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百萬探針,極速交付,迪贏生物助力探針捕獲法tNGS病原檢測

2023-08-16 15:07 作者:上海迪贏生物  | 我要投稿



病原微生物是指可以侵犯人體,引起感染甚至傳染病的微生物,或稱病原體。常見的病原檢測技術(shù)包括菌液培養(yǎng)、血清免疫學(xué)檢測、分子生物學(xué)檢測和高通量測序。2020年新冠疫情肆虐全球,NGS檢測方法在新冠病毒的基因組序列解析過程中發(fā)揮了重大作用,同時也極大推動了NGS在病原檢測應(yīng)用的快速進(jìn)展。根據(jù)檢測技術(shù)路線不同,用于病原檢測的NGS包括宏基因組二代測序(mNGS)以及靶向測序(tNGS)。


宏基因組二代測序(mNGS)檢測


宏基因組二代測序(Metagenomics Next Generation Sequencing,mNGS)是借助二代測序平臺,提取感染樣本的核酸進(jìn)行高通量測序,可以無偏倚的檢測到樣本中的所有病原體。


mNGS檢測技術(shù)較其他檢測來說,具有無偏倚性,廣覆蓋、高準(zhǔn)確性等優(yōu)點(diǎn),同時也可以發(fā)現(xiàn)新發(fā)性的感染。但是因?yàn)闃颖局腥嗽凑急忍?,會影響病原檢出,報(bào)告解讀難和檢測費(fèi)用高也是mNGS在臨床應(yīng)用中的難題。


靶向測序(tNGS)檢測


根據(jù)靶向富集方法的不同,tNGS檢測方法包括超多重PCR和液相探針捕獲兩種技術(shù)路線。


基于多重PCR富集的靶向測序tNGS


基于超多重PCR的靶向測序技術(shù),是將PCR技術(shù)與二代測序技術(shù)相結(jié)合,通過設(shè)計(jì)的病原多重引物正向富集目標(biāo)序列,進(jìn)行二代測序檢測。與mNGS檢測方法相比,通過多重PCR靶向富集病原,具有準(zhǔn)確性高、性價比高等特點(diǎn)。聚焦目標(biāo)病原也使得報(bào)告解讀變得簡單。


多重PCR富集靶向測序流程圖


基于探針捕獲的靶向測序tNGS


液相探針雜交捕獲技術(shù)是根據(jù)核酸分子堿基互補(bǔ)雜交原理,設(shè)計(jì)分子探針。探針帶有生物素修飾,當(dāng)探針與目標(biāo)區(qū)域雜交結(jié)合后,通過鏈霉親和素磁珠將探針吸附,從而將目標(biāo)區(qū)域捕獲。設(shè)計(jì)的捕獲探針不存在干擾問題,因此不會限制目標(biāo)病原的種類。


該技術(shù)很好地解決了mNGS和基于多重PCR的tNGS技術(shù)的問題;使用探針捕獲,病原靶標(biāo)沒有限制,達(dá)到廣覆蓋;靶向富集病原序列,可以去除人源干擾,實(shí)現(xiàn)高靈敏度。目前市場上多家企業(yè)已發(fā)布了基于探針捕獲的病原檢測產(chǎn)品。


探針捕獲靶向測序流程圖


百萬探針,極速交付


探針是實(shí)現(xiàn)液相雜交捕獲技術(shù)檢測病原的核心,要實(shí)現(xiàn)病原種類的廣覆蓋意味著需要合成大量探針,甚至上百萬條。傳統(tǒng)的核酸合成采用柱式單條獨(dú)立合成,通量受限導(dǎo)致合成周期較長,同時單條合成成本較高也會導(dǎo)致檢測成本的增加。


迪贏生物基于自主研發(fā)的高通量合成平臺,單張芯片上可合成多至150萬條、長至230nt的寡核苷酸序列,百萬條探針可實(shí)現(xiàn)一周極速交付,助力感染性病原精準(zhǔn)診療。



· 一周極速交付

· 低成本

· 單次合成通量150萬條


迪贏平臺合成探針捕獲法panel檢測效果。以肺炎克雷伯菌為例驗(yàn)證探針捕獲富集效果,結(jié)果顯示靶向捕獲方法中目標(biāo)序列豐度是mNGS檢測約23倍。



全面助力病原微生物精準(zhǔn)檢測


mNGS,超多重PCR法tNGS,探針捕獲法tNGS三種技術(shù)路線各有優(yōu)勢,互為補(bǔ)充,適合病原檢測不同的應(yīng)用場景和檢測需求。除提供探針定制, 迪贏生物也可提供超多重檢測及mNGS檢測相關(guān)工具,全面助力病原微生物精準(zhǔn)檢測。

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