實驗技巧 | Western Blot實戰(zhàn)經(jīng)驗匯總
1、轉膜不充分
(1)膜沒有完全均勻濕透 使用100% methanol浸透膜。 (2)靶蛋白分子量小于10 000 選擇小孔徑的膜,縮短轉移時間。 (3)靶蛋白等電點等于或接近轉移緩沖液pH值 可嘗試使用其他緩沖液如CAPS緩沖液(pH 10.5)或使用低pH值緩沖液如乙酸緩沖液。 (4)甲醇濃度過高 過高甲醇濃度會導致蛋白質與SDS分離,從而沉淀在凝膠中,同時會使凝膠收縮或變硬,從而抑制高分子量蛋白的轉移。降低甲醇濃度或者使用乙醇或異丙醇代替。 (5)轉移時間不夠 對于厚的膠以及高分子量蛋白需要延長轉移時間。
2、背景高
(1)膜沒有完全均勻濕透 使用100% methanol浸透膜。 (2)洗膜不充分 增加洗液體積和洗滌次數(shù)。 (3)阻斷不充分 增加封閉液孵育時間,或者提高溫度。選擇合適的封閉試劑(脫脂奶粉,BSA,酪蛋白等)。 (3)二抗?jié)舛冗^高 降低二抗?jié)舛取?(4)檢測過程中膜干燥 保證充分的反應液,避免出現(xiàn)干膜現(xiàn)象。 (5)曝光過度 縮短曝光時間。 (6)抗體與阻斷蛋白有交叉反應 檢測抗體與阻斷蛋白的交叉反應性,選擇無交叉反應的封閉劑。洗滌液中加入Tween-20可減少交叉反應。
3、沒有陽性條帶
(1)抗體染色不充分 增加抗體濃度,延長孵育時間。 (2)酶失活 直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯(lián)物。 (3)標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 設置陽性對照,如果陽性對照有結果,但標本沒有則可能是標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考慮增加標本上樣量解決靶蛋白含量低的原因。 (4)試劑不匹配 一抗與組織種屬,一抗與二抗或/和底物與酶系統(tǒng)之間不匹配。通過設置內參照可以驗證二級檢測系統(tǒng)的有效性。 (5)一抗失效 選擇在有效期內抗體;并選擇現(xiàn)配現(xiàn)用的工作液。 (6)HRP抑制劑 所用溶液和容器中避免含有疊氮化鈉。
4、有陽性條帶,但條帶比較弱
(1)抗體染色不充分 增加抗體濃度,延長孵育時間。 (2)酶活性降低 直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯(lián)物。 (3)標本中靶蛋白含量太低 增加標本上樣量。 (4)洗膜過度 縮短洗滌時間。 (5)HRP抑制劑 所用溶液和容器中避免含有疊氮化鈉。 (6)抗體活性降低 選擇在有效期內的抗體,工作液現(xiàn)配現(xiàn)用,避免長時間放置。 (7)封閉過度 減少封閉劑的量或縮短時間;換用不同封閉劑類型。 (8)曝光時間過短 延長曝光時間。 (9)HRP抑制劑 所用溶液和容器中避免含有疊氮化鈉。
5、條帶位置(大小)不對;或有非特異性條帶
(1)二抗的非特異性結合 增加一個對照:不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否由二抗系統(tǒng)來源。選擇其他二抗(特異性更強的,只針對重鏈的)。 (2)一抗的特異性不夠 使用單克隆或者親和純化的抗體,保證抗體的特異性。 (3)蛋白降解 使用新鮮制備的標本,并使用蛋白酶抑制劑。 (4)二聚體或多聚體存在 增加蛋白質變性過程及強度。 (5)抗體濃度過高 降低抗體(一抗、二抗)濃度,可以減少非特異性條帶。 (6)蛋白上樣量過大 降低上樣量。
6、背景有斑點
(1)封閉劑中有聚集體 使用前過濾封閉試劑。 (2)HRP耦聯(lián)二抗中有聚集體 過濾二抗試劑,去除聚集體。
7、膜上出現(xiàn)反像(暗背景上白色帶)
(1)HRP含量過高 降低酶聯(lián)二抗的濃度。