PROTAC檢測(cè)板試劑盒測(cè)定實(shí)例分析
LifeSensors的PROTAC檢測(cè)板試劑盒用于泛素化的相對(duì)測(cè)定PROTAC處理后細(xì)胞裂解物中靶蛋白的表達(dá)。此檢測(cè)旨在取代更費(fèi)力的半定量蛋白質(zhì)印跡方法來(lái)檢測(cè)多泛素化和靶蛋白在細(xì)胞中的降解,并提供定量和可重復(fù)的結(jié)果。此外,該測(cè)定允許高通量篩選以處理化合物文庫(kù)和建立秩序效價(jià)幫助化學(xué)家建立SAR。這塊板是為研究而設(shè)計(jì)的僅使用,不用于人類或動(dòng)物的診斷或治療應(yīng)用。
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艾美捷PROTAC檢測(cè)板試劑盒#LSS-PA-0950-0096檢測(cè)原理:
Assay Plate是一種基于三明治的檢測(cè)方法,其中來(lái)自細(xì)胞裂解物被捕獲在預(yù)涂微量滴定板的孔中,使用專有的多泛素結(jié)合試劑。未被多泛素化/未結(jié)合的蛋白質(zhì)通過(guò)洗滌,然后加入針對(duì)靶蛋白的抗體,然后洗滌。最后,使用與辣根過(guò)氧化物酶(HRP)偶聯(lián)的第二抗體來(lái)測(cè)量
結(jié)合的目標(biāo)抗體與檢測(cè)試劑和發(fā)光微孔板讀取器。
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PROTAC檢測(cè)板試劑盒組件:
涂層板:?一個(gè)預(yù)包被和封閉的?96?孔試紙?PROTAC?檢測(cè)板(儲(chǔ)存在?-80°C)
封閉濃縮物(BC):?12 mL?用于抗體稀釋的?5X?封閉劑(儲(chǔ)存在?4°C)
塑料板密封:?雙板密封
檢測(cè)試劑?1?(DR1):?1.0 mL DR1?試劑瓶(儲(chǔ)存在?4°C)
檢測(cè)試劑?2?(DR2):?1.0 mL DR2?試劑瓶(儲(chǔ)存在?4°C)
MG132:?25?μL?小瓶(DMSO?中為?10 mM;儲(chǔ)存在?-20°C)
PR-619:?25?μL?小瓶(DMSO?中為?22 mM;儲(chǔ)存在?-20°C)
1,10-菲咯啉:?100?μL?小瓶(DMSO?中為?500 mM;儲(chǔ)存在?-20°C)
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協(xié)議:
1.從冰箱中取出盤(pán)子,從冰箱中取下試劑,使其達(dá)到室溫(RT)。所有孵育均在室溫(22°-27°C)下進(jìn)行。為避免交叉污染,請(qǐng)勿重復(fù)使用銘牌密封劑。
2.制備細(xì)胞裂解物,并使用用PBS稀釋的15-20μg/孔(Vt=50-100μl/孔)。
3.在室溫下?lián)u動(dòng)培養(yǎng)板2小時(shí)。
4.帶PBST的洗滌板(4 x 180mL/井)。最后一次洗滌后,輕輕去除最后一滴緩沖液在紙巾或其他吸墨紙上輕拍盤(pán)子(倒置)。不允許井完全干燥。
5.在1x封閉劑中稀釋一次抗體(稀釋取決于一次抗體的效率;良好開(kāi)始稀釋為1μg/mL),加入50-100μL/孔,并在室溫下振蕩培養(yǎng)板1小時(shí)。
6.?按照上述步驟重復(fù)洗滌(參見(jiàn)步驟4)。
7.?在1x封閉劑中稀釋第二HRP綴合的抗體(根據(jù)制造商),加入50-100μL/孔,在室溫下?lián)u動(dòng)培養(yǎng)板1小時(shí)。
8.?按照上述步驟重復(fù)洗滌(參見(jiàn)步驟4)。
