安捷倫片段化分析儀，英文全稱Fragment Analyzer，簡稱FA。 又因為其基于毛細管電泳原理（?capillary electrophoresis），又被部分客戶簡稱CE。該儀器的前身是美國Advanced Analytical Technologies（AATI）公司研發(fā)生產(chǎn)的新型突變檢測及核酸片段分析系統(tǒng)，在2018年被安捷倫收購后，被整合進安捷倫的自動化電泳系統(tǒng)產(chǎn)品線。

儀器型號：

檢測原理：

毛細管陣列是片段分析儀系統(tǒng)的基礎(chǔ)。填充凝膠后，首次進樣施加電壓，然后將DNA 和 RNA 樣品根據(jù)其分子量大小通過各個毛細管實現(xiàn)分離。當(dāng)片段通過檢測窗口時，高靈敏度電荷耦合檢測器 (CCD) 采集片段的分子量和濃度信息，然后在 ProSize 數(shù)據(jù)分析軟件中顯示。毛細管陣列有三個規(guī)格：12陣列（長度為22cm，33cm和55cm），48陣列（33cm）和96陣列（33cm和55cm）。?

檢測參數(shù)：

●?樣本操作軟件：Fragment Analyzer controller software

●?數(shù)據(jù)分析軟件：ProSize

●?通量：最高96*3

●?分辨率：最高3bp

●?DNA最長分辨率：60kb

●?DNA分析靈敏度：LOD 5pg/μl

●??RNA最長分辨率：10000nt

●?RNA分析靈敏度：LOD 50pg/μl

●??上樣量：1-2μl

●??資質(zhì)：IQ/OQ

優(yōu)勢：

●通量靈活可變：可根據(jù)需求選擇合適的陣列， 12、48 或 96 根毛細管。

●通用性強：同時設(shè)置兩種不同的凝膠，可自動分離完全不同的樣品類型

●高分辨率和高靈敏度：皮克級別的核酸檢測靈敏度，300bp以內(nèi)可分辨3bp

●針對不同應(yīng)用配有相應(yīng)的試劑盒：NGS、PCR、cfDNA，mRNA，小RNA等眾多應(yīng)用都可以提供準(zhǔn)確的核酸評估方案以確保獲得出色性能。

●自動化程度高，可做到無人值守

結(jié)果展示：

樣本質(zhì)控參數(shù)：

片段化分析儀和安捷倫經(jīng)典的2100生物分析儀一樣，提供數(shù)值化評估樣本質(zhì)量的指標(biāo)。

●RQN = RNA Quality Number – RNA質(zhì)量參數(shù)，與RIN值相似, 算法會有所差異。相關(guān)性測試表現(xiàn)出RQN和RIN值一致性。

●GQN = Genomic Quality Number – 基因組質(zhì)量參數(shù)，用戶可以設(shè)置片段大小閾值，以評估特 定樣品類型的質(zhì)量。測量計算超過閾值的DNA量。與DIN值算法不同。

●DQN = DNA Quality Number – DNA質(zhì)量參數(shù)，與GQN類似，僅針對有Upper和Lower markers的試劑盒。

●DV200 = Deviation Number 200 – 由Illumina開發(fā)用于評估FFPE RNA樣本質(zhì)量。測量計算超出閾值的RNA量

?

應(yīng)用：

●NGS文庫構(gòu)建流程質(zhì)控:可用于檢測樣本DNA 和RNA 完整性質(zhì)控，核酸樣本片段化，接頭連接以及最終文庫的質(zhì)控。

●mRNA疫苗與藥物開發(fā)流程質(zhì)控：?可用于模板DNA，體外轉(zhuǎn)錄RNA 等質(zhì)控

●檢測宿主細胞殘留DNA（HCD）

●用于分子育種領(lǐng)域（SSR, Tilling）

●用于三代測序質(zhì)控與長片段分析

●微量（低至飛克級）核酸樣本分析

配套產(chǎn)品試劑耗材列表

Reference：

1.?https://www.agilent.com.cn/zh-cn/product/automated-electrophoresis/fragment-analyzer-systems/fragment-analyzer-systems

2、《Brochure-reliable-nucleic-acid-sample-analysis-fragment-analyzer》5994-0414ZHCN

更多精彩，請咨詢“優(yōu)寧維分子生物”公眾號