射波長為425 nm。光子信號可通過X射線膠片或CCD成像儀被捕獲。

本文作者:LGN
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???????本文主要分享了一些有關(guān)蛋白質(zhì)印記(Western blot)技術(shù)的相關(guān)知識。作者能力有限,一些更深層次的內(nèi)容歡迎大家在討論區(qū)補充,也歡迎有相關(guān)研究方向的學(xué)者一起討論交流,謝謝大家!
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