零基礎(chǔ)? 無代碼? 平臺(tái)一鍵成論文

練習(xí)數(shù)據(jù)及公共數(shù)據(jù)

01

公共數(shù)據(jù)集網(wǎng)站，可以從里面挑自己感興趣的數(shù)據(jù)下載練手

https://grand-challenge.org/challenges/?page=1

https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetoverview

實(shí)驗(yàn)過程需要解決的問題

02

一、?勾畫roi需要保存原始數(shù)據(jù)，原始數(shù)據(jù)一個(gè)文件夾，roi一個(gè)文件夾，文件名字一一對(duì)應(yīng)即可，不能含有中文

二、基于勾畫的ROI做癌癥患者早期反應(yīng)和預(yù)測(cè)模型任務(wù)具體步驟

1、將識(shí)別出來的ROI區(qū)域進(jìn)行預(yù)測(cè)模型建立。

2、采?影像組學(xué)的思路進(jìn)行臨床預(yù)測(cè)模型建立。具體

? ?1) 對(duì)影像（nii或者nii.gz）數(shù)據(jù)，使用pyradiomics進(jìn)行特征提取，得到rad_feature。

? ?2) 對(duì)這些特征進(jìn)行正則化（Z-score），將數(shù)據(jù)服從 N~(0, 1)。

? ?3) 對(duì)提取的組學(xué)特征rad_feature，使用spearman相關(guān)系數(shù)，計(jì)算特征之間的相關(guān)性。對(duì)于相關(guān)系數(shù)大于0.9的特征，兩者保留其一，得到rad_sel_feature。

? ?4) 使用Lasso對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行交叉驗(yàn)證，篩選最好的懲罰系數(shù)lambda。

? ?5) 篩選出系數(shù)不為0的特征，對(duì)rad_sel_feature進(jìn)行進(jìn)一步降維得到rad_final。系數(shù)不為0的特征，組合成rad_score公式。

? ?6) 采用5折交叉驗(yàn)證，使用多種機(jī)器學(xué)習(xí)算法模型（LR、SVM、DT、RF、ExtraTree、XGBoos等）對(duì)rad_final_train進(jìn)行訓(xùn)練。

3、在rad_final_val上進(jìn)行不同算法模型驗(yàn)證。得到常見指標(biāo)驗(yàn)證以及結(jié)果可視化

4、準(zhǔn)確率、AUC、ROC曲線、DCA、校準(zhǔn)曲線，混淆矩陣等結(jié)合臨床數(shù)據(jù)，給出預(yù)測(cè)結(jié)果

一站式的工具組件直接用

03

參考文獻(xiàn)及視頻講解

04

掃碼觀看視頻講解及論文

一鍵成論文介紹

05

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? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??試用平臺(tái)聯(lián)系趙老師