9.?使用前,將800μL DR1和800μL DR 2混合到10 mL超純水(去離子或蒸餾)。向每個(gè)孔中添加50-100μL該溶液,并使用針對(duì)化學(xué)發(fā)光5-10次,間隔1分鐘。
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注意事項(xiàng):
1.為了監(jiān)測(cè)目標(biāo)蛋白的多泛素化及其降解,并且在PROTAC的Dmax之后。
2.通過(guò)蛋白質(zhì)印跡優(yōu)化抗體稀釋度和靶蛋白的特異性。目標(biāo)的選擇抗體應(yīng)該適用于基于夾心ELISA的測(cè)定。
3.根據(jù)目標(biāo)豐度優(yōu)化裂解物濃度。
4.參見(jiàn)下面建議的裂解緩沖液,以具有目標(biāo)蛋白的最佳多泛素化譜。
5.包括最佳結(jié)果和解釋的適當(dāng)控制
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細(xì)胞裂解方案:
1.完全吸取培養(yǎng)基,并用冰冷的1X PBS沖洗細(xì)胞。用1X適當(dāng)刮除單元格PBS,離心以沉淀細(xì)胞并除去PBS。
2.在-80°C下冷凍細(xì)胞沉淀以長(zhǎng)期儲(chǔ)存或在冰上進(jìn)行裂解。
3.加入RIPA裂解緩沖液(顆粒體積的5-10倍,即100mL顆粒添加500-1000μL裂解緩沖器)。間歇性渦旋10-15分鐘,同時(shí)將樣品保持在冰上以進(jìn)行有效的裂解。
4.在4°C下以13000 xg離心15-20分鐘。
5.收集上清液(裂解物)并使用標(biāo)準(zhǔn)方法測(cè)定蛋白質(zhì)濃度。
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PROTAC檢測(cè)板試劑盒測(cè)定實(shí)例:

圖1:(A)?Jurkat細(xì)胞未經(jīng)處理(DMSO)或用dBET1 PROTAC(0.01-12.0μM)處理45分鐘。按照PROTAC測(cè)定板。結(jié)果表示為平均化學(xué)發(fā)光度的倍數(shù)變化±標(biāo)準(zhǔn)偏差(n=3)。
(B) 對(duì)如(A)中處理的Jurkat細(xì)胞的細(xì)胞裂解物(25μg)進(jìn)行BRD3和β-肌動(dòng)蛋白的免疫印跡。蛋白酶體抑制劑MG132用作對(duì)照以防止BRD3降解。
圖2:(A) 用dBET1 PROTAC(1μM)處理Jurkat細(xì)胞不同時(shí)間(0-120分鐘)。細(xì)胞裂解物(15μg/孔)按照PROTAC測(cè)定板手冊(cè)中所述進(jìn)行處理。結(jié)果表示為平均化學(xué)發(fā)光強(qiáng)度的倍數(shù)變化±標(biāo)準(zhǔn)偏差(n=3)。
(B) 對(duì)如(A)中處理的Jurkat細(xì)胞的細(xì)胞裂解物(25μg)進(jìn)行BRD3和β-肌動(dòng)蛋白的免疫印跡。蛋白酶體抑制劑MG132用作對(duì)照以防止BRD3降解。
圖3:(A-B)用PROTAC(1μM)處理K562細(xì)胞不同時(shí)間。細(xì)胞裂解物(15μg/孔)按照手冊(cè)中所述進(jìn)行處理PROTAC測(cè)定板(目錄號(hào)PA950)。結(jié)果表示為平均化學(xué)發(fā)光度的倍數(shù)變化±標(biāo)準(zhǔn)偏差(n=3)。
(C) 對(duì)來(lái)自如(A)中處理的K562細(xì)胞的細(xì)胞裂解物(25μg)進(jìn)行BTK和AURKA的免疫印跡。使用MG132作為對(duì)照(最后一條車(chē)道)。