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MS軟件模塊翻譯-GULP幾何優(yōu)化任務(wù)

2023-06-11 10:16 作者:邱新龍分子模擬小破屋  | 我要投稿



GULP幾何優(yōu)化任務(wù)允許您優(yōu)化你使用的幾何結(jié)構(gòu),以獲得穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)或多晶型。這是通過(guò)執(zhí)行迭代過(guò)程來(lái)實(shí)現(xiàn)的,在迭代過(guò)程中調(diào)整原子的坐標(biāo)和可能的單元參數(shù),從而使結(jié)構(gòu)的總能量最小化。

GULP幾何優(yōu)化是基于減少計(jì)算的力和應(yīng)力的大小,直到它們變得小于定義的收斂公差。也可以指定一個(gè)外部應(yīng)力張量來(lái)模擬體系在拉伸、壓縮、剪切等條件下的行為。在這些情況下,內(nèi)部應(yīng)力張量被迭代,直到它變得等于施加的外部應(yīng)力。

GULP中的幾何優(yōu)化可以在恒定體積或恒定外部壓力下通過(guò)選擇合適的系綜進(jìn)行。當(dāng)進(jìn)行幾何優(yōu)化時(shí),體系的各種電子和結(jié)構(gòu)性質(zhì),包括晶格性質(zhì)、聲子頻率、靜勢(shì)能和電場(chǎng)梯度,都可以作為運(yùn)行的一部分進(jìn)行計(jì)算。


1.1.4.1執(zhí)行幾何圖形優(yōu)化計(jì)算

1.從預(yù)先存在的文件中導(dǎo)入結(jié)構(gòu),或者使用MS的建模界面構(gòu)建晶體、表面和單壁納米管等新的3D周期體系。

2.從菜單欄中選擇Modules | GULP | Calculation(模塊|GULP |計(jì)算)以顯示GULP Calculation對(duì)話框。

3.如果您希望生成一個(gè)新的或擬合的力場(chǎng)用于計(jì)算,則應(yīng)在繼續(xù)下一步之前進(jìn)行力場(chǎng)擬合。

4.選擇GULP計(jì)算對(duì)話框上的設(shè)置選項(xiàng)卡,然后從任務(wù)下拉列表中選擇幾何優(yōu)化。




5.從力場(chǎng)下拉列表中選擇要用于計(jì)算的合適力場(chǎng)庫(kù)。如果要檢查力場(chǎng)庫(kù)中參數(shù)化的勢(shì),請(qǐng)單擊“查看…”...

按鈕顯示所選力場(chǎng)庫(kù)中的勢(shì)能列表。如果要從當(dāng)前項(xiàng)目或本地和網(wǎng)絡(luò)位置導(dǎo)入力場(chǎng)庫(kù),請(qǐng)選擇“瀏覽…”...

從“力場(chǎng)”下拉列表中,顯示“選擇GULP力場(chǎng)”對(duì)話框,然后導(dǎo)航到并選擇所需的GULP力字段庫(kù)文件(.lib)。

6.如果您希望自定義任何作業(yè)設(shè)置,請(qǐng)單擊“更多…”...按鈕,以顯示GULP幾何優(yōu)化對(duì)話框并相應(yīng)地更改參數(shù)。

注意:“GULP幾何圖形優(yōu)化”對(duì)話框僅包含用于三維周期體系的選項(xiàng)。

7.選擇“性質(zhì)”選項(xiàng)卡。如果希望在GULP運(yùn)行過(guò)程中計(jì)算體系的任何其他性質(zhì),請(qǐng)選中列表中的相應(yīng)復(fù)選框。




8.選擇作業(yè)控制選項(xiàng)卡,然后從網(wǎng)關(guān)位置下拉列表中選擇要在其上運(yùn)行GULP作業(yè)的服務(wù)器。如有必要,請(qǐng)指定作業(yè)將提交到的隊(duì)列。GULP將根據(jù)包含正在研究的體系的3D結(jié)構(gòu)文檔的名稱自動(dòng)為作業(yè)指定一個(gè)名稱。如果要指定替代名稱,請(qǐng)取消選中“自動(dòng)”復(fù)選框,然后在“作業(yè)任務(wù)”文本框中輸入新名稱。

9.在“并行運(yùn)行”字段中指定要在其上運(yùn)行作業(yè)的內(nèi)核數(shù)。

10.點(diǎn)擊更多...按鈕顯示GULP作業(yè)控制選項(xiàng)對(duì)話框。選擇要用于實(shí)時(shí)更新的文檔,并設(shè)置GULP在作業(yè)完成時(shí)的行為。

11.單擊Run(運(yùn)行)按鈕。

12.如果您愿意,您可以檢查中間結(jié)果,以確保計(jì)算參數(shù)是合理的。

13.作業(yè)完成后,查看輸出文件。然后您可以分析結(jié)果。


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