病毒RNA研究丨病毒RNA分離快速試劑盒
研究病毒RNA本身以更多地了解不同的改變和表觀遺傳學(xué)變化如何使這些病毒更具彈性和更具感染力,或者研究從細(xì)胞和組織中收集的RNA以了解這些不同病原體對宿主細(xì)胞功能的影響,這項(xiàng)研究努力幾乎是無盡的~
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一?m6A修飾對RNA病毒生命周期的影響
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已知表觀遺傳修飾會(huì)影響人冠狀病毒等RNA病毒的生命周期。據(jù)報(bào)道,像N6-甲基腺苷(m6A)這樣的修飾腺苷通過調(diào)節(jié)病毒帽結(jié)構(gòu)、病毒基因表達(dá)、病毒子代、先天性感應(yīng)途徑和先天性免疫反應(yīng)來影響特定RNA病毒的生存能力。m6A的獲得或喪失可導(dǎo)致RNA病毒發(fā)生顯著的功能變化,改變宿主細(xì)胞的融合/進(jìn)入、復(fù)制、傳播、病原體強(qiáng)度和免疫逃避。宿主細(xì)胞的m6A表型組在宿主抵抗力中起著重要作用,病毒感染后也可發(fā)生改變。SARS-CoV-2基因組長度超過29800個(gè)核苷酸,根據(jù)RNA甲基化酶復(fù)合物METTL3/14對m6A修飾的特定序列座的存在,包括GGACU(T)、GGACA和GGACC,包含50多個(gè)潛在的m6A位點(diǎn)。因此,SARS-CoV-2 RNA中>0.64%的腺苷,或0.18%的堿基可能是m6A。因此,總RNA中m6A的定量和全轉(zhuǎn)錄組m6A圖譜的繪制對于研究m6A相關(guān)的病毒功能和相應(yīng)的機(jī)制,以及確定新的抗病毒治療靶點(diǎn)至關(guān)重要。
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二?病毒RNA提取
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無論您是從細(xì)胞,組織還是病毒的樣品開始,有效的RNA分離通常是成功進(jìn)行實(shí)驗(yàn)的步。對于病毒:另一方面,當(dāng)涉及病毒樣品時(shí),諸如病毒滴度低和污染性宿主核酸的高存在之類的挑戰(zhàn)需要使用補(bǔ)充技術(shù)來確保產(chǎn)量和純度符合下游要求。在我們zui近的公告文章中,我們概述了可以完成此操作的10種方法,因此您可以將其應(yīng)用到zui適合您的學(xué)習(xí)的方法中。一種方法是接種細(xì)胞培養(yǎng)物進(jìn)行病毒擴(kuò)增,然后收集擴(kuò)增的病毒體,以與EpiGentek的病毒RNA提取試劑盒一起使用。注意:對于直接從臨床標(biāo)本中提取的病毒RNA,在m6A RNA富集之前,需要額外的處理以去除共提取的宿主DNA和rRNA污染物。
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三?病毒RNA提取試劑盒
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病毒RNA提取產(chǎn)品我們主要有2種:RNA穩(wěn)健的旋轉(zhuǎn)柱和磁性試劑盒我們的每一個(gè)試劑盒都是為了提取高質(zhì)量的RNA而設(shè)計(jì)的,除了用于RT-PCR之外,還可以用于其他下游應(yīng)用。我們的試劑盒在提取方法以及通量選項(xiàng)(高/手動(dòng))的類型上有所不同,因此無論您的實(shí)驗(yàn)室需要什么,我們的試劑盒都可以幫助您獲得隨時(shí)可用的純化病毒RNA。我們的各種磁珠和自旋柱試劑盒可以從不同的樣品來源(鼻腔/鼻咽拭子、細(xì)胞/組織)和物種(病毒、哺乳動(dòng)物)中分離RNA。洗滌劑和潮解鹽用于裂解細(xì)胞和滅活RN酶。專門的高鹽緩沖系統(tǒng)使RNA堿基與磁珠結(jié)合到自旋柱的玻璃纖維基質(zhì)上,同時(shí)污染物被有效地洗去。純核酸用水緩沖液洗脫,不需要苯酚提取或酒精沉淀。具體操作流程如下:

P-9107(旋轉(zhuǎn)柱)EpiQuik Viral RNA Isolation Fast KitEpiQuik病毒RNA分離快速試劑盒是一整套優(yōu)化的緩沖液和試劑,適用于從無細(xì)胞液體樣本(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA。旋轉(zhuǎn)柱法純化。10min。
P-9108(磁珠法)EpiMag Viral RNA Isolation Kit (Magnetic Beads)適用于從無細(xì)胞液體樣品(不包括血漿和血清),特別是唾液和鼻咽或鼻咽拭子中快速制備病毒RNA,磁珠法,25min。
P-9109(磁珠法)EpiMag 96-Well Viral RNA Extraction Kit (High Throughput)適用于從無細(xì)胞液體樣品(不含血漿和血清)中制備磁珠,以高通量方式快速制備病毒RNA。 ),高通量,磁珠法,30min。
結(jié)果:

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Abbexa熱門產(chǎn)品研究:https://www.amyjet.com/brand/Abbexa.shtml